-
BMKMANU S3000_การถอดเสียงเชิงพื้นที่
การถอดเสียงเชิงพื้นที่ยืนอยู่แถวหน้าของนวัตกรรมทางวิทยาศาสตร์ ช่วยให้นักวิจัยสามารถเจาะลึกรูปแบบการแสดงออกของยีนที่ซับซ้อนภายในเนื้อเยื่อ ขณะเดียวกันก็รักษาบริบทเชิงพื้นที่ไว้ ท่ามกลางแพลตฟอร์มต่างๆ BMKGene ได้พัฒนาชิป BMKManu S3000 Spatial Transcriptome ซึ่งมีความละเอียดที่เพิ่มขึ้น 3.5µm เข้าถึงช่วงเซลล์ย่อย และเปิดใช้งานการตั้งค่าความละเอียดหลายระดับ ชิป S3000 ซึ่งมีจุดประมาณ 4 ล้านจุด ใช้ไมโครเวลส์ที่เรียงเป็นชั้นด้วยเม็ดบีดที่บรรจุด้วยหัววัดจับบาร์โค้ดเชิงพื้นที่ ห้องสมุด cDNA ที่เสริมด้วยบาร์โค้ดเชิงพื้นที่ ถูกเตรียมจากชิป S3000 และจัดลำดับบนแพลตฟอร์ม Illumina NovaSeq ในเวลาต่อมา การผสมผสานระหว่างตัวอย่างบาร์โค้ดเชิงพื้นที่และ UMI ช่วยให้มั่นใจในความถูกต้องและความเฉพาะเจาะจงของข้อมูลที่สร้างขึ้น ชิป BMKManu S3000 มีความหลากหลายอย่างยิ่ง โดยมีการตั้งค่าความละเอียดหลายระดับที่สามารถปรับอย่างละเอียดตามเนื้อเยื่อต่างๆ และระดับรายละเอียดที่ต้องการ ความสามารถในการปรับตัวนี้ทำให้ชิปเป็นตัวเลือกที่โดดเด่นสำหรับการศึกษาการถอดเสียงเชิงพื้นที่ที่หลากหลาย ช่วยให้มั่นใจได้ถึงการจัดกลุ่มเชิงพื้นที่ที่แม่นยำและมีสัญญาณรบกวนน้อยที่สุด การใช้เทคโนโลยีการแบ่งส่วนเซลล์กับ BMKManu S3000 ช่วยให้สามารถกำหนดขอบเขตของข้อมูลการถอดเสียงไปยังขอบเขตของเซลล์ ส่งผลให้เกิดการวิเคราะห์ที่มีความหมายทางชีววิทยาโดยตรง นอกจากนี้ ความละเอียดที่ได้รับการปรับปรุงของ S3000 ยังส่งผลให้จำนวนยีนและ UMI ที่ตรวจพบต่อเซลล์สูงขึ้น ช่วยให้วิเคราะห์รูปแบบการถอดรหัสเชิงพื้นที่และการรวมกลุ่มของเซลล์ได้แม่นยำยิ่งขึ้น
-
ไลบรารีที่สร้างไว้ล่วงหน้าของ DNBSEQ
DNBSEQ ซึ่งพัฒนาโดย MGI เป็นเทคโนโลยี NGS ที่เป็นนวัตกรรมใหม่ซึ่งสามารถลดต้นทุนการจัดลำดับและเพิ่มปริมาณงานได้ การเตรียมห้องสมุด DNBSEQ เกี่ยวข้องกับการแยกส่วน DNA, การเตรียม ssDNA และการขยายวงกลมกลิ้งเพื่อให้ได้ DNA nanoballs (DNB) จากนั้นสิ่งเหล่านี้จะถูกโหลดลงบนพื้นผิวแข็ง และต่อมาถูกจัดลำดับโดยการสังเคราะห์โพรบ-พุกแบบผสมผสาน (cPAS) เทคโนโลยี DNBSEQ ผสมผสานข้อดีของการมีอัตราความผิดพลาดในการขยายสัญญาณต่ำ เข้ากับการใช้รูปแบบข้อผิดพลาดที่มีความหนาแน่นสูงด้วยนาโนบอล ส่งผลให้การเรียงลำดับมีปริมาณงานและความแม่นยำที่สูงขึ้น
