Эукариотӣ mRNA пайдарпаии-NGS
Вижагиҳо
● Гирифтани поли mRNA пеш аз омодасозии китобхона
● Омодасозии ихтиёрии самти китобхонаи mRNA барои имкон додани дастрасии маълумоти пайдарпайии мушаххаси ришта
● Таҳлили биоинформатикии ифодаи генҳо ва сохтори транскрипт
Афзалиятҳо
●Экспертизаи васеъ: Гурӯҳи мо дар BMKgene зиёда аз 600,000 намунаро коркард кардааст, ки намудҳои гуногуни намунаҳоро, аз қабили фарҳангҳои ҳуҷайра, бофтаҳо ва моеъҳои баданро дар бар мегирад. Мо ба ҳар як лоиҳа таҷрибаи бой меорем ва зиёда аз 100,000 лоиҳаҳои mRNA-Seq дар соҳаҳои гуногуни тадқиқотиро бомуваффақият анҷом додем.
●Назорати қатъии сифат: Мо нуқтаҳои назоратии асосиро дар тамоми марҳилаҳо, аз омодасозии намуна ва китобхона то пайдарпайӣ ва биоинформатика амалӣ месозем. Ин мониторинги дақиқ расонидани натиҷаҳои пайвастаи баландсифатро таъмин мекунад ва ба шумо итминон медиҳад, ки лоиҳаи шумо дар дасти боэътимод аст.
●Тавсифи ҳамаҷониба: Мо пойгоҳи додаҳои сершуморро истифода мебарем, то ба таври функсионалӣ шарҳи генҳои дифференсиалии ифодашуда (DEGs) ва анҷом додани таҳлилҳои ғанисозии мувофиқ. Ин равиши ҳамаҷониба дар бораи равандҳои ҳуҷайравӣ ва молекулавӣ, ки дар асоси аксуламали транскриптомӣ ҷойгиранд, фаҳмиш медиҳад, ки шумо дар бораи натиҷаҳои лоиҳаи худ пурра огоҳ мешавед.
●Дастгирии пас аз фурӯш: Уҳдадории мо пас аз анҷоми лоиҳа бо мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯш фаротар аст. Дар ин муддат мо пайгирии лоиҳа, кӯмак барои бартараф кардани мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои ҳалли ҳама гуна дархостҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод мекунем.
Талаботи намунавӣ ва интиқол
| Китобхона | Стратегияи пайдарпай | Маълумот тавсия дода мешавад | Назорати сифат |
| Poly A ғанӣ гардонида шудааст | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 Гб | Q30≥85% |
Талаботи намунавӣ:
Нуклеотидҳо:
| Консентрат (нг/мкл) | Миқдор (мкг) | Покӣ | Беайбӣ | |
| Китобхонаи стандартӣ | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Маҳдуд ё тамоман ифлосшавии протеин ё ДНК дар гел нишон дода шудааст. | Барои растаниҳо: RIN≥4,0; Барои ҳайвонот: RIN≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; маҳдуд ё набудани баландии ибтидоӣ |
| Китобхонаи роҳнамо | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Маҳдуд ё тамоман ифлосшавии протеин ё ДНК дар гел нишон дода шудааст. | Барои растаниҳо: RIN≥4,0; Барои ҳайвонот: RIN≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; маҳдуд ё набудани баландии ибтидоӣ |
● Растаниҳо:
Реша, поя ё гулбарг: 450 мг
Барг ё тухми: 300 мг
Мева: 1,2 г
●Ҳайвон:
дил ё рӯда: 300 мг
Висцера ё майна: 240 мг
мушакҳо: 450 мг
Устухон, мӯй ё пӯст: 1 г
● Артроподҳо:
Ҳашарот: 6г
Crustacea: 300 мг
● Хуни пурра: 1 қубур
● Ҳуҷайраҳо: 106 ҳуҷайраҳо
Интиқоли намунаи тавсияшуда
Контейнер: 2 мл найчаи центрифуга (фолгаи тунука тавсия дода намешавад)
Тамғагузории намуна: Гурӯҳ+такрор, масалан, A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Интиқол:
1. Ях хушк: Намунаҳо бояд дар халтаҳо баста шаванд ва дар яхи хушк дафн карда шаванд.
2. Қубурҳои мизи РНК: Намунаҳои РНК-ро дар найчаи устуворсозии РНК (масалан, RNAstable®) хушк кардан ва дар ҳарорати хона интиқол додан мумкин аст.
Раванди кори хидмат
Тарҳрезии таҷриба
Интиқоли намуна
истихроҷи РНК
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Биоинформатика
Эукариот Ҷараёни кории таҳлили пайдарпайии mRNA
Биоинформатика
ØНазорати сифати маълумоти хом
ØҲамоҳангсозии геномҳои истинод
ØТаҳлили сохтори транскрипт
ØМиқдори ифода
ØТаҳлили ифодаи дифференсиалӣ
ØАннотация ва ғанисозии функсия
Ҳамоҳангсозии геномҳои истинод
Сатҳи маълумот
Таносуби намуна ва арзёбии такрори биологӣ
Генҳои ба таври дифференсиалӣ ифодашуда (DEGs)
Шарҳи функсионалии DEG
ғанисозии функсионалии DEG
Пешрафтҳоро омӯзед, ки тавассути хидматҳои пайдарпайии эукариотики NGS mRNA-и BMKGene тавассути маҷмӯаи нашрияҳо мусоидат мекунад.
Хуан, Л. (2023) "Триклозан ва триклокарбан қобилияти бӯи моҳии тиллоиро тавассути маҳдуд кардани шинохти хушбӯй, вайрон кардани интиқоли сигнали бӯй ва халалдор кардани коркарди иттилооти бӯйро заиф мекунанд", Тадқиқоти об, 233, саҳ. 119736. дои: 10.1016 / J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ ва дигарон. (2023) 'Aspergillus fumigatus p11-и инсонро рабудааст, то фагосомаҳои дорои занбӯруғдорро ба роҳи вайроннашаванда равона кунад', Cell Host & Microbe, 31(3), саҳ. 373-388.e10. дои: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Ҷин, К. ва дигарон. (2022) 'Омилҳои транскрипсияи TCP, ки дар рушди навдаҳои Ма бамбук (Dendrocalamus latiflorus Munro) иштирок мекунанд', Сарҳадҳо дар илми растанӣ, 13, саҳ. 884443. дои: 10.3389 / FPLS.2022.884443 / BIBTEX.
Вен, X. ва дигарон. (2022) 'Геноми Chrysanthemum lavandulifolium ва механизми молекулавӣ, ки дар асоси намудҳои гуногуни капитулҳо ҷойгиранд', Тадқиқоти боғдорӣ, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Чжан, Южие ва дигарон. (2023) 'Нанореактори каскадӣ барои такмил додани терапияи сонодинамикӣ дар саратони колоректалӣ тавассути афзоиши синергетикии ROS ва басташавии аутофагия', Nano Today, 49, саҳ. 101798. дои: 10.1016/Ч.НАНТОД.2023.101798.
