Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Balita

Genome

Kalikasan_Communications_Logo

Chromosome-scale Assembly at Pagsusuri ng Biomass Crop Miscanthus Lutarioriparius Genome

Pagkakasunud -sunod ng nanopore | Illumina | Hi-c | RNA-Sequencing | Phylogeny

Sa pag-aaral na ito, ang mga teknolohiyang biomarker ay nagbigay ng teknikal na suporta sa pagkakasunud-sunod ng nanopore, pagpupulong ng gen ng nobo, Hi-C na tinulungan ng pagpupulong, atbp.

Abstract

Miscanthus, isang rhizomatous perennial plant, ay may malaking potensyal para sa paggawa ng bioenergy para sa mataas na biomass at pagpapaubaya ng stress. Iniuulat namin ang isang chromosome-scale Assembly ngMiscanthus LutarioripariusGenome sa pamamagitan ng pagsasama-sama ng Oxford nanopore na pagkakasunud-sunod at mga teknolohiya ng HI-C. Ang 2.07-GB Assembly ay sumasakop sa 96.64% ng genome, na may contig N50 ng 1.71 MB. Ang mga pagkakasunud -sunod ng centromere at telomere ay tipunin para sa lahat ng 19 chromosomes at chromosome 10, ayon sa pagkakabanggit. Ang allotetraploid na pinagmulan ng M. lutarioriparius ay kumpirmahin gamit ang mga pag -uulit ng satellite satellite. Ang istraktura ng tetraploid genome at ilang mga pag -aayos ng chromosomal na nauugnay sa sorghum ay malinaw na ipinakita. Tandem duplicate gen ngM. Lutarioripariusay functional enriched hindi lamang sa mga tuntunin na may kaugnayan sa tugon ng stress, ngunit ang cell wall biosynthesis. Ang mga pamilyang Gene na may kaugnayan sa paglaban sa sakit, biosynthesis ng cell wall at transportasyon ng metal ion ay lubos na pinalawak at nagbago. Ang pagpapalawak ng mga pamilyang ito ay maaaring isang mahalagang batayan ng genomic para sa pagpapahusay ng mga kamangha -manghang katangian ngM. Lutarioriparius.

Mga pangunahing istatistika ng pagpupulong ng genome

BALITA-1
BALITA-2

Figure. Pangkalahatang -ideya ng M. Lutarioriparius Genome Assembly

Balita at mga highlight naglalayong ibahagi ang pinakabagong matagumpay na mga kaso sa mga teknolohiya ng biomarker, pagkuha ng nobelang mga nakamit na pang -agham pati na rin ang mga kilalang pamamaraan na inilalapat sa pag -aaral.


Oras ng Mag-post: Jan-05-2022

Ipadala ang iyong mensahe sa amin: