条形banner-03

สินค้า

  • การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม

    การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม

    จุดมุ่งหมายของการศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (GWAS) คือการระบุความแปรปรวนทางพันธุกรรม (จีโนไทป์) ที่เชื่อมโยงกับลักษณะเฉพาะ (ฟีโนไทป์) ด้วยการพิจารณาเครื่องหมายทางพันธุกรรมทั่วทั้งจีโนมในบุคคลจำนวนมาก GWAS จะคาดการณ์ความสัมพันธ์ของจีโนไทป์-ฟีโนไทป์ผ่านการวิเคราะห์ทางสถิติระดับประชากร วิธีการนี้พบการประยุกต์ใช้อย่างกว้างขวางในการวิจัยโรคของมนุษย์และสำรวจยีนเชิงหน้าที่ที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่ซับซ้อนในสัตว์หรือพืช

    ที่ BMKGENE เรามีทางเลือกสองทางสำหรับดำเนินการ GWAS กับประชากรจำนวนมาก ได้แก่ การใช้ Whole-Genome Sequencing (WGS) หรือการเลือกใช้วิธีจัดลำดับจีโนมแบบลดการแสดงแทน ซึ่งเป็นแบบเฉพาะเจาะจงที่พัฒนาขึ้นภายในองค์กร (SLAF) แม้ว่า WGS จะเหมาะกับจีโนมที่มีขนาดเล็กกว่า แต่ SLAF ก็กลายเป็นทางเลือกที่คุ้มค่าสำหรับการศึกษาประชากรขนาดใหญ่ที่มีจีโนมยาวกว่า ซึ่งช่วยลดต้นทุนในการเรียงลำดับได้อย่างมีประสิทธิภาพ ขณะเดียวกันก็รับประกันประสิทธิภาพในการค้นพบเครื่องหมายทางพันธุกรรมในระดับสูง

  • การจัดลำดับ RNA นิวเคลียสเดี่ยว

    การจัดลำดับ RNA นิวเคลียสเดี่ยว

    การพัฒนาเทคนิคการจับเซลล์เดี่ยวและการสร้างไลบรารีแบบกำหนดเอง ควบคู่ไปกับการจัดลำดับปริมาณงานสูง ได้ปฏิวัติการศึกษาการแสดงออกของยีนในระดับเซลล์ ความก้าวหน้าครั้งนี้ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ประชากรเซลล์ที่ซับซ้อนได้เชิงลึกและครอบคลุมมากขึ้น โดยเอาชนะข้อจำกัดที่เกี่ยวข้องกับการแสดงออกของยีนโดยเฉลี่ยในเซลล์ทั้งหมด และรักษาความหลากหลายที่แท้จริงภายในประชากรเหล่านี้ แม้ว่าการจัดลำดับ RNA เซลล์เดียว (scRNA-seq) มีข้อได้เปรียบที่ไม่อาจปฏิเสธได้ แต่ก็ต้องเผชิญกับความท้าทายในเนื้อเยื่อบางชนิดที่การสร้างสารแขวนลอยเซลล์เดียวพิสูจน์ได้ยากและต้องใช้ตัวอย่างที่สดใหม่ ที่ BMKGene เราจัดการกับอุปสรรคนี้ด้วยการนำเสนอลำดับ RNA แบบนิวเคลียสเดี่ยว (snRNA-seq) โดยใช้เทคโนโลยี 10X Genomics Chromium ที่ล้ำสมัย วิธีการนี้จะขยายสเปกตรัมของตัวอย่างที่สอดคล้องกับการวิเคราะห์การถอดเสียงในระดับเซลล์เดียว

