-
Маҷмӯаҳои асбобҳо
BMKCloud як платформаи пешбари биоинформатикӣ мебошад, ки ҳалли якдафъаина барои барномаҳои геномӣ мебошад, ки ба он муҳаққиқон дар арсаҳои гуногун, аз ҷумла тиббӣ, кишоварзӣ, экологӣ ва ғайра эътимоди зиёд доранд. BMKCloud ӯҳдадор аст, ки хидматҳои ҳамгирошуда, боэътимод ва муассир, аз ҷумла платформаҳо ва абзорҳои таҳлили биоинформатикиро пешниҳод кунад. , захираҳои компютерӣ, базаи ҷамъиятӣ, курсҳои онлайни биоинформатикӣ ва ғайра. BMKCloud дорои воситаҳои гуногуни биоинформатикии зуд-зуд истифодашаванда, аз ҷумла шарҳи генҳо, воситаҳои генетикии эволютсионӣ, ncRNA, назорати сифати додаҳо, васлкунӣ, ҳамоҳангсозӣ, истихроҷи маълумот, мутатсияҳо, омор, генератори фигураҳо, таҳлили пайдарпай ва ғайра.
-
De novo Ассамблеяи геномҳои бактериявӣ
Мо хидмати пурраи васлкунии геномҳои бактериявиро пешниҳод мекунем, ки 0 холигоҳро кафолат медиҳад. Ин тавассути ҳамгироии технологияҳои пайдарпайии дарозмуддат, аз қабили Nanopore ва PacBio барои васлкунӣ ва пайдарпаии кӯтоҳмуддат бо Illumina барои тасдиқи васлкунӣ ва ислоҳи хатогиҳои хондани ONT имконпазир аст. Хидмати мо ҷараёни мукаммали кори биоинформатикиро аз васлкунӣ, шарҳи функсионалӣ ва таҳлили пешрафтаи биоинформатикӣ таъмин мекунад, ки ҳадафҳои мушаххаси тадқиқотиро иҷро мекунад. Ин хидмат имкон медиҳад, ки геномҳои дақиқи истинод барои таҳқиқоти гуногуни генетикӣ ва геномӣ таҳия карда шаванд. Илова бар ин, он барои барномаҳо, аз қабили оптимизатсияи штамм, муҳандисии генетикӣ ва рушди технологияи микробиологӣ замина мегузорад, ки маълумоти боэътимод ва холигии геномиро барои пешрафти фаҳмиши илмӣ ва навовариҳои биотехнологӣ муҳим аст.
-
РНК хурд
РНКҳои хурд як намуди РНК-и кӯтоҳи рамзгузоранда нестанд, ки дарозии миёна 18-30 нтро ташкил медиҳанд, аз ҷумла miRNA, siRNA ва piRNA. Ин РНК-ҳои хурд ба таври оммавӣ дар равандҳои гуногуни биологӣ, аз қабили таназзули mRNA, ҷилавгирӣ аз тарҷума, ташаккули гетерохроматин ва ғайра иштирок мекунанд. платформаи таҳлили пайдарпайӣ иборат аст аз таҳлили стандартӣ ва истихроҷи маълумоти пешрафта. Дар асоси маълумоти RNA-seq, таҳлили стандартӣ метавонад муайянсозӣ ва пешгӯии miRNA, пешгӯии генҳои ҳадафи miRNA, шарҳ ва таҳлили баёнро ба даст орад. Таҳлили пешрафта имкон медиҳад, ки ҷустуҷӯ ва истихроҷи фармоишии miRNA, тавлиди диаграммаи Венн, miRNA ва сохтани шабакаи генҳои мавриди ҳадаф.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS як платформаи пурраи таҳлили такрори геномҳо мебошад, ки дар асоси таҷрибаи бой дар Biomarker Technologies таҳия шудааст. Ин платформаи истифодаи осон имкон медиҳад, ки ҷараёни кории таҳлили ҳамгирошуда бо танҳо муқаррар кардани чанд параметри асосӣ, ки барои маълумоти пайдарпайии ДНК, ки аз платформаи Illumina ва платформаи пайдарпайии BGI тавлид шудаанд, мувофиқат кунад. Ин платформа дар сервери ҳисоббарории баландсифат ҷойгир карда шудааст, ки дар муддати хеле маҳдуд таҳлили самараноки маълумотро фароҳам меорад. Истихроҷи фардии додаҳо дар асоси таҳлили стандартӣ, аз ҷумла дархости генҳои мутатсияшуда, тарҳи праймери PCR ва ғайра дастрас аст.
-
mRNA(Истинодия)
Транскриптом пайванди байни иттилооти генетикии геномӣ ва протеоми функсияи биологӣ мебошад. Танзими сатҳи транскриптӣ усули муҳимтарин ва васеъ омӯхташудаи танзими организмҳо мебошад. пайдарпайии транскриптом метавонад транскриптомро дар ҳар лаҳзаи вақт ё дар ҳама гуна шароит бо резолюцияи дақиқ ба як нуклеотид тартиб диҳад. Он метавонад сатҳи транскрипсияи генро динамикӣ инъикос кунад, ҳамзамон транскриптҳои нодир ва муқаррариро муайян ва муайян кунад ва иттилооти сохтории намунаи стенограммаҳои мушаххас.
