● มีแผง Exome สองแผงให้เลือกใช้ตามการเพิ่มคุณค่าเป้าหมายด้วยโพรบ: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) และ xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)
● การจัดลำดับบน Illumina NovaSeq
● กระบวนการทางชีวสารสนเทศมุ่งเป้าไปที่การวิเคราะห์โรคหรือการวิเคราะห์เนื้องอก
กำหนดเป้าหมายภูมิภาคการเข้ารหัสโปรตีน: โดยการดักจับและจัดลำดับบริเวณการเข้ารหัสโปรตีน hWES ถูกนำมาใช้เพื่อเปิดเผยตัวแปรที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างโปรตีน
คุ้มค่า:hWES ให้ผลประมาณ 85% ของการกลายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับโรคของมนุษย์จาก 1% ของจีโนมมนุษย์
มีความแม่นยำสูง: ด้วยความลึกของการจัดลำดับที่สูง hWES ช่วยให้การตรวจจับทั้งตัวแปรทั่วไปและตัวแปรที่หายากที่มีความถี่ต่ำกว่า 1% ง่ายขึ้น
การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวด: เราใช้จุดควบคุมหลักห้าจุดในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่างและห้องสมุด ไปจนถึงการจัดลำดับและชีวสารสนเทศศาสตร์ การตรวจสอบอย่างพิถีพิถันนี้ช่วยให้มั่นใจได้ถึงผลลัพธ์คุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
การวิเคราะห์ชีวสารสนเทศศาสตร์ที่ครอบคลุม: กระบวนการของเราเป็นมากกว่าการระบุความแปรผันของจีโนมอ้างอิง เนื่องจากรวมการวิเคราะห์ขั้นสูงที่ออกแบบมาเพื่อตอบคำถามการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับลักษณะทางพันธุกรรมของโรคหรือการวิเคราะห์เนื้องอกโดยเฉพาะ
การสนับสนุนหลังการขาย:ความมุ่งมั่นของเราขยายไปไกลกว่าการเสร็จสิ้นโครงการด้วยระยะเวลาบริการหลังการขาย 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราเสนอการติดตามผลโครงการ ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใดๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
กลยุทธ์การจับภาพ Exon | กลยุทธ์การจัดลำดับ | เอาต์พุตข้อมูลที่แนะนำ |
เลือกแน่นอน Human All Exon v6 (Agilent) หรือ xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)
| อิลลูมินา NovaSeq PE150 | 5 -10 กิกะไบต์ สำหรับความผิดปกติของเมนเดล/โรคที่หายาก: > 50x สำหรับตัวอย่างเนื้องอก: ≥ 100x |
ประเภทตัวอย่าง
| จำนวน(ควิบิต® )
| ความเข้มข้น | ปริมาณ
| ความบริสุทธิ์(NanoDrop™) |
จีโนมดีเอ็นเอ
| ≥ 50 นาโนกรัม | ≥ 6 นาโนกรัม/ไมโครลิตร | ≥ 15 ไมโครลิตร | OD260/280=1.8-2.0 ไม่มีการย่อยสลายไม่มีการปนเปื้อน
|
การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศของตัวอย่างโรค hWES ประกอบด้วย:
● การจัดลำดับการควบคุมคุณภาพข้อมูล
● การอ้างอิงการจัดตำแหน่งจีโนม
● การระบุ SNP และ InDels
● คำอธิบายประกอบการทำงานของ SNP และ InDels
การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศของตัวอย่างเนื้องอกประกอบด้วย:
● การจัดลำดับการควบคุมคุณภาพข้อมูล
● การอ้างอิงการจัดตำแหน่งจีโนม
● การระบุ SNP, InDels และการแปรผันทางโซมาติก
● การระบุสายพันธุ์เจิร์มไลน์
● การวิเคราะห์ลายเซ็นการกลายพันธุ์
● การระบุยีนของไดรฟ์ตามการกลายพันธุ์ที่ได้รับจากฟังก์ชัน
● คำอธิบายประกอบการกลายพันธุ์ที่ระดับความไวต่อยา
● การวิเคราะห์ความแตกต่าง – การคำนวณความบริสุทธิ์และพลอยดี
การควบคุมคุณภาพข้อมูล – สถิติของการจับภาพ Exome
การระบุตัวเลือกสินค้า – InDels
การวิเคราะห์ขั้นสูง: การระบุและการแจกจ่าย SNP/InDels ที่เป็นอันตราย – โครงเรื่อง Circos
การวิเคราะห์เนื้องอก: การจำแนกและการกระจายของการกลายพันธุ์ทางร่างกาย - พล็อต Circos
การวิเคราะห์เนื้องอก: เชื้อสายของโคลนอล