Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Mga produkto

Illumina pre-made na mga aklatan

Ang teknolohiya ng pagkakasunud-sunod ng Illumina, batay sa Sequencing by Synthesis (SBS), ay isang globally embraced NGS innovation, na responsable para sa pagbuo ng higit sa 90% ng sequencing data sa mundo. Ang prinsipyo ng SBS ay nagsasangkot ng imaging fluorescently na may label na reversible terminator habang ang bawat dNTP ay idinagdag, at pagkatapos ay pinuputol upang payagan ang pagsasama ng susunod na base. Sa lahat ng apat na reversible terminator-bound dNTPs na naroroon sa bawat sequencing cycle, pinapaliit ng natural na kompetisyon ang bias sa pagsasama. Sinusuportahan ng maraming nalalamang teknolohiyang ito ang parehong single-read at paired-end na mga aklatan, na tumutugon sa isang hanay ng mga genomic na application. Ang mataas na throughput na mga kakayahan at katumpakan ng pagkakasunud-sunod ng Illumina ay ipinoposisyon ito bilang isang pundasyon sa pananaliksik ng genomics, na nagbibigay-kapangyarihan sa mga siyentipiko na lutasin ang mga salimuot ng mga genome na may walang kaparis na detalye at kahusayan.

Ang aming pre-made library sequencing service ay nagbibigay-daan sa mga customer na maghanda ng mga sequencing na library mula sa iba't ibang source (mRNA, whole genome, amplicon, 10x library, bukod sa iba pa). Kasunod nito, ang mga aklatang ito ay maaaring ipadala sa aming mga sequencing center para sa kontrol sa kalidad at pagkakasunud-sunod sa mga platform ng Illumina.


Mga Detalye ng Serbisyo

Resulta ng Demo

Mga tampok

Mga Platform:Illumina NovaSeq 6000 at NovaSeq X Plus

Mga mode ng pagkakasunud-sunod:PE150 at PE250

Kontrol sa kalidad ng mga aklatan bago ang pagkakasunud-sunod

Pagsusunod-sunod ng data QC at paghahatid:paghahatid ng QC report at raw data sa fastq na format pagkatapos ng demultiplexing at pag-filter ng Q30 reads

 

 

Mga Kalamangan sa Serbisyo

Kakayahan ng mga serbisyo ng Sequencing:maaaring piliin ng customer na mag-sequence ayon sa lane, flow cell, o sa dami ng kinakailangang data (partial lane sequencing).

Malawak na karanasan sa platform ng pagkakasunud-sunod ng Illumina:na may libu-libong saradong proyekto na may iba't ibang uri ng hayop. 

Paghahatid ng sequencing na ulat ng QC:na may mga sukatan ng kalidad, katumpakan ng data at pangkalahatang pagganap ng sequencing project.

Mature sequencing na proseso:na may maikling turn-around time.

Mahigpit na Kontrol sa Kalidad: nagpapatupad kami ng mahigpit na mga kinakailangan sa QC upang magarantiya ang paghahatid ng patuloy na mataas na kalidad na mga resulta.

 

 

Mga Sample na Platform

Plataporma

Daloy ng Cell

Sequencing mode

Yunit

Tinantyang output

NovaSeq X

10B (8 lane)

PE150

Single Lane

Bahagyang Lane

375Gb / Lane

25B ( 8 lane)

PE150

Single Lane

Bahagyang Lane

1000 Gb/Lane

NovaSeq 6000

SP Flow cell (2 lane)

PE250

Daloy ng Cell

Single Lane

Bahagyang Lane

325-400 M reads / Lane

S4 Flow cell (4 na lane)

PE150

Daloy ng Cell

Single Lane

Bahagyang Lane

~800 Gb / Lane

Mga Sample na Kinakailangan

 

Dami ng Data (X)

Konsentrasyon (qPCR/nM)

Dami

Partial Lane Sequencing

 

 

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 25 μl

Pagsusunod-sunod ng Lane

Bawat Lane

≥ 1.5 nM / Library pool

≥ 25 μl / Library pool

Bilang karagdagan sa konsentrasyon at kabuuang halaga, kinakailangan din ang angkop na peak pattern.

Tandaan: Ang pagkakasunud-sunod ng linya ng mga library na mababa ang pagkakaiba-iba ay nangangailangan ng PhiX spike-in upang matiyak ang matatag na base calling.

Inirerekomenda namin ang pagsusumite ng mga pre-pooled na library bilang mga sample. Kung kailangan mo ng BMKGENE na magsagawa ng library pooling, mangyaring sumangguni sa

ang mga kinakailangan sa library para sa partial lane sequencing.

Sukat ng Library (Peak na mapa)

Ang pangunahing peak ay dapat nasa loob ng 300-450 bp.
Ang mga aklatan ay dapat magkaroon ng isang pangunahing peak, walang kontaminasyon ng adaptor at walang mga primer na dimer.

Mangyaring makipag-ugnayan sa amin kung ang iyong mga sample ay hindi nakakatugon sa panimulang materyal na kinakailangan.

Daloy ng Trabaho ng Serbisyo

paghahanda ng sample

Kontrol sa kalidad ng library

Pagsusunod-sunod

Pagsusunod-sunod

Pagsusuri ng datos

Kontrol sa kalidad ng data

Sample QC

Paghahatid ng proyekto


  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • Ulat sa QC ng library

    Ang isang ulat sa kalidad ng aklatan ay ibinibigay bago ang pagkakasunud-sunod, pagtatasa ng halaga ng aklatan, at pagkakapira-piraso.

     

    Pagsusunod-sunod ng ulat ng QC

     

    Talahanayan 1. Mga istatistika sa sequencing data.

    Sample ID

    BMKID

    Mga hilaw na nabasa

    Raw Data (bp)

    Malinis na nabasa (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Figure 1. Pamamahagi ng kalidad kasama ang mga nabasa sa bawat sample

    A9

    Larawan 2. Batayang pamamahagi ng nilalaman

    A10

    Figure 3. Distribusyon ng mga binasang nilalaman sa sequencing data

    A11

     

    kumuha ng quote

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: