แพลตฟอร์ม:MGI-DNBSEQ-T7
โหมดการเรียงลำดับ:PE150
โอนห้องสมุดอิลลูมินาไปยังMGI:การเปิดใช้งานการจัดลำดับปริมาณข้อมูลสูงในราคาต่ำ
การควบคุมคุณภาพของไลบรารีก่อนการจัดลำดับ
การจัดลำดับข้อมูล QC และการจัดส่ง:การส่งรายงาน QC และข้อมูลดิบในรูปแบบ FASTQ หลังจากการอ่าน demultiplexing และกรอง Q30 อ่าน
ความหลากหลายของบริการการจัดลำดับ:ลูกค้าอาจเลือกที่จะจัดลำดับตามเลนหรือจำนวนข้อมูล
เอาต์พุตข้อมูลสูง:1,500 GB/Lane
การส่งรายงาน QC ลำดับ:ด้วยตัวชี้วัดที่มีคุณภาพความแม่นยำของข้อมูลและประสิทธิภาพโดยรวมของโครงการลำดับ
กระบวนการจัดลำดับที่เป็นผู้ใหญ่:ด้วยเวลาหมุนรอบสั้น ๆ
การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวด: เราใช้ข้อกำหนด QC ที่เข้มงวดเพื่อรับประกันการส่งมอบผลลัพธ์ที่มีคุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
จำนวนข้อมูล (x) | ความเข้มข้น (qpcr/nm) | ปริมาณ | |
ช่องทางบางส่วน
| x ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 นาโนเมตร | ≥ 25 μl | |
50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 นาโนเมตร | ≥ 25 μl | |
x> 100 gb | ≥ 4 nm | ||
เลนเดี่ยว | ต่อเลน | ≥ 1.5 นาโนเมตร / พูลห้องสมุด | ≥ 25 μl / พูลไลบรารี |
นอกเหนือจากความเข้มข้นและปริมาณทั้งหมดแล้วยังต้องมีรูปแบบสูงสุดที่เหมาะสมเช่นกัน
หมายเหตุ: การจัดลำดับช่องทางของห้องสมุดที่มีความหลากหลายต่ำต้องใช้ PHIX Spike-in เพื่อให้แน่ใจว่าการโทรฐานที่แข็งแกร่ง
เราขอแนะนำให้ส่งไลบรารีก่อนที่เป็นตัวอย่าง หากคุณต้องการให้ BMKGENE ดำเนินการรวมห้องสมุดโปรดดูที่ไฟล์
ข้อกำหนดของห้องสมุดสำหรับการจัดลำดับเลนบางส่วน
จุดสูงสุดหลักควรอยู่ภายใน 300-450 bp
ห้องสมุดควรมีจุดสูงสุดหลักเดียวไม่มีการปนเปื้อนของอะแดปเตอร์และไม่มี dimers ไพรเมอร์
รายงานคุณภาพของห้องสมุดมีให้ก่อนการจัดลำดับการประเมินจำนวนห้องสมุดและการกระจายตัว
ตารางที่ 1 สถิติเกี่ยวกับข้อมูลการจัดลำดับ
ID ตัวอย่าง | bmkid | อ่านดิบ | ข้อมูลดิบ (BP) | ทำความสะอาดอ่าน (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
รูปที่ 1. การกระจายคุณภาพตามการอ่านในแต่ละตัวอย่าง
รูปที่ 2. การกระจายเนื้อหาพื้นฐาน
รูปที่ 3. การกระจายเนื้อหาการอ่านในการจัดลำดับข้อมูล