Таҳлили ассотсиатсияи геномӣ
Раванди кор
Афзалиятҳои хидматрасонӣ
●Санҷиши васеъ ва сабтҳои нашр: бо таҷрибаи андӯхташуда дар GWAS, BMKGene садҳо лоиҳаҳои намудҳоро дар тадқиқоти популятсияи GWAS анҷом дод, ба тадқиқотчиён дар нашри зиёда аз 100 мақола кӯмак кард ва омили таъсири ҷамъшуда ба 500 расид.
● Таҳлили ҳамаҷонибаи биоинформатика: ҷараёни корӣ таҳлили ассотсиатсияи SNP-сифатро дар бар мегирад, ки маҷмӯи генҳои номзад ва шарҳи функсионалии мувофиқро пешниҳод мекунад.
●Гурӯҳи баландихтисос оид ба биоинформатика ва давраи таҳлили кӯтоҳ: бо таҷрибаи бузург дар таҳлили пешрафтаи геномикӣ, дастаи BMKGene таҳлилҳои ҳамаҷонибаро бо вақти зуд ба даст меорад.
●Дастгирии пас аз фурӯш:Уҳдадориҳои мо пас аз анҷоми лоиҳа бо мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯш фаротар аст. Дар ин муддат мо пайгирии лоиҳа, кӯмак барои бартараф кардани мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои ҳалли ҳама гуна дархостҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод мекунем.
Мушаххасоти хизматрасонӣ ва талабот
| Навъи пайдарпай | Миқёси тавсияшудаи аҳолӣ | Стратегияи пайдарпай | Талаботи нуклеотидҳо |
| Пайдарпайвандии тамоми геном | 200 намуна | 10х | Консентратсияи: ≥ 1 нг/мкЛ Маблағи умумӣ ≥ 30нг Маҳдуд ё тамоман таназзул ё ифлосшавӣ |
| Фрагменти тақвиятёфтаи мушаххаси локус (SLAF) | Амиқии барчасп: 10x Шумораи барчаспҳо: < 400 Mb: WGS тавсия дода мешавад <1Гб: 100К тег 1 Гб > 2Гб: 300К тег Максимум 500k барчасп | Консентратсияи ≥ 5 нг/мкЛ Маблағи умумӣ ≥ 80 нг Nanodrop OD260/280 = 1,6-2,5 Агароз гели: таназзул ё ифлосшавӣ нест ё маҳдуд аст
|
Интихоби мавод
Навъҳо, зернамудҳо, заминҳо / генбонкҳо / оилаҳои омехта / захираҳои ваҳшӣ
Навъҳо, зернамудҳо, заминҳои гуногун
Оилаи нимсиб / оилаи пурраи сиб / захираҳои ваҳшӣ
Раванди кори хидмат
Тарҳрезии таҷриба
Интиқоли намуна
истихроҷи РНК
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Таҳлили зеринро дар бар мегирад:
- Таҳлили ассотсиатсияи геномӣ: модели LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Аннотацияи функсионалии генҳои номзад
Таҳлили ассотсиатсияи SNP - Қитъаи Манҳеттен
Таҳлили ассотсиатсияи SNP-сифат - қитъаи QQ
Пешрафтҳоеро, ки аз ҷониби хидматҳои BMKGene's de GWAS тавассути маҷмӯаи нашрияҳо мусоидат мекунанд, омӯзед:
Лв, Л. (2023) 'Фаҳмиш ба асоси генетикии таҳаммулпазирии аммиак дар моллюск Sinonovacula constricta аз ҷониби омӯзиши ассотсиатсияи умуми геном',Аквакультура, 569, с. 739351. дои: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Ли, X. ва дигарон. (2022) 'Таҳлилҳои бисёрҷонибаи 398 пайвастагии арзани рӯбоҳ минтақаҳои геномии марбут ба хонагӣ, хусусиятҳои метаболитӣ ва таъсири зидди илтиҳобиро ошкор мекунанд',Заводи молекулавӣ, 15(8), сах. 1367—1383. дои: 10.1016 / j.molp.2022.07.003.
Ли, J. ва дигарон. (2022) 'Харитасозии Ассотсиатсияи умумиҷаҳонии геномӣ аз фенотипҳои ҷарима дар муҳити хушксолӣ',Сарҳадҳо дар илми растанӣ, 13, саҳ. 924892. дои: 10.3389 / FPLS.2022.924892 / BIBTEX.
Чжао, X. ва дигарон. (2021) 'GmST1, ки сульфотрансферазаро рамзгузорӣ мекунад, муқовиматро ба штаммҳои вируси мозаикаи лубиёи G2 ва G3 медиҳад',Растаниҳо, ҳуҷайраҳо ва муҳити зист, 44(8), саҳ. 2777–2792. дои: 10.1111 / PCE.14066.