    การแยกนิวเคลียสทำได้สำเร็จด้วยชิป 10X Genomics Chromium ที่เป็นนวัตกรรมใหม่ ซึ่งมีระบบไมโครฟลูอิดิกแบบ 8 ช่องทางพร้อมครอสซิ่งแบบคู่ ภายในระบบนี้ เม็ดเจลที่ประกอบด้วยบาร์โค้ด ไพรเมอร์ เอนไซม์ และนิวเคลียสเดี่ยวถูกห่อหุ้มด้วยหยดน้ำมันขนาดนาโนลิตร ทำให้เกิดเป็นเจลบีด-อิน-อิมัลชัน (GEM) หลังจากการก่อตัวของ GEM การสลายเซลล์และการปล่อยบาร์โค้ดจะเกิดขึ้นภายใน GEM แต่ละตัว ต่อจากนั้น โมเลกุล mRNA ได้รับการถอดรหัสแบบย้อนกลับไปเป็น cDNA โดยผสมผสานบาร์โค้ด 10X และตัวระบุโมเลกุลเฉพาะ (UMI) จากนั้น cDNA เหล่านี้จะอยู่ภายใต้การสร้างไลบรารีลำดับมาตรฐาน ซึ่งอำนวยความสะดวกในการสำรวจโปรไฟล์การแสดงออกของยีนในระดับเซลล์เดียวที่มีประสิทธิภาพและครอบคลุม

    แพลตฟอร์ม: 10× Genomics Chromium และ Illumina NovaSeq Platform

  • การจัดลำดับจีโนมทั้งพืช/สัตว์

    การจัดลำดับจีโนมทั้งพืช/สัตว์

    การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (WGS) หรือที่เรียกว่าการจัดลำดับใหม่ หมายถึงการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของบุคคลในสายพันธุ์ต่างๆ ที่มีจีโนมอ้างอิงที่ทราบ บนพื้นฐานนี้ สามารถระบุความแตกต่างทางจีโนมของแต่ละบุคคลหรือประชากรเพิ่มเติมได้ WGS ช่วยให้สามารถระบุ Single Nucleotide Polymorphism (SNP), การลบการแทรก (InDel), การแปรผันของโครงสร้าง (SV) และการเปลี่ยนแปลงหมายเลขสำเนา (CNV) SV ประกอบด้วยฐานการเปลี่ยนแปลงส่วนใหญ่มากกว่า SNP และมีผลกระทบต่อจีโนมมากกว่า ซึ่งส่งผลกระทบอย่างมากต่อสิ่งมีชีวิต แม้ว่าการจัดลำดับการอ่านซ้ำแบบสั้นจะมีประสิทธิภาพในการระบุ SNP และ InDels แต่การจัดลำดับการอ่านซ้ำแบบยาวช่วยให้ระบุชิ้นส่วนขนาดใหญ่และรูปแบบที่ซับซ้อนได้แม่นยำยิ่งขึ้น

