DNBSEQ pre-made na mga aklatan
Mga tampok
●Platform:MGI-DNBSEQ-T7
●Mga mode ng pagkakasunud-sunod:PE150
●Paglipat ng mga aklatan ng Illumina saMGI:pagpapagana ng pagkakasunud-sunod ng mataas na dami ng data sa mababang halaga.
●Kontrol sa kalidad ng mga aklatan bago ang pagkakasunud-sunod.
●Pagsusunod-sunod ng data QC at paghahatid:paghahatid ng QC report at raw data sa fastq na format pagkatapos ng demultiplexing at pag-filter ng Q30 reads.
Mga kalamangan
●Kakayahan ng mga serbisyo ng Sequencing:maaaring piliin ng customer na mag-sequence ayon sa lane o dami ng data.
●Mataas na output ng data:1500 Gb/lane
●Paghahatid ng sequencing na ulat ng QC:na may mga sukatan ng kalidad, katumpakan ng data at pangkalahatang pagganap ng sequencing project.
●Mature sequencing na proseso:na may maikling turn-around time.
●Mahigpit na Kontrol sa Kalidad: nagpapatupad kami ng mahigpit na mga kinakailangan sa QC upang magarantiya ang paghahatid ng patuloy na mataas na kalidad na mga resulta.
Mga Sample na Kinakailangan
| Dami ng Data (X) | Konsentrasyon (qPCR/nM) | Dami | |
| Bahagyang Lane
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Single Lane | Bawat Lane | ≥ 1.5 nM / Library pool | ≥ 25 μl / Library pool |
Bilang karagdagan sa konsentrasyon at kabuuang halaga, kinakailangan din ang angkop na peak pattern.
Tandaan: Ang pagkakasunud-sunod ng linya ng mga library na mababa ang pagkakaiba-iba ay nangangailangan ng PhiX spike-in upang matiyak ang matatag na base calling.
Inirerekomenda namin ang pagsusumite ng mga pre-pooled na library bilang mga sample. Kung kailangan mo ng BMKGENE na magsagawa ng library pooling, mangyaring sumangguni sa
mga kinakailangan sa library para sa partial lane sequencing.
Sukat ng Library (Peak na mapa)
Ang pangunahing peak ay dapat nasa loob ng 300-450 bp.
Ang mga aklatan ay dapat magkaroon ng isang pangunahing peak, walang kontaminasyon ng adaptor at walang mga primer na dimer.
Daloy ng Trabaho ng Serbisyo
Ulat sa QC ng library
Ang isang ulat sa kalidad ng aklatan ay ibinibigay bago ang pagkakasunud-sunod, pagtatasa ng halaga ng aklatan, at pagkakapira-piraso.
Pagsusunod-sunod ng ulat ng QC
Talahanayan 1. Mga istatistika sa sequencing data.
| Sample ID | BMKID | Mga hilaw na nabasa | Raw Data (bp) | Malinis na nabasa (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figure 1. Pamamahagi ng kalidad kasama ang mga nabasa sa bawat sample
Larawan 2. Batayang pamamahagi ng nilalaman
Figure 3. Distribusyon ng mga binasang nilalaman sa sequencing data