บริการจัดลำดับห้องสมุดที่สร้างไว้ล่วงหน้าของเราช่วยให้ลูกค้าสามารถเตรียมห้องสมุดจัดลำดับของ Illumina จากแหล่งที่หลากหลาย (mRNA, จีโนมทั้งหมด, แอมพลิคอน, ห้องสมุด 10x และอื่นๆ อีกมากมาย) ซึ่งจะถูกแปลงเป็นห้องสมุด MGI ในห้องปฏิบัติการของเราเพื่อจัดลำดับใน DNBSEQ-T7 ช่วยให้ ปริมาณข้อมูลสูงด้วยต้นทุนที่ต่ำกว่า
-
ปฏิสัมพันธ์ของโครมาตินที่มี Hi-C
Hi-C เป็นวิธีการที่ออกแบบมาเพื่อบันทึกการกำหนดค่าจีโนมโดยการรวมการโต้ตอบที่อิงความใกล้ชิดของโพรบและการจัดลำดับที่มีปริมาณงานสูง วิธีการนี้อาศัยการเชื่อมโยงข้ามโครมาตินกับฟอร์มาลดีไฮด์ ตามด้วยการย่อยและการรวมตัวใหม่ในลักษณะที่มีเฉพาะชิ้นส่วนที่เชื่อมโยงด้วยโควาเลนต์เท่านั้นที่จะก่อให้เกิดผลิตภัณฑ์การยึดเกาะ การจัดลำดับผลิตภัณฑ์ ligation เหล่านี้ ทำให้สามารถศึกษาโครงสร้าง 3 มิติของจีโนมได้ Hi-C ช่วยให้สามารถศึกษาการกระจายตัวของส่วนของจีโนมที่ถูกอัดแน่นเล็กน้อย (ช่อง A, ยูโครมาติน) และมีแนวโน้มที่จะมีฤทธิ์ในการถอดรหัสมากกว่า และบริเวณที่อัดแน่นมากขึ้น (ช่อง B, เฮเทอโรโครมาติน) Hi-C ยังสามารถใช้เพื่อระบุโดเมนที่เกี่ยวข้องกับทอพอโลยี (TADs) บริเวณของจีโนมที่มีโครงสร้างพับและมีแนวโน้มที่จะมีรูปแบบการแสดงออกที่คล้ายกัน และเพื่อระบุลูปโครมาติน บริเวณ DNA ที่ยึดติดกันด้วยโปรตีนและที่ มักจะเสริมด้วยองค์ประกอบด้านกฎระเบียบ บริการจัดลำดับ Hi-C ของ BMKGene ช่วยให้นักวิจัยสามารถสำรวจมิติเชิงพื้นที่ของจีโนมิกส์ เปิดช่องทางใหม่ในการทำความเข้าใจการควบคุมจีโนม รวมถึงผลกระทบต่อสุขภาพและโรค
-
ชุด RNA ของพืชแม่เหล็กอัจฉริยะ TGuide
ชุด RNA ของพืชแม่เหล็กอัจฉริยะ TGuide
ชำระล้าง RNA ทั้งหมดคุณภาพสูงจากเนื้อเยื่อพืช
-
ชุด RNA ของเลือด/เซลล์/เนื้อเยื่อ TGuide Smart
ชุด RNA ของเลือด/เซลล์/เนื้อเยื่อ TGuide Smart
ชุดรีเอเจนต์แบบคาร์ทริดจ์/เพลตที่เติมไว้ล่วงหน้าสำหรับการทำให้ RNA รวมที่ให้ผลผลิตสูง มีความบริสุทธิ์สูง มีคุณภาพสูง และปราศจากสารยับยั้งจากเนื้อเยื่อสัตว์/เซลล์/เลือดครบส่วนสด