  • 10x การถอดเสียงเชิงพื้นที่ของ Genomics Visium

    10x การถอดเสียงเชิงพื้นที่ของ Genomics Visium

    การถอดเสียงเชิงพื้นที่เป็นเทคโนโลยีล้ำสมัยที่ช่วยให้นักวิจัยสามารถตรวจสอบรูปแบบการแสดงออกของยีนภายในเนื้อเยื่อ ขณะเดียวกันก็รักษาบริบทเชิงพื้นที่ไว้ได้ แพลตฟอร์มอันทรงพลังแห่งหนึ่งในโดเมนนี้คือ 10x Genomics Visium ควบคู่กับการจัดลำดับอิลลูมินา หลักการของ 10X Visium นั้นอยู่บนชิปพิเศษที่มีพื้นที่จับที่กำหนดซึ่งวางส่วนของเนื้อเยื่อไว้ พื้นที่จับภาพนี้มีจุดบาร์โค้ด ซึ่งแต่ละจุดสอดคล้องกับตำแหน่งเชิงพื้นที่เฉพาะภายในเนื้อเยื่อ จากนั้นโมเลกุล RNA ที่ถูกจับจากเนื้อเยื่อจะถูกติดป้ายกำกับด้วยตัวระบุโมเลกุลเฉพาะ (UMI) ในระหว่างกระบวนการถอดรหัสแบบย้อนกลับ จุดบาร์โค้ดและ UMI เหล่านี้ช่วยให้สามารถจัดทำแผนที่เชิงพื้นที่และการหาปริมาณการแสดงออกของยีนได้อย่างแม่นยำด้วยความละเอียดเซลล์เดียว การผสมผสานระหว่างตัวอย่างบาร์โค้ดเชิงพื้นที่และ UMI ช่วยให้มั่นใจในความถูกต้องและความเฉพาะเจาะจงของข้อมูลที่สร้างขึ้น ด้วยการใช้เทคโนโลยี Spatial Transcriptomics นี้ นักวิจัยจะได้รับความเข้าใจที่ลึกซึ้งยิ่งขึ้นเกี่ยวกับการจัดระเบียบเชิงพื้นที่ของเซลล์และปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลที่ซับซ้อนที่เกิดขึ้นภายในเนื้อเยื่อ ซึ่งนำเสนอข้อมูลเชิงลึกอันล้ำค่าเกี่ยวกับกลไกที่เป็นรากฐานของกระบวนการทางชีวภาพในหลากหลายสาขา รวมถึงเนื้องอกวิทยา ประสาทวิทยาศาสตร์ ชีววิทยาพัฒนาการ และภูมิคุ้มกันวิทยา และการศึกษาทางพฤกษศาสตร์

    แพลตฟอร์ม: 10X Genomics Visium และ Illumina NovaSeq

  • ลำดับ mRNA ความยาวเต็ม-นาโนพอร์

    ลำดับ mRNA ความยาวเต็ม-นาโนพอร์

    แม้ว่าการจัดลำดับ mRNA ที่ใช้ NGS เป็นเครื่องมืออเนกประสงค์สำหรับการหาปริมาณการแสดงออกของยีน แต่การพึ่งพาการอ่านแบบสั้นจะจำกัดประสิทธิภาพในการวิเคราะห์การถอดเสียงที่ซับซ้อน ในทางกลับกัน การหาลำดับนาโนพอร์ใช้เทคโนโลยีการอ่านระยะยาว ซึ่งช่วยให้สามารถจัดลำดับทรานสคริปต์ mRNA แบบเต็มความยาวได้ แนวทางนี้อำนวยความสะดวกในการสำรวจที่ครอบคลุมของการต่อรอยทางเลือก การหลอมรวมของยีน โพลีอะดีนิเลชัน และการหาปริมาณของไอโซฟอร์ม mRNA

    การหาลำดับนาโนพอร์เป็นวิธีการที่ใช้สัญญาณไฟฟ้าแบบเรียลไทม์โมเลกุลเดี่ยวของนาโนพอร์ ให้ผลลัพธ์แบบเรียลไทม์ DNA แบบเกลียวคู่นำทางโดยโปรตีนจากมอเตอร์จับกับโปรตีนนาโนพอร์ที่ฝังอยู่ในแผ่นชีวะ และคลายตัวเมื่อมันเคลื่อนผ่านช่องนาโนพอร์ภายใต้แรงดันไฟฟ้าที่แตกต่างกัน สัญญาณไฟฟ้าที่โดดเด่นที่สร้างขึ้นจากฐานต่างๆ บนสาย DNA จะถูกตรวจจับและจำแนกตามเวลาจริง ช่วยให้การจัดลำดับนิวคลีโอไทด์แม่นยำและต่อเนื่อง แนวทางที่เป็นนวัตกรรมนี้เอาชนะข้อจำกัดในการอ่านระยะสั้น และมอบแพลตฟอร์มแบบไดนามิกสำหรับการวิเคราะห์จีโนมที่ซับซ้อน รวมถึงการศึกษาเชิงถอดความที่ซับซ้อนพร้อมผลลัพธ์ทันที

