16S/18S/AMPLICON SEQUENCING-NGS
คุณสมบัติบริการ
●แพลตฟอร์มการจัดลำดับ: Illumina Novaseq
●การขยายพื้นที่สั้น ๆ ของ 16s, 18s และ ITS ท่ามกลางเป้าหมายการขยายอื่น ๆ
●ตัวเลือกที่ยืดหยุ่นของแอมป์
●ประสบการณ์โครงการก่อนหน้านี้มีเป้าหมายการขยายหลายเป้าหมาย
ข้อได้เปรียบด้านการบริการ
ปราศจากการแยก:การระบุองค์ประกอบของจุลินทรีย์อย่างรวดเร็วในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม
ความละเอียดสูง: ในส่วนประกอบที่มีความอุดมสมบูรณ์ต่ำในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม
ใช้กันอย่างแพร่หลาย: การศึกษาชุมชนจุลินทรีย์ที่หลากหลาย
การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศที่ครอบคลุม: แพ็คเกจ QIIME2 ล่าสุด (ข้อมูลเชิงลึกเชิงปริมาณเกี่ยวกับนิเวศวิทยาจุลินทรีย์) พร้อมการวิเคราะห์ที่หลากหลายในแง่ของฐานข้อมูล, คำอธิบายประกอบ, OTU/ASV
ความเชี่ยวชาญอย่างกว้างขวาง: ด้วยโครงการลำดับแอมป์ 150,000 โครงการที่ดำเนินการเป็นประจำทุกปี BMKGENE นำประสบการณ์มานานกว่าทศวรรษทีมวิเคราะห์ที่มีทักษะสูงเนื้อหาที่ครอบคลุมและการสนับสนุนหลังการขายที่ยอดเยี่ยม
ข้อกำหนดบริการ
| ห้องสมุด | กลยุทธ์การเรียงลำดับ | ข้อมูลแนะนำ |
| เครื่องขยายเสียง | Illumina PE250 | แท็ก 50/100/300K (อ่านคู่) |
ข้อกำหนดบริการ
| ความเข้มข้น (ng/µl) | จำนวนเงินทั้งหมด (NG) | ระดับเสียง (µl) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
●ดิน/กากตะกอน: 1-2G
●สัตว์ในลำไส้-สัตว์: 0.5-2G
●เนื้อหาในลำไส้-insect: 0.1-0.25g
●พื้นผิวพืช (ตะกอนที่อุดมไปด้วย): 0.1-0.5g
●การหมักน้ำซุปที่อุดมไปด้วย): 0.1-0.5g
●อุจจาระ (สัตว์ขนาดใหญ่): 0.5-2G
●อุจจาระ (เมาส์): 3-5grains
●ของเหลวล้างถุงน้ำปอด: กระดาษกรอง
● swab ในช่องคลอด: 5-6 swabs
●ผิวหนัง/อวัยวะเพศ/น้ำลาย/เนื้อเยื่ออ่อนช่องปาก/swab swab/swab ทวารหนัก: 2-3 swabs
●จุลินทรีย์พื้นผิว: กระดาษกรอง
● waterbody/air/biofilm: กระดาษกรอง
● Endophytes: 1-2G
●คราบจุลินทรีย์: 0.5-1G
งานบริการ
การส่งตัวอย่าง
การก่อสร้างห้องสมุด
การเรียงลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
รวมถึงการวิเคราะห์ต่อไปนี้:
- การควบคุมคุณภาพข้อมูลดิบ
- การจัดกลุ่ม OTU /de-noise (ASV)
- คำอธิบายประกอบ OTU
- การวิเคราะห์ความหลากหลายของอัลฟ่า: ดัชนีหลายอย่างรวมถึงแชนนอนซิมป์สันและเอซ
- การวิเคราะห์ความหลากหลายของเบต้า
- การวิเคราะห์ระหว่างกลุ่ม
- การวิเคราะห์ความสัมพันธ์: ระหว่างปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อมและองค์ประกอบและความหลากหลาย
- การทำนายยีนที่ใช้งานได้ 16S
ฮิสโตแกรมของการกระจายอนุกรมวิธาน
แผนที่ความร้อนจัดกลุ่มอนุกรมวิธาน
การวิเคราะห์ความหลากหลายของอัลฟ่า: เส้นโค้งการหายาก
การวิเคราะห์ความหลากหลายของเบต้า: NMDS
การวิเคราะห์ระหว่างกลุ่ม: การค้นพบ Biomarker LEFSE
สำรวจความก้าวหน้าที่อำนวยความสะดวกโดยบริการลำดับแอมป์ของ BMKGENE กับ Illumina ผ่านคอลเล็กชั่นสิ่งพิมพ์ที่รวบรวมไว้
Dong, C. et al. (2022) 'การชุมนุม, microbiota หลักและการทำงานของดินไรโซสเฟียร์และเปลือกจุลินทรีย์ใน Eucommia ulmoides', พรมแดนในจุลชีววิทยา, 13. DOI: 10.3389/FMICB.2022.855317/เต็ม
Li, Y. et al. (2023) 'การปลูกถ่ายแบคทีเรียสังเคราะห์ consortia สำหรับการรักษา vaginosis แบคทีเรียที่เกิดจาก gardnerella vaginalis ในหนู', microbiome, 11 (1), pp. 1–14 ดอย: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J. , Fu, Y. และ Liu, H. (2022) 'microbiomes ของฝุ่นอากาศที่เก็บรวบรวมในระหว่างการทดลองช่วยชีวิต bioregenerative ปิดภาคพื้นดิน“ Lunar Palace 365”', microbiomes สิ่งแวดล้อม, 17 (1), pp 1–20. ดอย: 10.1186/S40793-022-00399-0/ตัวเลข/8
Yin, S. et al. (2022) 'ความอุดมสมบูรณ์ขึ้นอยู่กับวัตถุดิบของยีนการทำงานที่เกี่ยวข้องกับการสูญเสียไนโตรเจนที่ควบคุมการเปลี่ยนแปลงไนโตรเจนในการทำปุ๋ยหมัก', เทคโนโลยี Bioresource, 361, p. 127678. ดอย: 10.1016/j.biortech.2022.127678
