จีโนม

การประกอบระดับโครโมโซมและการวิเคราะห์จีโนม Miscanthus lutarioriparius ของพืชชีวมวล
ลำดับนาโนพอร์ | อิลลูมินา | ไฮ-ซี | ลำดับ RNA | สายวิวัฒนาการ
ในการศึกษานี้ Biomarker Technologies ให้การสนับสนุนทางเทคนิคเกี่ยวกับการหาลำดับนาโนพอร์ การประกอบจีโนมแบบเดอโนโว การประกอบแบบช่วยด้วย Hi-C เป็นต้น
เชิงนามธรรม
มิสแคนทัสซึ่งเป็นพืชยืนต้นที่มีเหง้ามีศักยภาพในการผลิตพลังงานชีวภาพได้ดีเนื่องจากมีมวลชีวภาพสูงและทนต่อความเครียด เรารายงานการประกอบระดับโครโมโซมของMiscanthus lutarioripariusจีโนมโดยการรวมลำดับ Oxford Nanopore และเทคโนโลยี Hi-C แอสเซมบลี 2.07-Gb ครอบคลุม 96.64% ของจีโนม โดยมี contig N50 อยู่ที่ 1.71 Mb ลำดับเซนโทรเมียร์และเทโลเมียร์ถูกประกอบขึ้นสำหรับโครโมโซม 19 โครโมโซมและโครโมโซม 10 ทั้งหมดตามลำดับ ต้นกำเนิด Allotetraploid ของ M. lutarioriparius ได้รับการยืนยันโดยใช้ดาวเทียมเซนโตรเมอริกซ้ำ โครงสร้างจีโนมเตตราพลอยด์และการจัดเรียงโครโมโซมใหม่หลายอย่างที่สัมพันธ์กับข้าวฟ่างแสดงให้เห็นอย่างชัดเจน ยีนที่ซ้ำกันของM. lutarioripariusไม่เพียงแต่ในแง่ของการตอบสนองต่อความเครียดเท่านั้น แต่ยังมีการสังเคราะห์ทางชีวภาพของผนังเซลล์อีกด้วย ตระกูลยีนที่เกี่ยวข้องกับความต้านทานโรค การสังเคราะห์ทางชีวภาพของผนังเซลล์ และการขนส่งไอออนของโลหะได้รับการขยายและพัฒนาอย่างมาก การขยายตัวของตระกูลเหล่านี้อาจเป็นพื้นฐานทางจีโนมที่สำคัญสำหรับการปรับปรุงลักษณะเด่นของM. lutarioriparius.
สถิติสำคัญของการประกอบจีโนม


รูป. ภาพรวมของชุดประกอบจีโนม M. lutarioriparius
ข่าวสารและไฮไลท์ มุ่งหวังที่จะแบ่งปันกรณีศึกษาที่ประสบความสำเร็จล่าสุดกับ Biomarker Technologies โดยรวบรวมความสำเร็จทางวิทยาศาสตร์ใหม่ๆ ตลอดจนเทคนิคที่โดดเด่นที่นำไปใช้ในระหว่างการศึกษา
เวลาโพสต์: Jan-05-2022