пайдарпайии РНК прокариотӣ
Вижагиҳо
● Коркарди намунаи РНК камшавии rRNA ва пас аз омодасозии китобхонаи РНК-ро дар бар мегирифт.
● Таҳлили биоинформатикӣ дар асоси мутобиқшавӣ ба геноми истинод
● Таҳлил ифодаи генҳо ва DEGs, инчунин сохтори транскрипт ва таҳлили sRNA-ро дар бар мегирад
Афзалиятҳои хидматрасонӣ
●Назорати қатъии сифат: мо нуқтаҳои асосии назоратиро дар тамоми марҳилаҳо, аз омодасозии намуна ва китобхона то пайдарпайӣ ва биоинформатика татбиқ мекунем. Ин мониторинги дақиқ таъмин намудани натиҷаҳои пайвастаи баландсифатро таъмин мекунад.
●Маълумот дар бораи пайдарпайии ришта: аз сабаби омодагии китобхонаи RNA самтбахш буда, имкон медиҳад, ки стенограммаҳои зидди ҳиссиёт муайян карда шаванд.
●Таҳлили мукаммал, ки ба транскриптомҳои прокариотӣ мутобиқ карда шудааст: лӯлаи биоинформатикӣ на танҳо таҳлили ифодаи ген, балки инчунин таҳлили сохтори транскрипт, аз ҷумла муайян кардани оперонҳо, UTRҳо ва промоутерҳоро дар бар мегирад. Он инчунин таҳлили sRNAs, яъне шарҳ ва пешгӯии сохтор ва ҳадафҳои дуюмдараҷаро дар бар мегирад.
●Дастгирии пас аз фурӯш: ӯҳдадории мо пас аз анҷоми лоиҳа бо мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯш фаротар аст. Дар ин муддат мо пайгирии лоиҳа, кӯмак барои бартараф кардани мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои ҳалли ҳама гуна дархостҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод мекунем.
Талаботи намунавӣ ва интиқол
| Китобхона | Стратегияи пайдарпай | Маълумот тавсия дода мешавад | Назорати сифат |
| Китобхонаи самти rRNA тамом шуд | Illumina PE150 | 1-2 Гб | Q30≥85% |
Талаботи намунавӣ:
| Консентрат (нг/мкл) | Миқдор (мкг) | Покӣ | Беайбӣ |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280 = 1,8-2,0 OD260/230=1,0-2,5 Маҳдуд ё тамоман ифлосшавии протеин ё ДНК дар гел нишон дода шудааст. | RIN≥6,5 |
Интиқоли намунаи тавсияшуда
Контейнер: 2 мл найчаи центрифуга (фолгаи тунука тавсия дода намешавад)
Тамғагузории намуна: Гурӯҳ+такрор, масалан, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Интиқол:
1. Ях хушк: Намунаҳо бояд дар халтаҳо баста шаванд ва дар яхи хушк дафн карда шаванд.
2. Намудҳои RNAstable: Намунаҳои РНК-ро дар найчаи устуворсозии РНК (масалан, RNAstable®) хушк кардан мумкин аст ва дар ҳарорати хона интиқол дода мешавад.
Раванди кори хидмат
Интиқоли намуна
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Раванди таҳлили биоинформатикӣ
Таҳлили зеринро дар бар мегирад:
● Назорати сифати маълумоти хом
● Ҳамоҳангсозӣ ба геноми истинод
● Арзёбии сифати китобхона: тасодуфии тақсимоти РНК, андозаи воридкунӣ ва сершавии пайдарпай
● Шарҳи функсионалии генҳои пешгӯии рамзгузорӣ
● Таҳлили ифода: коррелятсия ва таҳлили ҷузъҳои асосӣ (PCA)
● Экспрессияи генҳои дифференсиалӣ (DEGs)
● Тавсифи функсионалӣ ва ғанисозии DEG
● Таҳлили sRNA: пешгӯӣ, эзоҳ, ҳадаф ва пешгӯии сохтори дуюмдараҷа
● Таҳлили сохтори транскрипт: оперонҳо, мавқеъҳои оғоз ва ниҳоӣ, минтақаи тарҷуманашуда (UTS), промоутер ва таҳлили SNP/InDel
Сатҳи секвенсия
Аннотацияи функсионалии генҳои рамзгузорӣ
Муносибати байни намунаҳо
Таҳлили генҳои дифференсиалии ифодашуда (DEGs).
Таҳлили ғанисозии функсионалӣ
Аннотацияи sRNA
Пешрафтҳоеро, ки аз ҷониби хадамоти пайдарпайии пурраи mRNA-и Nanopore BMKGene мусоидат мекунанд, дар ин нашрияи барҷаста омӯзед.
Гуан, CP ва дигарон. (2018) 'Тағйироти глобалии транскриптомии биофилм ташаккулдиҳандаи Staphylococcus epidermidis, ки ба алкалоидҳои умумии Sophorea alopecuroides вокуниш нишон медиҳанд',Маҷаллаи Полша оид ба микробиология, 67(2), с. 223. дои: 10.21307 / PJM-2018-024.
