ไฮไลท์
ในการสัมมนาผ่านเว็บความยาวสองชั่วโมงนี้ เรารู้สึกเป็นเกียรติอย่างยิ่งที่ได้เชิญผู้เชี่ยวชาญหกคนในเวทีจีโนมิกส์พืชผล วิทยากรของเราจะตีความเชิงลึกเกี่ยวกับการศึกษาจีโนมของไรย์ 2 รายการ ซึ่งเพิ่งเผยแพร่เมื่อเร็วๆ นี้พันธุศาสตร์ธรรมชาติ-
1. การประกอบจีโนมระดับโครโมโซมให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับชีววิทยาของไรย์ วิวัฒนาการ และศักยภาพทางการเกษตร
2. การประกอบจีโนมคุณภาพสูงเน้นคุณลักษณะจีโนมของไรย์และยีนที่สำคัญทางการเกษตร
นอกจากนี้ เรายังยินดีที่มีนักวิทยาศาสตร์อาวุโสด้านการวิจัยและพัฒนาของ Biomarker Technologies มาแบ่งปันประสบการณ์ของเขาในการประกอบจีโนมเดอโนโว
กำหนดการ
09:00 น. CET
คำกล่าวต้อนรับ
เจิ้งหงคุง
ผู้ก่อตั้งและซีอีโอ Biomarker Technologies
เติ้งซิ่งหวาง
ประธานคณะวิชาวิทยาศาสตร์การเกษตรขั้นสูง มหาวิทยาลัยปักกิ่ง
09:15น
ปรับปรุงการปรับปรุงข้าวไรย์ ทริติเคลี และข้าวสาลีโดยใช้ลำดับจีโนมอ้างอิงคุณภาพสูง
ในการสัมมนาผ่านเว็บนี้ ศาสตราจารย์ Wang ได้ให้ข้อมูลอัปเดตโดยรวมเกี่ยวกับสถานะปัจจุบันของการวิจัยจีโนมของ triticeae และแสดงให้เห็นถึงความสำเร็จและความก้าวหน้าของผลงานที่โดดเด่นสองชิ้นเกี่ยวกับการศึกษาจีโนมของไรย์ ซึ่งเพิ่งเผยแพร่เมื่อเร็ว ๆ นี้ใน Nature Genetics และแนะนำการวิจัยทั้งหมด กลุ่มผู้นำและมีส่วนร่วมในการทำงาน
09:25น
จีโนมของธัญพืช @ IPK Gatersleben
หญ้าธัญพืชของชนเผ่า Triticeae เป็นแหล่งอาหารหลักในเขตอบอุ่น ซึ่งได้รับการยกย่องว่าเป็นจุดสำคัญในการปรับปรุงและเพาะพันธุ์พืชมายาวนาน ในบรรดาสายพันธุ์ที่ได้รับการปลูกฝังทั้งหมด ชนเผ่านี้มีชื่อเสียงในด้านคุณลักษณะทางจีโนมที่ซับซ้อนอย่างยิ่ง รวมถึงขนาดจีโนมขนาดใหญ่ ปริมาณ TEs สูง โพลีพลอยด์ ฯลฯ ในเซสชั่นนี้ ศาสตราจารย์ Nils Stein ได้ให้ข้อมูลเบื้องต้นเกี่ยวกับ IPK Gatersleben และสถานะปัจจุบันของธัญพืชแก่เรา การวิจัยจีโนม @ IPK Gatersleben
09:35น
การประกอบจีโนมระดับโครโมโซมให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับชีววิทยาของไรย์ วิวัฒนาการ และศักยภาพทางการเกษตร
ดร. เอ็ม ทิโมธี ราบานัส-วอลเลซ สถาบันวิจัยพันธุศาสตร์พืชและแผนพืชเมืองไลบนิซ (IPK)ข้าวไรย์ (Secale corne L.) เป็นพืชธัญพืชที่มีความยืดหยุ่นต่อสภาพอากาศเป็นพิเศษ มีการใช้อย่างแพร่หลายเพื่อผลิตพันธุ์ข้าวสาลีที่ได้รับการปรับปรุงโดยการผสมข้ามพันธุ์แบบ introgressive และมียีนทั้งหมดที่จำเป็นต่อการขยายพันธุ์แบบลูกผสม ข้าวไรย์เป็นข้าวไรย์และเพิ่งเลี้ยงในบ้านเมื่อไม่นานมานี้ ซึ่งทำให้ข้าวไรย์ที่ได้รับการเพาะปลูกสามารถเข้าถึงแหล่งยีนป่าที่หลากหลายและหาประโยชน์ได้ เพื่อเพิ่มศักยภาพทางการเกษตรของไรย์ เราได้ผลิตชุดประกอบที่มีคำอธิบายประกอบระดับโครโมโซมของจีโนมไรย์ขนาด 7.9 Mbp และตรวจสอบคุณภาพอย่างกว้างขวางโดยใช้ชุดทรัพยากรพันธุกรรมระดับโมเลกุล เราสาธิตการใช้งานทรัพยากรนี้ด้วยการสืบสวนที่หลากหลาย เรานำเสนอข้อค้นพบเกี่ยวกับการแยกทางพันธุกรรมที่ไม่สมบูรณ์ของไรย์ที่เพาะปลูกจากญาติในป่า กลไกของการวิวัฒนาการของโครงสร้างจีโนม การต้านทานเชื้อโรค การทนต่ออุณหภูมิต่ำ ระบบควบคุมการเจริญพันธุ์สำหรับการผสมพันธุ์แบบลูกผสม และประโยชน์ของผลผลิตของการเริ่มผสมพันธุ์ของไรย์-ข้าวสาลี
10:05น
การประกอบจีโนมคุณภาพสูงเน้นย้ำคุณลักษณะจีโนมของไรย์และยีนที่สำคัญทางการเกษตร
ข้าวไรย์เป็นพืชอาหารและอาหารสัตว์ที่มีคุณค่า เป็นทรัพยากรทางพันธุกรรมที่สำคัญสำหรับการปรับปรุงข้าวสาลีและไตรติเคลี และเป็นวัสดุที่ขาดไม่ได้สำหรับการศึกษาจีโนมเชิงเปรียบเทียบที่มีประสิทธิภาพในหญ้า ที่นี่ เราได้จัดลำดับจีโนมของข้าวไรย์ Weining ซึ่งเป็นข้าวไรย์ชั้นยอดของจีน contigs ที่ประกอบ (7.74 Gb) คิดเป็น 98.47% ของขนาดจีโนมโดยประมาณ (7.86 Gb) โดย 93.67% ของ contigs (7.25 Gb) ถูกกำหนดให้กับโครโมโซมเจ็ดโครโมโซม องค์ประกอบที่ซ้ำกันประกอบด้วย 90.31% ของจีโนมที่ประกอบกัน เมื่อเปรียบเทียบกับจีโนม Triticeae ที่เรียงลำดับก่อนหน้านี้ Daniela, Sumaya และ Sumana retrotransposons มีการขยายตัวอย่างมากในไรย์ การวิเคราะห์เพิ่มเติมของชุดประกอบของ Weining ให้ความกระจ่างใหม่เกี่ยวกับการทำซ้ำของยีนทั่วทั้งจีโนม และผลกระทบต่อยีนการสังเคราะห์แป้ง การจัดระเบียบทางกายภาพของตำแหน่งโปรลามินที่ซับซ้อน การแสดงออกของยีนมีลักษณะการมุ่งหน้าในช่วงต้น และบริเวณโครโมโซมที่เกี่ยวข้องกับการเลี้ยงโดยสมมุติและตำแหน่งในไรย์ ลำดับจีโนมนี้สัญญาว่าจะเร่งการศึกษาจีโนมและการปรับปรุงพันธุ์ข้าวไรย์และพืชธัญพืชที่เกี่ยวข้อง
10:35น
ความท้าทาย แนวทางแก้ไข และอนาคตของการประกอบจีโนมเดอโนโว
จีโนมคุณภาพสูงเป็นพื้นฐานของการศึกษาจีโนม แม้ว่าการพัฒนาอย่างรวดเร็วในการจัดลำดับและอัลกอริธึมได้เพิ่มขีดความสามารถให้กับการประกอบจีโนมที่เรียบง่ายและมีประสิทธิภาพมากขึ้น แต่ความต้องการในความแม่นยำและความสมบูรณ์ในการประกอบก็เพิ่มขึ้นเช่นกันพร้อมกับเป้าหมายการวิจัยที่ลึกซึ้งยิ่งขึ้น ในการบรรยายนี้ ผมจะพูดถึงเทคโนโลยียอดนิยมในปัจจุบันในการประกอบจีโนมกับกรณีที่ประสบความสำเร็จหลายกรณี และดูการพัฒนาในอนาคต
เวลาโพสต์: Jan-08-2022