Eukaryotic mRNA Sequencing-NGS
Mga tampok
● Pagkuha ng poly mRNA bago ang paghahanda ng aklatan
● Opsyonal na Paghahanda ng Library ng Direksyon ng Library upang Paganahin ang Pagkuha ng Strand-Specific Sequencing Data
● Pagsusuri ng Bioinformatic ng expression ng gene at istraktura ng transcript
Kalamangan
●Malawak na kadalubhasaan: Ang aming koponan ay nagpoproseso ng higit sa 600,000 mga sample sa bmkgene, na sumasaklaw sa magkakaibang mga uri ng sample tulad ng mga kultura ng cell, tisyu, at likido sa katawan. Nagdadala kami ng isang kayamanan ng karanasan sa bawat proyekto at matagumpay na nakumpleto ang higit sa 100,000 mga proyekto ng mRNA-seq sa iba't ibang mga domain ng pananaliksik.
●Mahigpit na kontrol ng kalidad: Nagpapatupad kami ng mga pangunahing control point sa lahat ng mga yugto, mula sa paghahanda ng sample at library hanggang sa pagkakasunud -sunod at bioinformatics. Tinitiyak ng masusing pagsubaybay na ito ang paghahatid ng patuloy na de-kalidad na mga resulta, na tinitiyak sa iyo na ang iyong proyekto ay nasa maaasahang mga kamay.
●Komprehensibong anotasyon: Gumagamit kami ng maraming mga database upang gumana na i -annotate ang kaugalian na ipinahayag na mga gen (degs) at magsagawa ng kaukulang mga pagsusuri sa pagpapayaman. Ang komprehensibong diskarte na ito ay nagbibigay ng mga pananaw sa mga proseso ng cellular at molekular na pinagbabatayan ng tugon ng transcriptome, tinitiyak na lubos kang alam tungkol sa mga resulta ng iyong proyekto.
●Suporta sa Post-Sales: Ang aming pangako ay lampas sa pagkumpleto ng proyekto na may 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-aayos, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na may kaugnayan sa mga resulta.
Halimbawang mga kinakailangan at paghahatid
| Library | Diskarte sa pagkakasunud -sunod | Inirerekomenda ang data | KONTROL CONTROL |
| Poly isang enriched | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Mga kinakailangan sa halimbawang:
Nucleotides:
| Conc. (Ng/μl) | Halaga (μg) | Kadalisayan | Integridad | |
| Standard Library | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limitado o walang kontaminasyon ng protina o DNA na ipinapakita sa gel. | Para sa mga halaman: RIN≥4.0; Para sa mga hayop: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang elevation ng baseline |
| Direksyon ng Library | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limitado o walang kontaminasyon ng protina o DNA na ipinapakita sa gel. | Para sa mga halaman: RIN≥4.0; Para sa mga hayop: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang elevation ng baseline |
● Halaman:
Ugat, stem o petal: 450 mg
Dahon o binhi: 300 mg
Prutas: 1.2 g
●Hayop:
Puso o bituka: 300 mg
Viscera o utak: 240 mg
Kalamnan: 450 mg
Mga buto, buhok o balat: 1g
● Mga Arthropod:
Mga Insekto: 6g
Crustacea: 300 mg
● Buong dugo: 1 tubo
● Mga cell: 106 mga cell
Inirerekumendang paghahatid ng sample
Lalagyan: 2 ml centrifuge tube (tin foil ay hindi inirerekomenda)
Halimbawang label: pangkat+magtiklop ng EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Kargamento:
1. Dry-Ice: Ang mga sample ay kailangang maimpake sa mga bag at inilibing sa dry-ice.
2. RNAS TABLE TUBES: Ang mga sample ng RNA ay maaaring matuyo sa RNA stabilization tube (EG RNastable®) at ipinadala sa temperatura ng silid.
Daloy ng trabaho sa serbisyo
Disenyo ng eksperimento
Halimbawang paghahatid
Pagkuha ng RNA
Konstruksyon ng Library
Pagkakasunud -sunod
Pagtatasa ng data
Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta
Bioinformatics
Eukaryotic Ang pag -agos ng pagkakasunud -sunod ng mRNA
Bioinformatics
ØRaw Data Kalidad ng Kalidad
ØPag -align ng Genome ng Sanggunian
ØPagsusuri ng istraktura ng transcript
ØAng dami ng expression
ØPag -aaral ng expression ng pagkakaiba -iba
ØPag -andar ng pag -andar at pagpapayaman
Pag -align ng Genome ng Sanggunian
Saturation ng data
Halimbawang ugnayan at pagtatasa ng mga biological replicates
Naiiba ang ipinahayag na mga gen (degs)
Functional annotation ng degs
Functional na pagpapayaman ng DEGS
Galugarin ang mga pagsulong na pinadali ng eukaryotic NGS na mga serbisyo ng pagkakasunud -sunod ng mRNA ng BMKGENE sa pamamagitan ng isang curated na koleksyon ng mga pahayagan.
Huang, L. et al. . 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ et al. . doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. . 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. et al. .
Zhang, Yujie et al. . 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
