สินค้า

*ผลการสาธิตที่แสดงที่นี่ทั้งหมดมาจากจีโนมที่ตีพิมพ์ด้วยเทคโนโลยีชีวภาพ

1. การประมาณเวลาแทรก LTR: รูปที่แสดงการกระจาย bimodal ที่เป็นเอกลักษณ์ในเวลาแทรก LTR-RTS ในจีโนมไรย์ที่มีไวอยู่เมื่อเทียบกับสายพันธุ์อื่น ๆ จุดสูงสุดล่าสุดปรากฏขึ้นเมื่อประมาณ 0.5 ล้านปีก่อน

Li Guang et al.พันธุศาสตร์ธรรมชาติ, 2021

2.Phylogeny และการวิเคราะห์ตระกูลยีนเกี่ยวกับ Chayote (SECHIUM Edule): โดยการวิเคราะห์ chayote และอีก 13 สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องในตระกูลยีนพบว่ามีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดที่สุดกับงูมะระ (Trichosanthes Anguina) Chayote ได้มาจากงูมะระในประมาณ 27-45 mya และการทำซ้ำจีโนมทั้งหมด (WGD) ถูกพบใน Chayote ใน 25 ± 4 mya ซึ่งเป็นเหตุการณ์ WGD ที่สามใน Cucuibitaceae

fu a et al.การวิจัยพืชสวน, 2021

3.Synteny การวิเคราะห์: ยีนบางชนิดที่เกี่ยวข้องกับไฟโตฮอร์โมนในการพัฒนาผลไม้พบได้ใน chayote, งูมะระและสควอช ความสัมพันธ์ระหว่าง chayote และสควอชสูงกว่านั้นเล็กน้อยระหว่าง chayote และงูมะระ

fu a et al.การวิจัยพืชสวน, 2021

4. การวิเคราะห์ครอบครัวของ Gene: การเพิ่มคุณค่าของ Kegg เกี่ยวกับการขยายตัวของครอบครัวยีนและการหดตัวใน G.thurberi และ G.davidsonii Genomes แสดงให้เห็นว่าการสังเคราะห์สเตียรอยด์และการสังเคราะห์ brassinosteroid biosynthesis

Yang Z et al.ชีววิทยา BMC, 2021

5. การวิเคราะห์การทำสำเนาจีโนมแบบ whole: การวิเคราะห์การกระจาย 4DTV และ KS แสดงเหตุการณ์การทำซ้ำจีโนมทั้งหมด ยอดของ intraspecies แสดงเหตุการณ์การทำซ้ำ ยอดของ interspecies แสดงเหตุการณ์ speciation การวิเคราะห์ชี้ให้เห็นว่าเมื่อเปรียบเทียบกับอีกสามสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด O. Europaea ผ่านการทำซ้ำของยีนขนาดใหญ่เมื่อเร็ว ๆ นี้

Rao G et al.การวิจัยพืชสวน, 2021

กรณี BMK

Rose Without Prickle: ข้อมูลเชิงลึกของจีโนมเชื่อมโยงกับการปรับความชื้น

ที่ตีพิมพ์: รีวิววิทยาศาสตร์แห่งชาติ, 2021

กลยุทธ์การเรียงลำดับ:

'Baseye'sไม่มีหนาม'(อาร์Wichurainan) จีโนม:
ประมาณ 93 x Pacbio + ประมาณ 90 x nanopore + 267 x Illumina

ผลลัพธ์ที่สำคัญ

1. จีโนมที่มีคุณภาพสูง R.Wichuraiana ถูกสร้างขึ้นโดยใช้เทคนิคการเรียงลำดับที่อ่านมานานซึ่งให้การประกอบ 530.07 MB (ขนาดจีโนมโดยประมาณประมาณ 525.9 MB โดยการไหลของไซโตเมทรีและ 525.5 โดยการสำรวจจีโนม； heterozygosity ประมาณ 1.03%) คะแนนโดยประมาณของ Busco คือ 93.9% เมื่อเปรียบเทียบกับ“ Blush เก่า” (Haploob) คุณภาพและความสมบูรณ์ของจีโนมนี้ได้รับการยืนยันโดยความแม่นยำฐานฐานเดี่ยวและดัชนีแอสเซมบลี LTR (LAI = 20.03) จีโนม R.Wichuraiana มียีนการเข้ารหัสโปรตีน 32,674 ยีน

2. การวิเคราะห์ร่วมกันของ Multi-Omics ซึ่งประกอบด้วยจีโนมเปรียบเทียบ, transcriptomics, การวิเคราะห์ QTL ของประชากรทางพันธุกรรม, เผยให้เห็นการเก็งกำไรที่สำคัญระหว่าง R. wichuraiana และ Rosa chinensis นอกจากนี้การเปลี่ยนแปลงการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องใน QTL มีแนวโน้มที่จะเกี่ยวข้องกับการสร้างลวดลายหนามของลำต้น

การเปรียบเทียบจีโนม anaysis ระหว่าง basye; s thornless และ rosa chinensis รวมถึงการวิเคราะห์ synteny, กลุ่มตระกูลยีน, การขยายตัวและการวิเคราะห์การหดตัวเผยให้เห็นการเปลี่ยนแปลงจำนวนมากซึ่งเกี่ยวข้องกับลักษณะสำคัญในดอกกุหลาบ การขยายตัวที่ไม่เหมือนใครในตระกูลยีน NAC และ FAR1/FRS มีแนวโน้มที่จะเกี่ยวข้องกับการต่อต้านจุดดำ

Zhong, M. , et al. “ Rose Without Prickle: ข้อมูลเชิงลึกของจีโนมเชื่อมโยงกับการปรับความชื้น”รีวิววิทยาศาสตร์แห่งชาติ, 2021;, NWAB092