Дар айни замон, технологияи пайдарпайии транскриптом дар агрономия, тиб ва дигар соҳаҳои тадқиқотӣ, аз ҷумла танзими рушди ҳайвонот ва растаниҳо, мутобиқсозии муҳити зист, таъсири мутақобилаи иммунӣ, локализатсияи генҳо, эволютсияи генетикии намудҳо ва ошкор кардани варамҳо ва бемориҳои генетикӣ васеъ истифода мешавад.
-
Метагеномика (NGS)
Ин платформаи таҳлилӣ барои таҳлили маълумоти метагеномии тир дар асоси таҷрибаи чандинсола тарҳрезӣ шудааст. Он ҷараёни ҳамгирошудаи кориро дар бар мегирад, ки таҳлилҳои маъмулан зарурии метагеномикиро дар бар мегирад, аз ҷумла коркарди маълумот, омӯзиши сатҳи намудҳо, таҳқиқоти сатҳи функсияи генҳо, пайвандкунии метагеномҳо ва ғайра. Илова бар ин, асбобҳои фармоишии истихроҷи додаҳо дар ҷараёни таҳлили стандартӣ, аз ҷумла дархости генҳо ва намудҳо мавҷуданд. , танзими параметрҳо, тавлиди рақамҳои фардӣ ва ғайра.
-
LncRNA
РНК-ҳои дарози коднашаванда (lncRNA) як намуди транскриптҳо мебошанд, ки дарозии онҳо аз 200 нт зиёд аст, ки сафедаҳои сафедаҳоро рамзгузорӣ карда наметавонанд. Далелҳои ҷамъшуда нишон медиҳанд, ки аксарияти lncRNAs эҳтимолияти функсионалӣ доранд. Технологияҳои пайдарпайии баландсуръат ва абзорҳои таҳлили биоинформатикӣ ба мо имкон медиҳанд, ки пайдарпаии lncRNA ва ҷойгиркунии иттилоотро самараноктар ошкор созем ва моро водор созанд, ки lncRNA-ҳоро бо функсияҳои муҳими танзимкунанда кашф кунем. BMKCloud ифтихор дорад, ки ба мизоҷони мо платформаи таҳлили пайдарпайии lncRNA барои ноил шудан ба таҳлили зуд, боэътимод ва фасеҳи lncRNA пешниҳод кунад.
-
GWAS
Омӯзиши ассотсиатсияи умуми геномӣ (GWAS) ҳадафи муайян кардани вариантҳои генетикӣ (генотип), ки бо хислатҳои мушаххас (фенотип) алоқаманд аст. Таҳқиқоти GWA маркерҳои генетикиро убури геномҳои зиёди шумораи шахсони алоҳида меомӯзанд ва ассотсиатсияҳои генотип-фенотипро тавассути таҳлили оморӣ дар сатҳи аҳолӣ пешгӯӣ мекунанд. Тағйирёбии геномҳои пурра метавонад ҳама вариантҳои генетикиро кашф кунад. Дар якҷоягӣ бо маълумоти фенотипӣ, GWAS-ро барои муайян кардани SNP-ҳои марбут ба фенотип, QTL ва генҳои номзад коркард кардан мумкин аст, ки парвариши муосири ҳайвонот/набототро қавӣ дастгирӣ мекунад. SLAF як стратегияи соддакардашудаи пайдарпайии геномест, ки SNP-ро дар саросари геном кашф мекунад. Ин SNPҳо ҳамчун аломатҳои генетикии молекулавӣ метавонанд барои омӯзиши ассотсиатсия бо хислатҳои мақсаднок коркард карда шаванд. Ин як стратегияи камхарҷ дар муайян кардани хислатҳои мураккаби вариантҳои генетикӣ мебошад.
-
Транскриптомикаи пурраи Nanopore
Изоформҳои алтернативии мураккаб ва тағйирёбанда дар организмҳо механизмҳои муҳими генетикии танзими ифодаи генҳо ва гуногунии сафедаҳо мебошанд. Муайянкунии дақиқи сохторҳои транскрипт асоси омӯзиши амиқи шаклҳои танзими ифодаи ген мебошад. Платформаи пайдарпайии nanopore омӯзиши транскриптомиро ба сатҳи изоформ бомуваффақият овард. Ин платформаи таҳлилӣ барои таҳлили маълумоти RNA-Seq, ки дар платформаи Nanopore дар асоси геноми истинод тавлид шудааст, тарҳрезӣ шудааст, ки ҳам дар сатҳи ген ва ҳам дар сатҳи транскриптҳо таҳлили сифатӣ ва миқдорӣ ба даст меорад.
