Platform | Laki ng Library | Teoretikal na ani ng data (bawat cell) | Ang katumpakan ng solong-base | Mga Aplikasyon |
Nanopore | 8kB, 10KB, 20KB, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90GB/Cell | 85-92% | Ang pagtawag sa SV, de novo, buong-haba na pagkakasunud-sunod, ISO-seq, annotation ng gene, pagtuklas ng DNA methylation |
● Mahigit sa 5 taong karanasan sa PacBio Sequencing Platform na may libu -libong mga saradong proyekto na may iba't ibang mga species.
● Ang BMKGENE ay isang opisyal na kasosyo ng Oxford Nanopore, na may dual platform RNA/DNA Certification.
● May mga pangunahing modelo ng mga sequencer na may kumpletong kagamitan at sapat na pagkakasunud -sunod na throughput.
● Batay sa platform ng Nanopore, higit sa 10 mga pananaliksik ng hayop at halaman na Denovo ay nai -publish sa mga internasyonal na mga journal.
Halimbawang uri | Halaga | Concentrtion (qubit ®) | Dami | Kadalisayan | Iba |
Genomic DNA | Nakasalalay sa kinakailangan ng data | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230≥1.5 ; Malinaw na rurok sa 260 nm , walang mga kontaminasyon | Ang konsentrasyon ay kailangang masukat ng qubit at qubit/nanopore ≤ 2 |
Kabuuang RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5 ; Walang mga kontaminasyon | Halaga ng RIN ≥7.5 |
Pagtatasa ng kalidad ng data ng sample ng DNA
Talahanayan 1. Mga istatistika sa malinis na data.
BMKID | rawseqnum | Rawsumbase | Cleanseqnum | Cleansumbase | Clean50len | Clean90len | Cleanmeanlen | CleanMaxlen | CleanMeanqual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Pagtatasa ng kalidad ng data ng sample ng RNA
Talahanayan 1. Mga istatistika sa malinis na data.
Filename | ClientId | Readnum | Basenum | N50 | MeanLength | MAXLENGTH | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Larawan 1. Basahin ang pamamahagi ng haba
Larawan 2. Pamamahagi ng kalidad ng marka ng malinis na data
Larawan 3. Haba at kalidad ng pamamahagi ng marka ng malinis na data