Exclusive Agency for Korea

สินค้า

พันธุศาสตร์เชิงวิวัฒนาการ

Evolutionary Genetics เป็นบริการหาลำดับที่ครอบคลุมซึ่งออกแบบมาเพื่อนำเสนอการตีความเชิงลึกของวิวัฒนาการภายในกลุ่มบุคคลจำนวนมาก โดยพิจารณาจากการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม รวมถึง SNPs, InDels, SVs และ CNVs บริการนี้ครอบคลุมการวิเคราะห์ที่จำเป็นทั้งหมดที่จำเป็นเพื่อชี้แจงการเปลี่ยนแปลงทางวิวัฒนาการและลักษณะทางพันธุกรรมของประชากร รวมถึงการประเมินโครงสร้างประชากร ความหลากหลายทางพันธุกรรม และความสัมพันธ์ทางสายวิวัฒนาการ นอกจากนี้ ยังเจาะลึกการศึกษาเกี่ยวกับการไหลของยีน ซึ่งช่วยให้สามารถประมาณขนาดประชากรที่มีประสิทธิผลและเวลาที่ต่างกันได้ การศึกษาพันธุศาสตร์เชิงวิวัฒนาการให้ข้อมูลเชิงลึกที่มีคุณค่าเกี่ยวกับต้นกำเนิดและการปรับตัวของสายพันธุ์

ที่ BMKGENE เรามีทางเลือกสองทางสำหรับดำเนินการศึกษาพันธุศาสตร์วิวัฒนาการในประชากรจำนวนมาก: การใช้การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (WGS) หรือการเลือกใช้วิธีจัดลำดับจีโนมแบบลดการแสดงแทน หรือการใช้ชิ้นส่วนขยายเฉพาะตำแหน่งเฉพาะ (SLAF) ที่พัฒนาขึ้นภายในองค์กร แม้ว่า WGS จะเหมาะกับจีโนมที่มีขนาดเล็กกว่า แต่ SLAF ก็กลายเป็นทางเลือกที่คุ้มค่าสำหรับการศึกษาประชากรขนาดใหญ่ที่มีจีโนมยาวกว่า ซึ่งช่วยลดต้นทุนในการเรียงลำดับได้อย่างมีประสิทธิภาพ

ติดต่อเรา

รายละเอียดบริการ

ชีวสารสนเทศศาสตร์

ผลการสาธิต

สิ่งพิมพ์เด่น

ข้อดีของการบริการ

ทาคางิ และคณะวารสารพืช, 2013

การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศที่ครอบคลุม:ทำให้สามารถประมาณความหลากหลายทางพันธุกรรม ซึ่งสะท้อนถึงศักยภาพวิวัฒนาการของสายพันธุ์ และเผยให้เห็นความสัมพันธ์ทางสายวิวัฒนาการที่เชื่อถือได้ระหว่างสายพันธุ์โดยมีอิทธิพลน้อยที่สุดของการวิวัฒนาการมาบรรจบกันและวิวัฒนาการคู่ขนาน

การวิเคราะห์ที่กำหนดเองเพิ่มเติม: เช่น การประมาณเวลาและความเร็วของความแตกต่างโดยพิจารณาจากความแปรผันของระดับนิวคลีโอไทด์และกรดอะมิโน

บันทึกความเชี่ยวชาญและสิ่งพิมพ์ที่กว้างขวาง: BMKGene สั่งสมประสบการณ์มากมายในโครงการด้านประชากรและพันธุศาสตร์วิวัฒนาการมานานกว่า 15 ปี ครอบคลุมสัตว์หลายพันสายพันธุ์ ฯลฯ และมีส่วนร่วมในโครงการระดับสูงมากกว่า 1,000 โครงการที่ตีพิมพ์ใน Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal เป็นต้น

● ทีมชีวสารสนเทศที่มีทักษะสูงและวงจรการวิเคราะห์ที่สั้น: ด้วยประสบการณ์อันยอดเยี่ยมในการวิเคราะห์จีโนมิกส์ขั้นสูง ทีมงานของ BMKGene จึงนำเสนอการวิเคราะห์ที่ครอบคลุมโดยใช้เวลาดำเนินการที่รวดเร็ว

● การสนับสนุนหลังการขาย:ความมุ่งมั่นของเราขยายไปไกลกว่าการเสร็จสิ้นโครงการด้วยระยะเวลาบริการหลังการขาย 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราเสนอการติดตามผลโครงการ ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใดๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์

ข้อมูลจำเพาะและข้อกำหนดของบริการ

ประเภทของลำดับ

ขนาดประชากรที่แนะนำ

กลยุทธ์การจัดลำดับ

ข้อกำหนดของนิวคลีโอไทด์

การหาลำดับจีโนมทั้งหมด

≥ 30 คน โดยมี ≥ 10 คนจากแต่ละกลุ่มย่อย

10x

ความเข้มข้น: ≥ 1 ng/ µL

จำนวนรวม≥ 30ng

จำกัดหรือไม่มีการย่อยสลายหรือการปนเปื้อน

ชิ้นส่วนขยายเฉพาะจุด (SLAF)

ความลึกของแท็ก:

10x

จำนวนแท็ก:

