Evolutionary Genetics

Nilalayon ng evolutionary genetic studies na maunawaan ang evolutionary trajectory ng mga populasyon gamit ang polymorphism information sa genomic sequence. Ang BMKCloud Evolutionary Genetics pipeline ay idinisenyo upang suriin ang data ng WGS o Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) mula sa malalaking populasyon. Pagkatapos ng kontrol sa kalidad ng raw data, ang mga nabasa ay nakahanay sa reference na genome at tinatawag ang mga variant. Kasama sa pipeline ang phylogenetic tree construction, principal component analysis (PCA), population structure analysis, linkage disequilibrium (LD), selective sweep analysis, at candidate gene analysis.