    แพลตฟอร์ม: Nanopore PromethION 48

  • การหาลำดับ mRNA แบบเต็มความยาว -PacBio

    การหาลำดับ mRNA แบบเต็มความยาว -PacBio

    แม้ว่าการจัดลำดับ mRNA ที่ใช้ NGS เป็นเครื่องมืออเนกประสงค์สำหรับการหาปริมาณการแสดงออกของยีน แต่การพึ่งพาการอ่านแบบสั้นจะจำกัดการใช้งานในการวิเคราะห์การถอดเสียงที่ซับซ้อน ในทางกลับกัน การจัดลำดับ PacBio (Iso-Seq) ใช้เทคโนโลยีการอ่านระยะยาว ซึ่งช่วยให้สามารถจัดลำดับการถอดเสียง mRNA แบบเต็มความยาวได้ วิธีการนี้อำนวยความสะดวกในการสำรวจที่ครอบคลุมของการต่อรอยทางเลือก การหลอมรวมของยีน และโพลีอะดีนิเลชั่น อย่างไรก็ตาม มีตัวเลือกอื่นสำหรับการวัดปริมาณการแสดงออกของยีนเนื่องจากมีข้อมูลจำนวนมาก เทคโนโลยีการจัดลำดับ PacBio อาศัยการจัดลำดับโมเลกุลเดี่ยวแบบเรียลไทม์ (SMRT) ซึ่งให้ข้อได้เปรียบที่ชัดเจนในการจับภาพการถอดเสียง mRNA แบบเต็มความยาว แนวทางที่เป็นนวัตกรรมนี้เกี่ยวข้องกับการใช้ท่อนำคลื่นแบบโหมดศูนย์ (ZMW) และหลุมที่ทำจากโครงสร้างขนาดเล็กที่ช่วยให้สามารถสังเกตกิจกรรม DNA polymerase แบบเรียลไทม์ในระหว่างการหาลำดับ ภายใน ZMW เหล่านี้ DNA polymerase ของ PacBio จะสังเคราะห์สาย DNA ที่เสริมกัน ทำให้เกิดการอ่านค่าที่ยาวนานซึ่งครอบคลุมการถอดเสียง mRNA ทั้งหมด การทำงานของ PacBio ในโหมด Circular Consensus Sequencing (CCS) ช่วยเพิ่มความแม่นยำโดยการจัดลำดับโมเลกุลเดียวกันซ้ำๆ การอ่าน HiFi ที่สร้างขึ้นมีความแม่นยำเทียบเท่ากับ NGS ซึ่งช่วยวิเคราะห์คุณสมบัติการถอดรหัสที่ซับซ้อนได้อย่างครอบคลุมและเชื่อถือได้

    แพลตฟอร์ม: PacBio ภาคต่อ II; PacBio รีวิโอ

  • ลำดับยูคาริโอต mRNA-NGS

    ลำดับยูคาริโอต mRNA-NGS

    การจัดลำดับ mRNA ซึ่งเป็นเทคโนโลยีอเนกประสงค์ เพิ่มศักยภาพในการสร้างโปรไฟล์ที่ครอบคลุมของการถอดเสียง mRNA ทั้งหมดภายในเซลล์ภายใต้เงื่อนไขเฉพาะ ด้วยการใช้งานที่หลากหลาย เครื่องมือล้ำสมัยนี้เผยให้เห็นโปรไฟล์การแสดงออกของยีนที่ซับซ้อน โครงสร้างยีน และกลไกระดับโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีววิทยาที่หลากหลาย การจัดลำดับ mRNA ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยขั้นพื้นฐาน การวินิจฉัยทางคลินิก และการพัฒนายา โดยให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับความซับซ้อนของพลวัตของเซลล์และการควบคุมทางพันธุกรรม ซึ่งจุดประกายความอยากรู้อยากเห็นเกี่ยวกับศักยภาพของ mRNA ในสาขาต่างๆ