-
ชุด DNA พืชแม่เหล็กอัจฉริยะ TGuide
ชุด DNA พืชแม่เหล็กอัจฉริยะ TGuide
ชำระล้าง DNA จีโนมคุณภาพสูงจากเนื้อเยื่อพืชต่างๆ
-
ชุด DNA ดิน / สตูลอัจฉริยะ TGuide
ชุด DNA ดิน / สตูลอัจฉริยะ TGuide
ชำระล้าง DNA ที่ปราศจากสารยับยั้งด้วยความบริสุทธิ์และคุณภาพสูงจากตัวอย่างดินและอุจจาระ
-
ชุดฟอก DNA อัจฉริยะ TGuide
กู้คืน DNA คุณภาพสูงจากผลิตภัณฑ์ PCR หรือเจลอะกาโรส
-
ชุดตรวจ DNA จีโนมเลือดอัจฉริยะ TGuide
ชุดตรวจ DNA จีโนมเลือดอัจฉริยะ TGuide
ชุดรีเอเจนต์แบบคาร์ทริดจ์/เพลตที่เติมไว้ล่วงหน้าสำหรับการฟอก DNA จีโนมจากเลือดและบัฟฟีโค้ต
-
ชุด DNA เนื้อเยื่อแม่เหล็กอัจฉริยะ TGuide
ชุดรีเอเจนต์แบบคาร์ทริดจ์ / เพลตที่เติมไว้ล่วงหน้าสำหรับการสกัด DNA จีโนมจากเนื้อเยื่อของสัตว์
-
ชุด TGuide Smart Universal DNA
ชุดรีเอเจนต์แบบคาร์ทริดจ์/เพลตที่เติมไว้ล่วงหน้าสำหรับการฟอก DNA จีโนมจากเลือด จุดเลือดแห้ง แบคทีเรีย เซลล์ น้ำลาย ไม้พันในช่องปาก เนื้อเยื่อของสัตว์ ฯลฯ
-
TGuide S16 เครื่องสกัดกรดนิวคลีอิก
TGuide S16 เครื่องสกัดกรดนิวคลีอิก
เครื่องมือแบบตั้งโต๊ะที่ใช้งานง่าย สามารถเก็บตัวอย่างได้ 1-8 หรือ 16 ตัวอย่างในเวลาเดียวกัน
หมายเลขแค็ตตาล็อก/บรรจุภัณฑ์
แมว. เลขที่
ID
จำนวนการเตรียมการ
OSE-S16-AM
1 ชุด
-
โซลูชัน mRNA แบบเต็มความยาว PacBio 2+3
แม้ว่าการจัดลำดับ mRNA ที่ใช้ NGS เป็นเครื่องมืออเนกประสงค์สำหรับการหาปริมาณการแสดงออกของยีน แต่การพึ่งพาการอ่านแบบสั้นจะจำกัดประสิทธิภาพในการวิเคราะห์การถอดเสียงที่ซับซ้อน ในทางกลับกัน การจัดลำดับ PacBio (Iso-Seq) ใช้เทคโนโลยีการอ่านระยะยาว ซึ่งช่วยให้สามารถจัดลำดับการถอดเสียง mRNA แบบเต็มความยาวได้ วิธีการนี้อำนวยความสะดวกในการสำรวจที่ครอบคลุมของการต่อรอยทางเลือก การหลอมรวมของยีน และโพลีอะดีนิเลชัน แม้ว่าจะไม่ใช่ตัวเลือกหลักสำหรับการวัดปริมาณการแสดงออกของยีน การรวมกัน 2+3 เชื่อมช่องว่างระหว่าง Illumina และ PacBio โดยอาศัยการอ่าน PacBio HiFi เพื่อระบุชุดที่สมบูรณ์ของไอโซฟอร์มการถอดเสียงและการจัดลำดับ NGS เพื่อหาปริมาณไอโซฟอร์มที่เหมือนกัน
แพลตฟอร์ม: PacBio Sequel II/ PacBio Revio และ Illumina NovaSeq;