ลิ้นชัก HeatMap ใช้สำหรับการวาดแผนที่ความร้อนซึ่งสามารถกรอง, ทำให้เป็นมาตรฐานและข้อมูลเมทริกซ์คลัสเตอร์ส่วนใหญ่ใช้สำหรับการวิเคราะห์คลัสเตอร์ของระดับการแสดงออกของยีนระหว่างตัวอย่างที่แตกต่างกัน
การแนบฟังก์ชั่นทางชีวภาพกับลำดับในไฟล์ fasta โดยจัดลำดับลำดับเข้ากับฐานข้อมูลรวมถึง NR, KEGG, COG, SwissProt, Trembl, Kog, PFAM
BLAST (เครื่องมือค้นหาการจัดตำแหน่งท้องถิ่นขั้นพื้นฐาน) เป็นอัลกอริทึมและโปรแกรมเพื่อค้นหาภูมิภาคที่มีลำดับทางชีวภาพที่คล้ายกัน มันเปรียบเทียบลำดับเหล่านี้กับฐานข้อมูลลำดับและคำนวณนัยสำคัญทางสถิติ BLAST ประกอบด้วยเครื่องมือสี่ประเภทตามประเภทลำดับ: Blastn, LastP, Blastx และ Tblastn