ปฏิสัมพันธ์ของโครมาตินตาม HI-C
คุณสมบัติบริการ
●การจัดลำดับบน Illumina Novaseq ด้วย PE150
●บริการต้องการตัวอย่างเนื้อเยื่อแทนที่จะเป็นกรดนิวคลีอิกสกัดเพื่อข้ามลิงค์ด้วยฟอร์มัลดีไฮด์และอนุรักษ์ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนดีเอ็นเอ
●การทดลอง HI-C เกี่ยวข้องกับการ จำกัด และการซ่อมแซมจุดสิ้นสุดของปลายเหนียวด้วยไบโอตินตามด้วยการทำให้เป็นวงกลมของปลายทื่อที่เกิดขึ้นในขณะที่รักษาปฏิสัมพันธ์ จากนั้น DNA จะถูกดึงลงด้วยลูกปัด Streptavidin และทำให้บริสุทธิ์สำหรับการเตรียมห้องสมุดที่ตามมา
ข้อได้เปรียบด้านการบริการ
การออกแบบเอนไซม์ จำกัด ที่ดีที่สุด: เพื่อให้แน่ใจว่ามีประสิทธิภาพสูง Hi-C ในสายพันธุ์ต่าง ๆ ที่มีคู่ปฏิสัมพันธ์ที่ถูกต้องสูงถึง 93%
บันทึกความเชี่ยวชาญและสิ่งพิมพ์ที่กว้างขวาง:BMKGENE มีประสบการณ์มากมายกับโครงการลำดับ HI-C> 2000 จาก 800 สายพันธุ์ที่แตกต่างกันและสิทธิบัตรต่างๆ ผู้ป่วยที่ตีพิมพ์มากกว่า 100 รายพร้อมปัจจัยผลกระทบสะสมมากกว่า 900
ทีมชีวสารสนเทศศาสตร์ที่มีทักษะสูง:ด้วยสิทธิบัตรภายใน บริษัท และลิขสิทธิ์ซอฟต์แวร์สำหรับการทดลอง HI-C และการวิเคราะห์ข้อมูลและซอฟต์แวร์ข้อมูลการสร้างภาพข้อมูลที่พัฒนาขึ้นด้วยตนเอง
การสนับสนุนหลังการขาย:ความมุ่งมั่นของเราครอบคลุมเกินกว่าที่โครงการจะเสร็จสิ้นด้วยระยะเวลาการบริการหลังการขาย 3 เดือน ในช่วงเวลานี้เราเสนอการติดตามโครงการความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหาและเซสชันคำถามและคำตอบเพื่อตอบคำถามใด ๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
คำอธิบายประกอบที่ครอบคลุม: เราใช้ฐานข้อมูลหลายฐานข้อมูลเพื่อเพิ่มความหลากหลายของยีนด้วยการเปลี่ยนแปลงที่ระบุและดำเนินการวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าที่สอดคล้องกันซึ่งให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับโครงการวิจัยหลายโครงการ
ข้อกำหนดบริการ
| ห้องสมุด | กลยุทธ์การเรียงลำดับ | เอาต์พุตข้อมูลที่แนะนำ | ความละเอียดของสัญญาณ Hi-C |
| ห้องสมุด Hi-C | Illumina PE150 | Chromatin Loop: 150x Tad: 50x | Chromatin Loop: 10KB TAD: 40KB |
ข้อกำหนดบริการ
| ประเภทตัวอย่าง | จำนวนเงินที่ต้องการ |
| เนื้อเยื่อสัตว์ | ≥2G |
| เลือดทั้งหมด | ≥2ml |
| เชื้อรา | ≥1g |
| เนื้อเยื่ออ่อนของพืช | 1G/ALIQUOT, 2-4 ALIQUOTES แนะนำ |
| เซลล์ที่เพาะเลี้ยง | ≥1x107 |
รวมถึงการวิเคราะห์ต่อไปนี้:
●ข้อมูลดิบ QC;
●การแมปและไลบรารี Hi-C QC: คู่ปฏิสัมพันธ์ที่ถูกต้องและเลขชี้กำลังการสลายตัวของปฏิสัมพันธ์ (IDEs);
●การทำโปรไฟล์การโต้ตอบทั่วทั้งจีโนม: การวิเคราะห์ CIS/ทรานส์และแผนที่การโต้ตอบ HI-C;
●การวิเคราะห์การกระจายช่อง A/B;
●การระบุ Tads และโครมาตินลูป;
●การวิเคราะห์ที่แตกต่างกันเกี่ยวกับองค์ประกอบโครงสร้างโครมาติน 3 มิติระหว่างตัวอย่างและคำอธิบายประกอบการทำงานที่สอดคล้องกันของยีนที่เกี่ยวข้อง
CIS และการกระจายสัดส่วนของทรานส์
ความร้อนของปฏิสัมพันธ์ระหว่างโครโมโซมระหว่างตัวอย่าง
การกระจายจีโนมทั่วทั้งช่อง A/B
การกระจายโครมาตินทั่วทั้งจีโนม
การสร้างภาพของ tads
สำรวจความก้าวหน้าด้านการวิจัยที่อำนวยความสะดวกโดยบริการลำดับ HI-C ของ BMKGENE ผ่านการรวบรวมสิ่งพิมพ์ที่รวบรวมไว้
Meng, T. et al. (2021) 'การวิเคราะห์แบบผสมผสานแบบผสมผสานแบบบูรณาการระบุว่า Ca2 เป็นเป้าหมายใหม่สำหรับ Chordoma'ระบบประสาทวิทยา, 23 (10), pp. 1709–1722 ดอย: 10.1093/neuonc/noab156
Xu, L. et al. (2021) 'ความระส่ำระสาย 3 มิติและการจัดเรียงจีโนมใหม่ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการเกิดโรคของ NAFLD โดยการเรียงลำดับ HI-C, nanopore และการจัดลำดับ RNA'Acta Pharmaceutica Sinica B, 11 (10), pp. 3150–3164 ดอย: 10.1016/j.apsb.2021.03.022
