Nanopore-based na buong-haba na transcriptome na pagkakasunud-sunod
Ang pagkakasunud -sunod ng Nanopore ay nakikilala ang sarili mula sa iba pang mga platform ng pagkakasunud -sunod, na ang mga nucleotides ay binabasa nang direkta nang walang synthesis ng DNA at bumubuo ng mahabang pagbabasa sa sampu -sampung mga kilobases. Ito ay nagbibigay kapangyarihan sa direktang pagbabasa ng buong-haba na mga transkrip at pagharap sa mga hamon sa mga pag-aaral ng transcriptomic.
√ mababang bias na tiyak na pagkakasunud-sunod
√ buong-haba na pagbabasa ng cDNA sa para sa mga pag-aaral ng istraktura ng gene
√ Mas kaunting data na kinakailangan upang masakop ang parehong bilang ng mga transkrip
√ Pagkilala ng maraming isoform bawat gene
√ expression quantification sa isoform-level
Karaniwang pipeline ng bioinformatics
Pinakabagong matagumpay na mga kaso na may mga teknolohiyang biomarker
1. Paghahambing na Pag-aaral ng Buong-Haba ng Transcriptome ay nagbubunyag ng Gnetum Luofuense Stem Developmental Dynamics
Journal: Mga Frontier sa Genetics
Nai -publish: Mar. 2021
Mga keyword: minion | Alternatibong Paghahati | APA | lncRNA | Naiiba ang ipinahayag na mga transkrip
Basahin ang full-text
Ib
Journal: Mga halaman sa kalikasan
Nai -publish: Enero 2021
Mga keyword: Nanopore | Illumina | Buong-haba na deteksyon ng mobile mRNA
3. Buong-haba na transcriptome analysis ng asparagus Roots ay nagpapakita ng molekular na mekanismo ng tolerance ng asin na sapilitan ng arbuscular mycorrhizal fungi
Journal: Kapaligiran at Eksperimentong Botani
Nai -publish: Enero 2021
Mga keyword: minion | Naiiba ang ipinahayag na mga transkrip | Mga salik sa transkripsyon | Alternatibong paghahati
4. Mga Pagbabago ng Katangian ng Physiological at Buong-Haba ng Transcriptome ng Rose (Rosa Chinensis) Mga Roots at Dahon Bilang Tugon sa Drought Stress
Journal: Plant at Cell Physiology
Nai -publish: Oktubre 2020
Mga keyword: Promethion | Naiiba ang ipinahayag na mga transkrip | Functional Prediction | Spliced isoforms | Tf at lncRNA
5. Pagtatasa at komprehensibong paghahambing ng PacBio at nanopore na batay sa RNA na pagkakasunud-sunod ng Arabidopsis transcriptome
Journal: Paraan ng halaman
Nai -publish: Abril 2020
Mga keyword: Gridion | Promethion | PacBio Sequel | Illumina Novaseq | Pag -align ng Genome | Pagkilala sa Transcript | Alternatibong Paghahati | SSR | LncRNA | Isoform quantification
Balita at mga highlight naglalayong ibahagi ang pinakabagong matagumpay na mga kaso sa mga teknolohiya ng biomarker, pagkuha ng nobelang mga nakamit na pang -agham pati na rin ang mga kilalang pamamaraan na inilalapat sa pag -aaral.
Oras ng Mag-post: Jan-08-2022