    แพลตฟอร์ม: อิลลูมินา NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • ลำดับ mRNA-NGS ที่ไม่อิงการอ้างอิง

    ลำดับ mRNA-NGS ที่ไม่อิงการอ้างอิง

    การจัดลำดับ mRNA ช่วยให้สามารถสร้างโปรไฟล์ที่ครอบคลุมของการถอดเสียง mRNA ทั้งหมดภายในเซลล์ภายใต้เงื่อนไขเฉพาะ เทคโนโลยีล้ำสมัยนี้ทำหน้าที่เป็นเครื่องมือที่มีศักยภาพในการเปิดเผยโปรไฟล์การแสดงออกของยีนที่ซับซ้อน โครงสร้างยีน และกลไกระดับโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีววิทยาที่หลากหลาย การจัดลำดับ mRNA ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการวิจัยพื้นฐาน การวินิจฉัยทางคลินิก และการพัฒนายา โดยให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับความซับซ้อนของพลวัตของเซลล์และการควบคุมทางพันธุกรรม

    แพลตฟอร์ม: อิลลูมินา NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • ลำดับแบบไม่เข้ารหัสแบบยาว-Illumina

    ลำดับแบบไม่เข้ารหัสแบบยาว-Illumina

    RNA ที่ไม่เข้ารหัสขนาดยาว (lncRNAs) มีความยาวมากกว่า 200 นิวคลีโอไทด์ที่มีศักยภาพในการเข้ารหัสน้อยที่สุดและเป็นองค์ประกอบสำคัญภายใน RNA ที่ไม่ได้เข้ารหัส พบในนิวเคลียสและไซโตพลาสซึม RNA เหล่านี้มีบทบาทสำคัญในการควบคุม epigenetic, transcriptional และ post-transcriptional โดยเน้นย้ำความสำคัญในการสร้างกระบวนการเซลล์และโมเลกุล การจัดลำดับ LncRNA เป็นเครื่องมืออันทรงพลังในการสร้างความแตกต่างของเซลล์ การสร้างเซลล์ และโรคของมนุษย์

    แพลตฟอร์ม: อิลลูมินา NovaSeq

  • ลำดับ RNA ขนาดเล็ก - อิลลูมินา

    ลำดับ RNA ขนาดเล็ก - อิลลูมินา

    โมเลกุล RNA (sRNA) ขนาดเล็ก ได้แก่ microRNAs (miRNAs), RNAs ที่รบกวนขนาดเล็ก (siRNAs) และ RNA ที่มีปฏิสัมพันธ์กับ Piwi (piRNAs) ในบรรดาสิ่งเหล่านี้ miRNA ซึ่งมีความยาวประมาณ 18-25 นิวคลีโอไทด์ มีความสำคัญเป็นพิเศษสำหรับบทบาทด้านกฎระเบียบที่สำคัญในกระบวนการเซลล์ต่างๆ ด้วยรูปแบบการแสดงออกเฉพาะเนื้อเยื่อและเฉพาะระยะ miRNA จึงมีการอนุรักษ์สูงในสายพันธุ์ต่างๆ

