การประกอบจีโนมแบคทีเรียเดอโนโว
เราให้บริการชุดประกอบจีโนมแบคทีเรียที่สมบูรณ์รับประกัน 0 ช่องว่าง สิ่งนี้เป็นไปได้โดยการรวมเทคโนโลยีการเรียงลำดับที่อ่านมายาวนานเช่น nanopore และ PACBIO สำหรับการประกอบและลำดับการอ่านระยะสั้นกับ Illumina สำหรับการตรวจสอบความถูกต้องของแอสเซมบลีและการแก้ไขข้อผิดพลาดของการอ่าน ONT บริการของเราให้บริการเวิร์กโฟลว์ทางชีวภาพที่สมบูรณ์จากการประกอบคำอธิบายประกอบการทำงานและการวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศขั้นสูงบรรลุเป้าหมายการวิจัยที่เฉพาะเจาะจง บริการนี้ช่วยให้การพัฒนาจีโนมอ้างอิงที่แม่นยำสำหรับการศึกษาทางพันธุกรรมและจีโนมต่างๆ นอกจากนี้ยังเป็นพื้นฐานสำหรับการใช้งานเช่นการเพิ่มประสิทธิภาพความเครียดพันธุวิศวกรรมและการพัฒนาเทคโนโลยีจุลินทรีย์เพื่อให้มั่นใจว่าข้อมูลจีโนมที่เชื่อถือได้และปราศจากช่องว่างที่สำคัญสำหรับการพัฒนาข้อมูลเชิงลึกทางวิทยาศาสตร์และนวัตกรรมเทคโนโลยีชีวภาพ
คุณสมบัติบริการ
●มีสองตัวเลือกที่เป็นไปได้ให้เลือกขึ้นอยู่กับระดับความสมบูรณ์ของจีโนมที่ต้องการ
●ตัวเลือกจีโนมร่าง: การเรียงลำดับการอ่านระยะสั้นกับ Illumina Novaseq PE150
●กรอกจีโนม 0 ช่องว่าง
●การเรียงลำดับอ่านมานานบน Nanopore Promethion 48 หรือ Pacbio revio สำหรับการประกอบจีโนม
●การเรียงลำดับระยะสั้นอ่านบน Illumina Novaseq สำหรับการตรวจสอบจีโนมและการแก้ไขข้อผิดพลาด (nanopore) หรือเพื่อสร้างร่างจีโนม
ข้อได้เปรียบด้านการบริการ
รับประกันจีโนม Zero-Gap: นี่เป็นเพราะการรวมลำดับของการจัดลำดับอิลลูมินากับลำดับการอ่านยาว (nanopore หรือ pacbio)
ขั้นตอนการทำงานทางชีวสารสนเทศศาสตร์ที่สมบูรณ์:ซึ่งรวมถึงการประกอบจีโนมและการทำนายขององค์ประกอบจีโนมหลายรายการคำอธิบายประกอบของยีนที่ใช้งานได้และการแสดงให้เห็นถึงจีโนมเช่นพล็อต Circos
ความเชี่ยวชาญอย่างกว้างขวาง: ด้วยจีโนมจุลินทรีย์มากกว่า 20,000 ตัวที่รวมตัวกัน BMKGENE นำประสบการณ์มานานกว่าทศวรรษทีมวิเคราะห์ที่มีทักษะสูงเนื้อหาที่ครอบคลุมและการสนับสนุนหลังการขายที่ยอดเยี่ยม
การสนับสนุนหลังการขาย:ความมุ่งมั่นของเราครอบคลุมเกินกว่าที่โครงการจะเสร็จสิ้นด้วยระยะเวลาการบริการหลังการขาย 3 เดือน ในช่วงเวลานี้เราเสนอการติดตามโครงการความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหาและเซสชันคำถามและคำตอบเพื่อตอบคำถามใด ๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
มีกลยุทธ์การเรียงลำดับหลายอย่าง:สำหรับเป้าหมายการวิจัยที่แตกต่างกันและข้อกำหนดของความสมบูรณ์ของจีโนม
ข้อกำหนดบริการ
| บริการ | กลยุทธ์การเรียงลำดับ |
| ร่างจีโนม | Illumina PE150 100X |
| 0 Gap Genome | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio Hifi 30x + Illumina PE150 100X (ไม่บังคับ) |
ข้อกำหนดตัวอย่าง:
| ความเข้มข้น (ng/µl) | จำนวนเงินทั้งหมด (µg) | ระดับเสียง (µl) | OD260/280 | OD260/230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| นาโน | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| อิลลูมินา | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
·แบคทีเรีย: ≥3.5x1010 เซลล์
งานบริการ
การส่งตัวอย่าง
การก่อสร้างห้องสมุด
การเรียงลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
รวมถึงการวิเคราะห์ต่อไปนี้:
●การจัดลำดับการควบคุมคุณภาพข้อมูล
●การประกอบจีโนม
●การวิเคราะห์องค์ประกอบจีโนม: การทำนายซีดีและองค์ประกอบจีโนมหลายชนิด
●คำอธิบายประกอบการใช้งานที่มีฐานข้อมูลทั่วไปหลายแห่ง (GO, KEGG, ฯลฯ ) และฐานข้อมูลขั้นสูง (การ์ด, VFDB ฯลฯ )
●การสร้างภาพจีโนม
เราให้จีโนมในรูปแบบ FASTA ที่เข้าถึงได้ง่ายและไฟล์คำอธิบายประกอบจีโนม (GFF)
คำอธิบายประกอบของยีน - ไป
คำอธิบายประกอบของยีน - คาร์โบไฮเดรต cazy
การสร้างภาพจีโนม - พล็อต Circos
สำรวจความก้าวหน้าที่อำนวยความสะดวกโดยบริการประกอบจีโนมแบคทีเรียของ BMKGENE ผ่านการรวบรวมสิ่งพิมพ์ที่รวบรวมไว้
Dai, W. et al. (2023) 'การค้นพบ Bacteroides Uniformis F18-22 เป็นแบคทีเรียโปรไบโอติกที่ปลอดภัยและแปลกใหม่สำหรับการรักษาอาการลำไส้ใหญ่บวม ulcerative จากลำไส้ใหญ่ของมนุษย์ที่มีสุขภาพดี'วารสารวิทยาศาสตร์โมเลกุลระหว่างประเทศ, 24 (19), p. 14669. ดอย: 10.3390/ijms241914669/s1
Kang, Q. et al. (2021) 'proteus mirabilis ที่ทนต่อหลายคนที่มีความต้านทานหลายชนิดที่มี Blaoxa-1 และ Blandm-1 จากสัตว์ป่าในประเทศจีน: การเพิ่มความเสี่ยงต่อสุขภาพของประชาชน',สัตววิทยาบูรณาการ, 16 (6), pp. 798–809 ดอย: 10.1111/1749-4877.12510
Wang, Tt et al. (2017) 'ลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของ Endophyte Bacillus Flexus KLBMP 4941 เผยกลไกการส่งเสริมการเจริญเติบโตของพืชและพื้นฐานทางพันธุกรรมสำหรับการทนเกลือ'วารสารเทคโนโลยีชีวภาพ, 260, pp. 38–41 ดอย: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001
Wang, X. et al. (2021) 'พลาสมิดความต้านทานหลายการจำลองของ Klebsiella ไกล่เกลี่ยการเผยแพร่อย่างกว้างขวางของยีนต้านจุลชีพ'ชายแดนในจุลชีววิทยา, 12, p. 754931. ดอย: 10.3389/fmicb.2021.754931/bibtex
