Генетикаи эволютсионӣ
Афзалиятҳои хидматрасонӣ
Такаги ва дигарон,Журнали завод, 2013
●Таҳлили ҳамаҷонибаи биоинформатикӣ:имкон медиҳад, ки баҳодиҳии гуногунии генетикӣ, ки потенсиали эволютсионии намудҳоро инъикос мекунад ва робитаи боэътимоди филогенетикии байни намудҳо бо таъсири камтарини эволютсияи конвергентӣ ва эволютсияи параллелӣ ошкор карда шавад.
●Таҳлили ихтиёрии фармоишӣ: ба монанди баҳодиҳии вақт ва суръат дар асоси тағирот дар сатҳи нуклеотидҳо ва аминокислотаҳо.
●Санҷиши васеъ ва сабтҳои нашр: BMKGene дар тӯли зиёда аз 15 сол дар лоиҳаҳои генетикаи популятсия ва эволютсионӣ таҷрибаи зиёд ҷамъ оварда, ҳазорҳо намудҳоро дар бар мегирад ва дар зиёда аз 1000 лоиҳаҳои сатҳи баланд, ки дар Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal нашр шудаанд, саҳм гузоштааст.
● Гурӯҳи баландихтисос оид ба биоинформатика ва давраи таҳлили кӯтоҳ: бо таҷрибаи бузург дар таҳлили пешрафтаи геномикӣ, дастаи BMKGene таҳлилҳои ҳамаҷонибаро бо вақти зуд ба даст меорад.
● Дастгирии пас аз фурӯш:Уҳдадориҳои мо пас аз анҷоми лоиҳа бо мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯш фаротар аст. Дар ин муддат мо пайгирии лоиҳа, кӯмак барои бартараф кардани мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои ҳалли ҳама гуна дархостҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод мекунем.
Мушаххасоти хизматрасонӣ ва талабот
| Навъи пайдарпай | Миқёси тавсияшудаи аҳолӣ | Стратегияи пайдарпай | Талаботи нуклеотидҳо |
| Пайдарпайвандии тамоми геном | ≥ 30 нафар, бо ≥ 10 фард аз ҳар як зергурӯҳ
| 10х | Консентратсияи: ≥ 1 нг/мкЛ Маблағи умумӣ ≥ 30нг Маҳдуд ё тамоман таназзул ё ифлосшавӣ |
| Фрагменти тақвиятёфтаи мушаххаси локус (SLAF) | Амиқии тег: 10х Шумораи барчаспҳо: <400 Mb: WGS тавсия дода мешавад <1Гб: 100К тег 1 Гб >2Гб: 300К тег Максимум 500k барчасп | Консентратсияи ≥ 5 нг/мкЛ Маблағи умумӣ ≥ 80 нг Nanodrop OD260/280 = 1,6-2,5 Агароз гели: таназзул ё ифлосшавӣ нест ё маҳдуд аст
|
Раванди кори хидмат
Тарҳрезии таҷриба
Интиқоли намуна
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Хизматрасонӣ таҳлили сохтори популятсияро (дарахти филогенетикӣ, PCA, диаграммаи стратификацияи аҳолӣ), гуногунии популятсия ва интихоби популятсияро (нобаробарии пайвандҳо, интихоби интихобӣ-интихоби ҷойҳои фоиданок) дар бар мегирад. Хизмат инчунин метавонад таҳлили фармоиширо дар бар гирад (масалан, вақти ҷудошавӣ, ҷараёни генҳо).
*Натиҷаҳои намоишӣ, ки дар ин ҷо нишон дода шудаанд, ҳама аз геномҳои бо BMKGENE нашршуда мебошанд
1.Таҳлили эволютсия сохтмони дарахти филогенетикӣ, сохтори популятсия ва PCA дар асоси вариантҳои генетикиро дар бар мегирад.
Дарахти филогенетикӣ муносибатҳои таксономӣ ва эволютсиониро байни намудҳо бо аҷдоди умумӣ ифода мекунад.
PCA ҳадафи визуалии наздикии байни зерпопуляцияҳо мебошад.
Сохтори популятсия мавҷудияти зерпопуляцияи аз ҷиҳати генетикӣ фарқкунандаро аз рӯи басомадҳои аллел нишон медиҳад.
Чен ва ғайра. ал.,PNAS, 2020
2. Тозакунии интихобӣ
Ҷустуҷӯи интихобӣ ба раванде дахл дорад, ки тавассути он як сайти муфид интихоб карда мешавад ва басомадҳои сайтҳои бетарафи алоқаманд зиёд ва сайтҳои бетараф кам карда мешаванд, ки дар натиҷа минтақавӣ коҳиш меёбад.
Муайян кардани геном дар минтақаҳои интихобӣ тавассути ҳисоб кардани индекси генетикии популятсия (π，Fst, Tajima's D) ҳамаи SNPҳо дар дохили равзанаи лағжиш (100 Кб) дар як қадами муайян (10 Кб) коркард карда мешавад.
Гуногунии нуклеотидҳо (π）
Тоҷима Д
Индекси фиксатсия (Fst)
Ву ва ғайра. ал.,Заводи молекулавӣ, 2018
3. Ҷараёни ген
Ву ва ғайра. ал.,Заводи молекулавӣ, 2018
4. Таърихи демографӣ
Чжан ва ғайра. ал.,Экология ва эволютсияи табиат, 2021
5. Вақти тафовут
Чжан ва ғайра. ал.,Экология ва эволютсияи табиат, 2021
Пешрафтҳоеро, ки тавассути хидматҳои генетикии эволютсионии BMKGene тавассути маҷмӯаи нашрияҳо мусоидат мекунанд, омӯзед:
Хасанёр, АК ва дигарон. (2023) 'Кашфи маркерҳои молекулавии SNP ва генҳои номзаде, ки бо муқовимати вируси Sacbrood дар Тухми Apis cerana cerana тавассути такрори тамоми геномҳо алоқаманданд',Маҷаллаи байналмилалии илмҳои молекулавӣ, 24(7). дои: 10.3390 / IJMS24076238.
Чаи, J. ва дигарон. (2022) 'Кашфи як саламандри азимҷуссаи ваҳшӣ, аз ҷиҳати генетикӣ поки чинӣ имкониятҳои нави ҳифзи табиатро ба вуҷуд меорад',Тадқиқоти зоологӣ, 2022, ҷилди. 43, шумораи 3, сахифахо: 469-480, 43(3), сах. 469-480. дои: 10.24272 / J.ISSN.2095-8137.2022.101.
Хан, М ва дигарон. (2022) 'Таърихи эволютсияи филологӣ ва популятсияи бумии Elymus sibiricus L. дар платои Цинхай-Тибет',Сарҳадҳо дар илми растанӣ, 13, саҳ. 882601. дои: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / BIBTEX.
Ванг, J. ва дигарон. (2022) 'Фаҳмишҳои геномикӣ дар бораи эволютсияи лонган аз ассамблеяи геномҳои сатҳи хромосома ва геномикаи популятсияи ҳамроҳшавии Лонган',Тадқиқоти боғдорӣ, 9. дои: 10.1093/HR/UHAC021.