    แพลตฟอร์ม: อิลลูมินา NovaSeq

  • ลำดับ CircRNA-อิลลูมินา

    ลำดับ CircRNA-อิลลูมินา

    การจัดลำดับ RNA แบบวงกลม (circRNA-seq) คือการรวบรวมโปรไฟล์และวิเคราะห์ RNA แบบวงกลม ซึ่งเป็นคลาสของโมเลกุล RNA ที่ก่อตัวเป็นลูปปิดเนื่องจากเหตุการณ์การต่อรอยที่ไม่เป็นที่ยอมรับ ทำให้ RNA นี้มีเสถียรภาพเพิ่มขึ้น แม้ว่า circRNA บางตัวจะทำหน้าที่เป็นฟองน้ำ microRNA โดยแยก microRNA และป้องกันไม่ให้พวกมันควบคุม mRNA เป้าหมาย แต่ circRNA อื่นๆ อาจโต้ตอบกับโปรตีน ปรับการแสดงออกของยีน หรือมีบทบาทในกระบวนการเซลล์ การวิเคราะห์การแสดงออกของ circRNA ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับบทบาทด้านกฎระเบียบของโมเลกุลเหล่านี้ และความสำคัญของโมเลกุลเหล่านี้ในกระบวนการเซลล์ ระยะการพัฒนา และสภาวะของโรคต่างๆ ซึ่งมีส่วนช่วยให้เข้าใจอย่างลึกซึ้งยิ่งขึ้นเกี่ยวกับความซับซ้อนของการควบคุม RNA ในบริบทของการแสดงออกของยีน

  • ลำดับการถอดเสียงทั้งหมด - อิลลูมินา

    ลำดับการถอดเสียงทั้งหมด - อิลลูมินา

    การจัดลำดับทรานสคริปต์ทั้งหมดนำเสนอวิธีการที่ครอบคลุมในการสร้างโปรไฟล์โมเลกุล RNA ที่หลากหลาย ครอบคลุมการเข้ารหัส (mRNA) และ RNA ที่ไม่เข้ารหัส (lncRNA, circRNA และ miRNA) เทคนิคนี้จะรวบรวมทรานสคริปโตมทั้งหมดของเซลล์เฉพาะในช่วงเวลาที่กำหนด ช่วยให้เข้าใจกระบวนการของเซลล์แบบองค์รวม มีชื่อเรียกอีกอย่างว่า "การจัดลำดับ RNA ทั้งหมด" โดยมีจุดมุ่งหมายเพื่อเปิดเผยเครือข่ายการกำกับดูแลที่ซับซ้อนในระดับทรานสคริปโตม ซึ่งช่วยให้สามารถวิเคราะห์เชิงลึก เช่น RNA ภายนอกที่แข่งขันกัน (ceRNA) และการวิเคราะห์ RNA ร่วม สิ่งนี้นับเป็นก้าวเริ่มต้นสู่การกำหนดลักษณะการทำงาน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการคลี่คลายเครือข่ายกฎระเบียบที่เกี่ยวข้องกับการโต้ตอบ ceRNA ที่ใช้ circRNA-miRNA-mRNA

  • ลำดับภูมิคุ้มกันบกพร่องของโครมาติน (ChIP-seq)

    ลำดับภูมิคุ้มกันบกพร่องของโครมาติน (ChIP-seq)

    Chromatin Immunoprecipitation (CHIP) เป็นเทคนิคที่ใช้ประโยชน์จากแอนติบอดีเพื่อเพิ่มคุณค่าโปรตีนที่จับกับ DNA และเป้าหมายทางจีโนมที่สอดคล้องกันของพวกมัน การบูรณาการกับ NGS ช่วยให้สามารถสร้างโปรไฟล์เป้าหมาย DNA ทั่วทั้งจีโนมที่เกี่ยวข้องกับการปรับเปลี่ยนฮิสโตน ปัจจัยการถอดรหัส และโปรตีนที่จับกับ DNA อื่น ๆ วิธีการแบบไดนามิกนี้ช่วยให้สามารถเปรียบเทียบตำแหน่งการจับกับเซลล์ประเภท เนื้อเยื่อ หรือสภาวะต่างๆ การประยุกต์ใช้งานของ ChIP-Seq ครอบคลุมตั้งแต่การศึกษากฎระเบียบด้านการถอดเสียงและเส้นทางการพัฒนาไปจนถึงการอธิบายกลไกของโรค ทำให้เป็นเครื่องมือที่ขาดไม่ได้ในการทำความเข้าใจภาพรวมของการควบคุมจีโนม และเพิ่มความเข้าใจเชิงลึกในการรักษาโรค

    แพลตฟอร์ม: อิลลูมินา NovaSeq

ส่งข้อความของคุณถึงเรา: