Maliit na RNA

Ang mga maliliit na RNA ay mga maikling non-coding RNA na may average na haba ng 18-30 nt, kabilang ang miRNA, siRNA at pIRNA, na naglalaro ng mga mahahalagang papel sa mga proseso ng regulasyon. Ang pipeline ng BMKCloud sRNA ay nagbibigay ng parehong pamantayan at pasadyang pagsusuri para sa pagkakakilanlan ng miRNA. Matapos basahin ang kontrol ng pag -trim at kalidad, ang mga nabasa ay nakahanay laban sa maraming mga database upang maiuri ang mga sRNA at piliin ang mga miRNA at na -mapa sa sanggunian na genome. Ang mga miRNA ay nakilala batay sa kilalang mga database ng miRNA, na nagbibigay ng impormasyon sa pangalawang istraktura, pamilya ng miRNA at target na mga gene. Ang pagkakaiba -iba ng pagtatasa ng expression ay kinikilala ang kaugalian na ipinahayag na mga miRNA at ang kaukulang mga target na gen ay functionally na -annotate upang makahanap ng mga kategorya na enriched.