mRNA-seq (NGS) – ใหม่

การจัดลำดับ mRNA ช่วยให้สามารถจัดทำโปรไฟล์ของการถอดเสียง mRNA ทั้งหมดในเซลล์ภายใต้เงื่อนไขเฉพาะ และเป็นเทคโนโลยีที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในสาขาการวิจัยต่างๆ ไปป์ไลน์ mRNA-seq ของ BMKCloud De novo ได้รับการออกแบบมาเพื่อวิเคราะห์ไลบรารีลำดับที่เสริมประสิทธิภาพด้วย poly-A เมื่อไม่มีจีโนมอ้างอิง ไปป์ไลน์เริ่มต้นด้วยการควบคุมคุณภาพ ตามด้วยเดอโนโวการประกอบทรานสคริปต์และการเลือกชุดยูนิจีน การวิเคราะห์โครงสร้างยูนิยีนทำนายลำดับการเข้ารหัส (CDS) และการทำซ้ำลำดับอย่างง่าย (SSR) ต่อจากนั้น การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกันจะค้นหายีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (DEG) ในสภาวะที่ทดสอบ ตามด้วยคำอธิบายประกอบเชิงฟังก์ชันและการเพิ่มคุณค่าของ DEG เพื่อดึงข้อมูลเชิงลึกทางชีวภาพ