De novo Ассамблеяи геномҳои бактериявӣ
Мо хидмати пурраи васлкунии геномҳои бактериявиро пешниҳод мекунем, ки 0 холигоҳро кафолат медиҳад. Ин тавассути ҳамгироии технологияҳои пайдарпайии дарозмуддат, аз қабили Nanopore ва PacBio барои васлкунӣ ва пайдарпаии кӯтоҳмуддат бо Illumina барои тасдиқи васлкунӣ ва ислоҳи хатогиҳои хондани ONT имконпазир аст. Хидмати мо ҷараёни мукаммали кори биоинформатикиро аз васлкунӣ, шарҳи функсионалӣ ва таҳлили пешрафтаи биоинформатикӣ таъмин мекунад, ки ҳадафҳои мушаххаси тадқиқотиро иҷро мекунад. Ин хидмат имкон медиҳад, ки геномҳои дақиқи истинод барои таҳқиқоти гуногуни генетикӣ ва геномӣ таҳия карда шаванд. Илова бар ин, он барои барномаҳо, аз қабили оптимизатсияи штамм, муҳандисии генетикӣ ва рушди технологияи микробиологӣ замина мегузорад, ки маълумоти боэътимод ва холигии геномиро барои пешрафти фаҳмиши илмӣ ва навовариҳои биотехнологӣ муҳим аст.
Хусусиятҳои хидматрасонӣ
● Бо ду варианти имконпазир барои интихоб вобаста ба дараҷаи дилхоҳи пуррагии геном.
● Опсияи лоиҳаи геном: пайдарпаии кӯтоҳмуддат бо Illumina NovaSeq PE150.
● Анҷом додани геноми холигии 0.
● Пайдарпайвандии дарозмуддат дар Nanopore PromethION 48 ё PacBio Revio барои васлкунии геном.
● Пайдарпайвандии кӯтоҳмуддат дар Illumina NovaSeq барои тасдиқи геном ва ислоҳи хатоҳо (Nanopore) ё тавлиди лоиҳаи геном.
Афзалиятҳои хидматрасонӣ
●Кафолати геномҳои сифрӣ: Ин ба ҳамгироии пайдарпайии Illumina бо пайдарпаии хондани тӯлонӣ (Nanopore ё PacBio) вобаста аст.
●Ҷараёни мукаммали кори биоинформатика:Ба ин маҷмӯи геномҳо ва пешгӯии унсурҳои сершумори геномӣ, шарҳи генҳои функсионалӣ ва визуализатсияи геномҳо ба монанди қитъаи Circos дохил мешаванд.
●Экспертизаи васеъ: Бо ҷамъ овардани зиёда аз 20,000 геноми микробҳо, BMKGENE таҷрибаи зиёда аз даҳсола, гурӯҳи таҳлилии баландихтисос, мундариҷаи ҳамаҷониба ва дастгирии аълои пас аз фурӯш меорад.
●Дастгирии пас аз фурӯш:Уҳдадориҳои мо пас аз анҷоми лоиҳа бо мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯш фаротар аст. Дар ин муддат мо пайгирии лоиҳа, кӯмак барои бартараф кардани мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои ҳалли ҳама гуна дархостҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод мекунем.
●Стратегияҳои сершумори пайдарпай дастрасанд:Барои мақсадҳои гуногуни тадқиқот ва талаботи пуррагии геном.
Мушаххасоти хадамот
| Хизмат | Стратегияи пайдарпай |
| Лоиҳаи геном | Illumina PE150 100x |
| 0 Геноми Gap | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (ихтиёрӣ) |
Талаботи намунавӣ:
| Консентратсияи (ng/µL) | Маблағи умумӣ (мкг) | Ҳаҷм (μL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1,2 | ≥20 | 1,7-2,2 | ≥1,0 |
| Нанопора | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1,7-2,2 | 1,0-3,0 |
| Иллюмина | ≥1 | ≥0,06 | ≥20 | - | - |
· Бактерияҳо: ≥3,5x1010 ҳуҷайраҳо
Раванди кори хидмат
Интиқоли намуна
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Таҳлили зеринро дар бар мегирад:
● Пайдарҳамии назорати сифати маълумот
● Ассамблеяи геномӣ
● Таҳлили ҷузъи геномӣ: Пешгӯии CDS ва унсурҳои сершумори геномӣ
● Шарҳи функсионалӣ бо якчанд пойгоҳи додаҳои умумӣ (GO, KEGG ва ғайра) ва пойгоҳи додаҳои пешрафта (CARD, VFDB ва ғайра)
● Визуализатсияи геном
Мо геномро дар формати фаста дастрас ва файли эзоҳоти геномӣ (gff) пешниҳод мекунем.
Шарҳи ген - ГУЗАРЕД
Шарҳи ген - карбогидратҳои CAZY
Визуализатсияи геном - қитъаи Circos
Пешрафтҳоеро, ки аз ҷониби хидматҳои васлкунии геномҳои бактериявии BMKGene тавассути маҷмӯаи нашрияҳо мусоидат мекунанд, омӯзед.
Дай, В. (2023) 'Кашфи Bacteroides uniformis F18-22 ҳамчун бактерияи бехатар ва нави пробиотикӣ барои муолиҷаи колитҳои захмдор аз рӯдаи солими инсон',Маҷаллаи байналмилалии илмҳои молекулавӣ, 24(19), с. 14669. дои: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
Канг, Q. ва дигарон. (2021) 'Proteus mirabilis ба бисёр маводи мухаддир муқовимат мекунад, ки blaOXA-1 ва blaNDM-1-ро аз олами ваҳшӣ дар Чин ҷудо мекунад: афзоиши хатари саломатии ҷомеа',Зоологияи интегратсионӣ, 16(6), с. 798–809. дои: 10.1111 / 1749-4877.12510.
Ванг, ТТ ва дигарон. (2017) 'Пайдарпайвандии пурраи геноми эндофити Bacillus flexus KLBMP 4941 механизми пешбурди афзоиши растании он ва асоси генетикии таҳаммулпазирии намакро ошкор мекунад',Маҷаллаи биотехнология, 260, сах. 38—41. дои: 10.1016 / J.JBIOTEC.2017.09.001.
Ван, X. ва дигарон. (2021) 'Пласмидҳои муқовимати бисёр-репликонии Клебсиелла барои паҳнкунии васеи генҳои зиддимикробӣ миёнаравӣ мекунанд',Сарҳадҳо дар микробиология, 12, саҳ. 754931. дои: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / BIBTEX.
