● Ду панели экзоме, ки дар асоси ғанисозии ҳадаф бо зондҳо дастрасанд: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) ва xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).
● Пайдарпайкунӣ дар Illumina NovaSeq.
● лӯлаи биоинформатикӣ барои таҳлили бемориҳо ё таҳлили варамҳо.
●Минтақаи рамзгузории протеинро ҳадаф қарор медиҳад: Бо дарёфт ва пайдарпайии минтақаҳои рамзгузории сафедаҳо, hWES барои ошкор кардани вариантҳои марбут ба сохтори сафеда истифода мешавад.
●Хароҷоти самаранок:hWES тақрибан 85% мутатсияҳои марбут ба бемории одамро аз 1% геноми инсон медиҳад.
●Дақиқии баланд: Бо умқи баланди пайдарпайӣ, hWES ҳам вариантҳои умумӣ ва ҳам вариантҳои нодирро бо басомадҳои камтар аз 1% осон мекунад.
●Назорати қатъии сифат: Мо панҷ нуқтаи назоратии асосиро дар тамоми марҳилаҳо, аз омодасозии намуна ва китобхона то пайдарпайӣ ва биоинформатика татбиқ мекунем. Ин мониторинги дақиқ таъмин намудани натиҷаҳои пайвастаи баландсифатро таъмин мекунад.
●Таҳлили ҳамаҷонибаи биоинформатика: лӯлаи мо аз муайян кардани вариантҳои геноми истинод берунтар аст, зеро он таҳлили пешрафтаро дар бар мегирад, ки барои ҳалли масъалаҳои тадқиқотии марбут ба ҷанбаҳои генетикии бемориҳо ё таҳлили варамҳо пешбинӣ шудааст.
●Дастгирии пас аз фурӯш:Уҳдадориҳои мо пас аз анҷоми лоиҳа бо мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯш фаротар аст. Дар ин муддат мо пайгирии лоиҳа, кӯмак барои бартараф кардани мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои ҳалли ҳама гуна дархостҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод мекунем.
Стратегияи забти Exon | Стратегияи пайдарпай | Натиҷаи маълумоти тавсияшуда |
Албатта интихоб кунед Human All Exon v6 (Agilent) ё xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)
| Illumina NovaSeq PE150 | 5 -10 Гб Барои ихтилоли менделӣ / бемориҳои нодир: > 50x Барои намунаҳои варам: ≥ 100x |
Намунаи намуна
| Маблағ(Qubit®)
| Консентратсияи | Ҳаҷм
| Покӣ (NanoDrop™) |
ДНК-и геномӣ
| ≥ 50 нг | ≥ 6 нг/мкл | ≥ 15 мкл | OD260/280 = 1,8-2,0 таназзул, ифлосшавӣ нест
|
Таҳлили биоинформатикии намунаҳои hWES-бемории зеринро дар бар мегирад:
● пайдарпайии маълумот QC
● Ҳамоҳангсозии геномҳои истинод
● Муайянкунии SNP ва InDels
● Шарҳи функсионалии SNPs ва InDels
Таҳлили биоинформатикии намунаҳои варам дар бар мегирад:
● пайдарпайии маълумот QC
● Ҳамоҳангсозии геномҳои истинод
● Муайян кардани SNPs, InDels ва вариантҳои соматикӣ
● Муайян кардани вариантҳои хати насл
● Таҳлили имзоҳои мутатсия
● Муайян кардани генҳои гардонанда дар асоси мутатсияҳои фоидаовар
● Аннотацияи мутатсия дар сатҳи ҳассосияти маводи мухаддир
● Таҳлили гетерогенӣ – ҳисобкунии тозагӣ ва плоидӣ
Маълумоти QC - Омори забти Exome
Муайянкунии вариант - InDels
Таҳлили пешрафта: муайян ва тақсимоти SNPs/InDels зараровар - қитъаи Circos
Таҳлили варамҳо: муайян ва тақсимоти мутатсияҳои соматикӣ - қитъаи Circos
Таҳлили варамҳо: наслҳои клоналӣ