<400 Mb: แนะนำให้ใช้ WGS

<1Gb: 100,000 แท็ก

1GB

>2Gb: แท็ก 300K

แท็กสูงสุด 500,000 แท็ก

ความเข้มข้น ≥ 5 นาโนกรัม/ไมโครลิตร

จำนวนรวม ≥ 80 ng

นาโนดรอป OD260/280=1.6-2.5

เจลอะกาโรส: ไม่มีหรือจำกัดการย่อยสลายหรือการปนเปื้อน

ขั้นตอนการทำงานบริการ

การออกแบบการทดลอง

การจัดส่งตัวอย่าง

การก่อสร้างห้องสมุด

การเรียงลำดับ

การวิเคราะห์ข้อมูล

บริการหลังการขาย

ก่อนหน้า: การวิเคราะห์แยกกลุ่มแบบเป็นกลุ่ม

ต่อไป: เมแทบอลิซึม

บริการรวมถึงการวิเคราะห์โครงสร้างประชากร (ต้นไม้สายวิวัฒนาการ, PCA, แผนภูมิการแบ่งชั้นประชากร), ความหลากหลายของประชากร และการคัดเลือกประชากร (ความไม่สมดุลของการเชื่อมโยง การเลือกกวาดล้างของสถานที่ที่ได้เปรียบ) บริการนี้ยังรวมถึงการวิเคราะห์แบบกำหนดเอง (เช่น เวลาความแตกต่าง การไหลของยีน)

*ผลลัพธ์การสาธิตที่แสดงที่นี่ทั้งหมดมาจากจีโนมที่เผยแพร่ด้วย BMKGENE

1.การวิเคราะห์วิวัฒนาการประกอบด้วยการสร้างต้นไม้สายวิวัฒนาการ โครงสร้างประชากร และ PCA ตามความแปรผันทางพันธุกรรม

ต้นไม้สายวิวัฒนาการแสดงถึงความสัมพันธ์ทางอนุกรมวิธานและวิวัฒนาการระหว่างสปีชีส์ที่มีบรรพบุรุษร่วมกัน
PCA มุ่งหวังที่จะเห็นภาพความใกล้ชิดระหว่างประชากรย่อย
โครงสร้างประชากรแสดงให้เห็นถึงการมีอยู่ของประชากรย่อยที่แตกต่างกันทางพันธุกรรมในแง่ของความถี่อัลลีล

3-1ต้นไม้สายวิวัฒนาการ 3-2PCA 3-3โครงสร้างประชากร

เฉิน ฯลฯ อัล.พนส, 2020

2. การกวาดแบบเลือกสรร

การกวาดล้างแบบเลือกหมายถึงกระบวนการที่เลือกสถานที่ที่ได้เปรียบและความถี่ของไซต์ที่เป็นกลางที่เชื่อมโยงเพิ่มขึ้น และความถี่ของไซต์ที่ไม่เชื่อมโยงลดลง ส่งผลให้ภูมิภาคลดลง

การตรวจจับทั่วทั้งจีโนมในพื้นที่กวาดแบบเลือกนั้นได้รับการประมวลผลโดยการคำนวณดัชนีพันธุกรรมของประชากร (π， Fst, D ของทาจิมะ) ของ SNP ทั้งหมดภายในหน้าต่างเลื่อน (100 Kb) ที่ขั้นตอนที่แน่นอน (10 Kb)

ความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์(π)
4ความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์(π)

D. ทาจิมะ
5ทาจิมะ-ดี

ดัชนีการตรึง (Fst)

6ดัชนีการตรึง(Fst)

วู ฯลฯ อัล.พืชโมเลกุล, 2018

3.ยีนโฟลว์

7 การไหลของยีน

วู ฯลฯ อัล.พืชโมเลกุล, 2018

4.ประวัติประชากร

8ประวัติศาสตร์ประชากร

จาง ฯลฯ อัล.นิเวศวิทยาธรรมชาติและวิวัฒนาการ, 2021

5.เวลาที่แตกต่าง

9ความแตกต่าง-เวลา

จาง ฯลฯ อัล.นิเวศวิทยาธรรมชาติและวิวัฒนาการ, 2021

สำรวจความก้าวหน้าที่อำนวยความสะดวกโดยบริการพันธุศาสตร์วิวัฒนาการของ BMKGene ผ่านคอลเล็กชั่นสิ่งพิมพ์ที่รวบรวมไว้:

ฮัสซันยาร์ AK และคณะ (2023) 'การค้นพบเครื่องหมายโมเลกุล SNP และยีนผู้สมัครที่เกี่ยวข้องกับการต้านทานไวรัส Sacbrood ในตัวอ่อน Apis cerana cerana ตัวอ่อนโดยการสร้างลำดับจีโนมทั้งหมด'วารสารนานาชาติด้านวิทยาศาสตร์โมเลกุล, 24(7). ดอย: 10.3390/IJMS24076238.

ชัยเจและคณะ (2022) 'การค้นพบซาลาแมนเดอร์ยักษ์จีนที่มีพันธุกรรมบริสุทธิ์จากธรรมชาติสร้างโอกาสใหม่ในการอนุรักษ์'การวิจัยทางสัตววิทยา, 2565 ฉบับที่. 43, ฉบับที่ 3, หน้า: 469-480, 43(3), หน้า 469–480. ดอย: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.

ฮัน เอ็ม และคณะ (2022) 'รูปแบบทางพฤกษศาสตร์และประวัติวิวัฒนาการของประชากรของชนพื้นเมือง Elymus sibiricus L. บนที่ราบสูงชิงไห่-ทิเบต'พรมแดนด้านพืชศาสตร์, 13, น. 882601. ดอย: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.

วังเจและคณะ (2565) 'ข้อมูลเชิงลึกทางพันธุกรรมเกี่ยวกับวิวัฒนาการของลำไยจากการประกอบจีโนมระดับโครโมโซมและจีโนมประชากรของการภาคยานุวัติลำไย',การวิจัยพืชสวน, 9. ดอย: 10.1093/HR/UHAC021.