-
цирк-РНК
РНК-и даврашакл (circRNA) як навъи РНК-и рамзгузорӣнашаванда мебошад, ки ба наздикӣ дар шабакаҳои танзимкунанда, ки дар таҳия, муқовимат ба муҳити зист ва ғайра иштирок мекунанд, нақши муҳим мебозанд. Аз молекулаҳои хаттии РНК, масалан, mRNA, lncRNA, 3′ ва 5′ фарқ мекунад. ақсои circRNA бо ҳам пайваст шуда, сохтори даврашаклро ташкил медиҳанд, ки онҳоро аз ҳазми экзонуклеаза наҷот медиҳад ва устувортар аст. назар ба аксари РНК-и хатӣ. CircRNA муайян карда шудааст, ки дар танзими ифодаи генҳо вазифаҳои гуногун доранд. CircRNA метавонад ҳамчун ceRNA кор кунад, ки miRNA-ро рақобатпазир мепайвандад, ки бо номи исфанҷе miRNA маълум аст. Платформаи таҳлили пайдарпайии CircRNA ба сохтор ва таҳлили ифодаи circRNA, пешгӯии ҳадаф ва таҳлили муштарак бо дигар намудҳои молекулаҳои РНК имкон медиҳад.
-
BSA
Платформаи таҳлили сегрегантҳои ҷамъшуда аз таҳлили стандартии як қадам ва таҳлили пешрафта бо танзимоти фармоишӣ иборат аст. BSA як усулест, ки барои зуд муайян кардани аломатҳои генетикии марбут ба фенотип истифода мешавад. Ҷараёни асосии кори BSA иборат аст аз: 1. интихоби ду гурӯҳи шахсони дорои фенотипҳои ба ҳам мухолиф; 2. муттаҳид сохтани ДНК, РНК ё SLAF-seq(Таҳия аз ҷониби Biomarker)-и ҳама шахсони алоҳида барои ташкили ду қисми асосии ДНК; 3. муайян кардани пайдарпаии дифференсиалӣ бар зидди геномҳои истинод ё дар байни, 4. пешгӯии минтақаҳои алоқаманд бо номзад аз рӯи алгоритми ED ва SNP-index; 5. Таҳлили функсионалӣ ва ғанисозии генҳо дар минтақаҳои номзад ва ғайра. Истихроҷи пешрафта дар маълумот, аз ҷумла скрининги маркерҳои генетикӣ ва тарҳрезии праймер низ дастрас аст.
-
Ампликон (16S/18S/ITS)
Платформаи Amplicon (16S/18S/ITS) бо таҷрибаи чандинсолаи таҳлили лоиҳаҳои гуногунии микробҳо таҳия шудааст, ки дорои таҳлили стандартии асосӣ ва таҳлили фардӣ мебошад: таҳлили асосӣ мундариҷаи таҳлили асосии тадқиқоти микробиологиро дар бар мегирад, мундариҷаи таҳлил бой ва ҳамаҷониба аст, ва натиҷаҳои таҳлил дар шакли ҳисоботи лоиҳа пешниҳод карда мешаванд; Мазмуни таҳлили фардӣ гуногун аст. Намунаҳоро метавон интихоб кард ва параметрҳоро мувофиқи гузориши таҳлили асосӣ ва ҳадафи тадқиқот чандир муқаррар кардан мумкин аст, то ки талаботҳои фардӣ амалӣ карда шаванд. Системаи оператсионии Windows, оддӣ ва зуд.
-
Генетикаи эволютсионӣ
Генетикаи эволютсионалӣ як хидмати ҳамаҷонибаи пайдарпайӣ мебошад, ки барои пешниҳоди тафсири амиқи эволютсия дар доираи як гурӯҳи калони шахсон дар асоси вариантҳои генетикӣ, аз ҷумла SNPs, InDels, SVs ва CNVs пешбинӣ шудааст. Ин хадамот тамоми таҳлилҳои заруриро дар бар мегирад, ки барои равшан кардани тағиротҳои эволютсионӣ ва хусусиятҳои генетикии популятсияҳо, аз ҷумла арзёбии сохтори популятсия, гуногунии генетикӣ ва муносибатҳои филогенетикӣ заруранд. Ғайр аз он, он ба тадқиқот оид ба ҷараёни генҳо, имкон медиҳад, ки андозаи самараноки аҳолӣ ва вақти ҷудошавӣ баҳо дода шавад. Тадқиқотҳои генетикии эволютсионӣ дар бораи пайдоиш ва мутобиқшавии намудҳо фаҳмиши арзишманд медиҳанд.
Дар BMKGENE, мо ду роҳро барои гузаронидани таҳқиқоти генетикии эволютсиониро дар популятсияҳои калон пешниҳод менамоем: истифодаи пайдарпайии пурраи геном (WGS) ё интихоби усули коҳишёфтаи пайдарпайии геномҳои намояндагӣ, фрагменти дар дохили хона таҳияшудаи Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF). Гарчанде ки WGS ба геномҳои хурдтар мувофиқат мекунад, SLAF ҳамчун алтернативаи камхарҷ барои омӯзиши популятсияҳои калонтар бо геномҳои дарозтар пайдо мешавад ва хароҷоти пайдарпайро ба таври муассир кам мекунад.
