ลำดับการถอดเสียงทั้งหมด - อิลลูมินา
คุณสมบัติ
● ไลบรารีคู่เพื่อจัดลำดับทรานสคริปโตมที่สมบูรณ์: การพร่อง rRNA ตามด้วยการเตรียมไลบรารี PE150 และการเลือกขนาด ตามด้วยการเตรียมไลบรารี SE50
● การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศที่สมบูรณ์ของ mRNA, lncRNA, circRNA และ miRNA ในรายงานชีวสารสนเทศศาสตร์ที่แยกจากกัน
● การวิเคราะห์ร่วมของการแสดงออก RNA ทั้งหมดในรายงานแบบรวม รวมถึงการวิเคราะห์เครือข่าย ceRNA
ข้อดีของการบริการ
การวิเคราะห์เชิงลึกของเครือข่ายการกำกับดูแล: การวิเคราะห์เครือข่าย ceRNA เปิดใช้งานได้โดยการจัดลำดับร่วมของ mRNA, lncRNA, circRNA และ miRNA และโดยขั้นตอนการทำงานทางชีวสารสนเทศที่ละเอียดถี่ถ้วน
คำอธิบายประกอบที่ครอบคลุม: เราใช้ฐานข้อมูลหลายฐานข้อมูลเพื่ออธิบายประกอบยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (DEG) และดำเนินการวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าที่สอดคล้องกัน โดยให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกระบวนการระดับเซลล์และโมเลกุลที่เป็นรากฐานของการตอบสนองของการถอดเสียง
ความเชี่ยวชาญที่กว้างขวาง: ด้วยประวัติความสำเร็จในการปิดโครงการถอดเสียงทั้งหมดกว่า 2,100 โครงการในขอบเขตการวิจัยต่างๆ ทีมงานของเรานำประสบการณ์มากมายมาสู่ทุกโครงการ
การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวด: เราใช้จุดควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่างและห้องสมุด ไปจนถึงการจัดลำดับและชีวสารสนเทศศาสตร์ การตรวจสอบอย่างพิถีพิถันนี้ช่วยให้มั่นใจได้ถึงผลลัพธ์คุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
การสนับสนุนหลังการขาย: ความมุ่งมั่นของเราขยายไปไกลกว่าการเสร็จสิ้นโครงการด้วยระยะเวลาบริการหลังการขาย 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราเสนอการติดตามผลโครงการ ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และเซสชันถามและตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใด ๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ข้อกำหนดตัวอย่างและการจัดส่ง
| ห้องสมุด | กลยุทธ์การจัดลำดับ | ข้อมูลที่แนะนำ | การควบคุมคุณภาพ |
| rRNA หมดลง | อิลลูมิน่า พีอี150 | 16 กิกะไบต์ | Q30≥85% |
| เลือกขนาดแล้ว | อิลลูมินา SE50 | อ่าน 10-20M |
ข้อกำหนดตัวอย่าง:
นิวคลีโอไทด์:
| ความเข้มข้น(ng/μl) | ปริมาณ (ไมโครกรัม) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 โอดี260/230=0.5-2.5 มีการปนเปื้อนของโปรตีนหรือ DNA อย่างจำกัดหรือไม่มีเลยบนเจล | ริน≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; ระดับความสูงพื้นฐานที่จำกัดหรือไม่มีเลย |
การจัดส่งตัวอย่างที่แนะนำ
ภาชนะบรรจุ: หลอดหมุนเหวี่ยงขนาด 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้ฟอยล์ดีบุก)
การติดฉลากตัวอย่าง: กลุ่ม+ทำซ้ำ เช่น A1, A2, A3; บี1 บี2 บี3
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างจะต้องบรรจุในถุงและฝังในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอด RNAstable: ตัวอย่าง RNA สามารถทำให้แห้งในหลอดรักษาเสถียรภาพ RNA (เช่น RNAstable®) และจัดส่งที่อุณหภูมิห้อง
ขั้นตอนการทำงานบริการ
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัดอาร์เอ็นเอ
การก่อสร้างห้องสมุด
การเรียงลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศศาสตร์
ภาพรวมการแสดงออกของ RNA
ยีนที่แสดงออกอย่างแตกต่าง
การวิเคราะห์ซีอาร์เอ็นเอ
miRNA ที่แสดงออกมาแตกต่างกันและ RNA ที่เกี่ยวข้อง
สำรวจความก้าวหน้าทางการวิจัยที่อำนวยความสะดวกโดยบริการจัดลำดับการถอดเสียงทั้งหมดของ BMKGene ผ่านคอลเลคชันสิ่งพิมพ์ที่คัดสรรมาอย่างดี
Dai, Y. และคณะ (2022) 'โปรไฟล์การแสดงออกที่ครอบคลุมของ mRNAs, lncRNAs และ miRNAs ในโรค Kashin-Beck ที่ระบุโดยลำดับ RNA', Molecular Omics, 18(2), หน้า 154–166 ดอย: 10.1039/D1MO00370D.
หลิว น. น่าน และคณะ (2022) 'การวิเคราะห์ทรานสคริปต์โตมแบบเต็มความยาวของการต้านทานความเย็นของ Apis cerana ในภูเขาฉางไป๋ในช่วงฤดูหนาว', Gene, 830, หน้า 146503–146503 ดอย: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
วัง XJ และคณะ (2022) 'การจัดลำดับความสำคัญตามการบูรณาการหลาย Omics ของเครือข่ายการควบคุม RNA ภายนอกที่แข่งขันกันในมะเร็งปอดในเซลล์ขนาดเล็ก: ลักษณะทางโมเลกุลและผู้สมัครยา', พรมแดนในด้านเนื้องอกวิทยา, 12, p. 904865. ดอย: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
ซู พี และคณะ (2022) 'การวิเคราะห์แบบบูรณาการของโปรไฟล์การแสดงออก lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA เผยให้เห็นข้อมูลเชิงลึกใหม่เกี่ยวกับกลไกที่เป็นไปได้ในการตอบสนองต่อไส้เดือนฝอยรากปมในถั่วลิสง', BMC Genomics, 23(1), หน้า 1–12 ดอย: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. และคณะ (2022) 'การจัดลำดับ RNA ทั้งหมดเน้นไปที่กลไกระดับโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับการรักษาคุณภาพหลังการเก็บเกี่ยวในบรอกโคลีโดยการฉายรังสี LED สีแดง', ชีววิทยาและเทคโนโลยีหลังการเก็บเกี่ยว, 188, p. 111878. ดอย: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
