mRNA-seq (NGS) พร้อมจีโนมอ้างอิง
RNA-seq เป็นเครื่องมือมาตรฐานสำหรับวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิตและพืชผล โดยเชื่อมช่องว่างระหว่างจีโนมและโปรตีโอม จุดแข็งของมันอยู่ที่การค้นพบการถอดเสียงใหม่และการหาปริมาณการแสดงออกในการทดสอบครั้งเดียว มีการใช้กันอย่างแพร่หลายสำหรับการศึกษาเชิงถอดความเชิงเปรียบเทียบ โดยให้ความกระจ่างเกี่ยวกับยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะหรือฟีโนไทป์ต่างๆ เช่น การเปรียบเทียบสายพันธุ์กลายกับพันธุ์ธรรมชาติ หรือการเปิดเผยการแสดงออกของยีนภายใต้เงื่อนไขเฉพาะ แอป BMKCloud mRNA (อ้างอิง) ผสานรวมการหาปริมาณนิพจน์ การวิเคราะห์การแสดงออกเชิงอนุพันธ์ (DEG) และการวิเคราะห์โครงสร้างลำดับลงในไปป์ไลน์ชีวสารสนเทศศาสตร์ mRNA-seq (NGS) และผสมผสานจุดแข็งของซอฟต์แวร์ที่คล้ายกัน เพื่อให้มั่นใจถึงความสะดวกสบายและเป็นมิตรต่อผู้ใช้ ผู้ใช้สามารถอัปโหลดข้อมูล RNA-seq ไปยังคลาวด์ โดยที่แอปนำเสนอโซลูชันการวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศแบบครบวงจรแบบครบวงจรในที่เดียว นอกจากนี้ยังให้ความสำคัญกับประสบการณ์ของลูกค้า โดยนำเสนอการดำเนินงานส่วนบุคคลที่ปรับให้เหมาะกับความต้องการเฉพาะของผู้ใช้ ผู้ใช้สามารถตั้งค่าพารามิเตอร์และส่งภารกิจไปป์ไลน์ได้ด้วยตนเอง ตรวจสอบรายงานเชิงโต้ตอบ ดูข้อมูล/ไดอะแกรม และการทำเหมืองข้อมูลให้เสร็จสิ้น เช่น การเลือกยีนเป้าหมาย การจัดกลุ่มฟังก์ชัน การสร้างไดอะแกรม ฯลฯ
แพลตฟอร์ม:อิลลูมินา, เอ็มจีไอ
กลยุทธ์:RNA-Seq
เค้าโครง: จับคู่และทำความสะอาดข้อมูล
ประเภทห้องสมุด:fr-unstranded, fr-firststrand หรือ fr-secondstrand
อ่านความยาว:150 บีพี
ประเภทไฟล์:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz หรือ *.fq.gz ระบบจะจับคู่ไฟล์ .fastq โดยอัตโนมัติตามชื่อไฟล์ของพวกเขาเช่น *_1.fastq จับคู่กับ *._2.fastq
จำนวนตัวอย่าง:ไม่มีข้อจำกัดเกี่ยวกับจำนวนของกลุ่มตัวอย่าง แต่เวลาในการวิเคราะห์จะเพิ่มขึ้นตามจำนวนตัวอย่างเติบโตขึ้น
ปริมาณข้อมูลที่แนะนำ:6G ต่อตัวอย่าง