మొత్తం జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (WGBS)
హోల్ జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (WGBS) అనేది DNA మిథైలేషన్ యొక్క లోతైన అన్వేషణకు బంగారు-ప్రామాణిక పద్దతిగా నిలుస్తుంది, ప్రత్యేకంగా సైటోసిన్ (5-mC)లో ఐదవ స్థానం, జన్యు వ్యక్తీకరణ మరియు సెల్యులార్ కార్యకలాపాల యొక్క కీలక నియంత్రకం. WGBS యొక్క అంతర్లీన సూత్రం బైసల్ఫైట్ చికిత్సను కలిగి ఉంటుంది, ఇది మిథైలేటెడ్ సైటోసైన్‌లను మారకుండా వదిలివేసేటప్పుడు, అన్‌మీథైలేటెడ్ సైటోసిన్‌లను యురేసిల్‌గా (C నుండి U) మార్చడాన్ని ప్రేరేపిస్తుంది. ఈ సాంకేతికత సింగిల్-బేస్ రిజల్యూషన్‌ను అందిస్తుంది, పరిశోధకులు మిథైలోమ్‌ను సమగ్రంగా పరిశోధించడానికి మరియు వివిధ పరిస్థితులతో సంబంధం ఉన్న అసాధారణ మిథైలేషన్ నమూనాలను వెలికితీసేందుకు అనుమతిస్తుంది, ముఖ్యంగా క్యాన్సర్. WGBSని ఉపయోగించడం ద్వారా, శాస్త్రవేత్తలు జీనోమ్-వైడ్ మిథైలేషన్ ల్యాండ్‌స్కేప్‌లలో అసమానమైన అంతర్దృష్టులను పొందవచ్చు, విభిన్న జీవ ప్రక్రియలు మరియు వ్యాధులకు కారణమయ్యే బాహ్యజన్యు విధానాలపై సూక్ష్మ అవగాహనను అందిస్తారు.
సర్వీస్ ఫీచర్లు
● సూచన జీనోమ్ అవసరం.
● బైసల్ఫైట్ మార్పిడి సామర్థ్యాన్ని పర్యవేక్షించడానికి లాంబ్డా DNA జోడించబడింది.
● Illumina NovaSeqలో సీక్వెన్సింగ్.
సేవా ప్రయోజనాలు
●DNA మిథైలేషన్ పరిశోధన కోసం గోల్డ్ స్టాండర్డ్: ఈ మెచ్యూర్ మిథైలేషన్ కన్వర్షన్ ప్రాసెసింగ్ టెక్నాలజీ అధిక ఖచ్చితత్వం మరియు మంచి పునరుత్పత్తి సామర్థ్యాన్ని కలిగి ఉంది.
●విస్తృత కవరేజ్ మరియు సింగిల్-బేస్ రిజల్యూషన్:జన్యు-వ్యాప్త స్థాయిలో మిథైలేషన్ సైట్‌లను గుర్తించడం.
●పూర్తి వేదిక:నమూనా ప్రాసెసింగ్, లైబ్రరీ నిర్మాణం, బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణ వరకు సీక్వెన్సింగ్ నుండి వన్-స్టాప్ అద్భుతమైన సేవలను అందిస్తాయి.
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం: విభిన్న రకాల జాతులలో విజయవంతంగా పూర్తయిన WGBS సీక్వెన్సింగ్ ప్రాజెక్ట్‌లతో, BMKGENE దశాబ్దానికి పైగా అనుభవం, అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన విశ్లేషణ బృందం, సమగ్ర కంటెంట్ మరియు అద్భుతమైన పోస్ట్-సేల్స్ మద్దతును అందిస్తుంది.
●ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్స్ అనాలిసిస్‌తో చేరే అవకాశం: RNA-seq వంటి ఇతర ఓమిక్స్ డేటాతో WGBS యొక్క సమగ్ర విశ్లేషణ కోసం అనుమతిస్తుంది.
నమూనా లక్షణాలు
| లైబ్రరీ | సీక్వెన్సింగ్ స్ట్రాటజీ | సిఫార్సు చేయబడిన డేటా అవుట్‌పుట్ | నాణ్యత నియంత్రణ |
| Bisulfite చికిత్స | ఇల్యూమినా PE150 | 30x లోతు | Q30 ≥ 85% బైసల్ఫైట్ మార్పిడి > 99% |
నమూనా అవసరాలు
| ఏకాగ్రత (ng/µL) | మొత్తం మొత్తం (µg) | అదనపు అవసరాలు | |
| జన్యుసంబంధమైన DNA | ≥ 5 | ≥ 400 ng | పరిమిత క్షీణత లేదా కాలుష్యం |
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
నమూనా డెలివరీ
DNA వెలికితీత
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
డేటా డెలివరీ
కింది విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది:
● రా సీక్వెన్సింగ్ నాణ్యత నియంత్రణ;
● సూచన జన్యువుకు మ్యాపింగ్;
● 5mC మిథైలేటెడ్ బేస్‌ల గుర్తింపు;
● మిథైలేషన్ పంపిణీ మరియు ఉల్లేఖన విశ్లేషణ;
● విభిన్నంగా మిథైలేటెడ్ ప్రాంతాల విశ్లేషణ (DMRలు);
● DMRలకు అనుబంధించబడిన జన్యువుల ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖనం.
5mC మిథైలేషన్ గుర్తింపు: మిథైలేటెడ్ సైట్‌ల రకాలు
మిథైలేషన్ మ్యాప్. 5mC మిథైలేషన్ జీనోమ్-వైడ్ డిస్ట్రిబ్యూషన్
అధిక మిథైలేటెడ్ ప్రాంతాల ఉల్లేఖనం
విభిన్నంగా మిథైలేటెడ్ ప్రాంతాలు: అనుబంధిత జన్యువులు
విభిన్నంగా మిథైలేటెడ్ ప్రాంతాలు: అనుబంధిత జన్యువుల ఉల్లేఖనం (జీన్ ఒంటాలజీ)
BMKGene యొక్క మొత్తం జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ సేవల ద్వారా క్యూరేటెడ్ ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా పరిశోధన పురోగతిని అన్వేషించండి.
ఫ్యాన్, Y. మరియు ఇతరులు. (2020) 'పూర్తి-జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్‌ని ఉపయోగించి గొర్రెల అస్థిపంజర కండరాల అభివృద్ధి సమయంలో DNA మిథైలేషన్ ప్రొఫైల్‌ల విశ్లేషణ',BMC జెనోమిక్స్, 21(1), పేజీలు. 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
జావో, X. మరియు ఇతరులు. (2022) 'వినైల్ క్లోరైడ్‌కు గురైన కార్మికులలో నవల డియోక్సిరిబోన్యూక్లియిక్ యాసిడ్ మిథైలేషన్ పెర్టర్బేషన్స్',టాక్సికాలజీ మరియు ఇండస్ట్రియల్ హెల్త్, 38(7), పేజీలు. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
జువో, J. మరియు ఇతరులు. (2020) 'జీనోమ్ మిథైలేషన్, నాన్-కోడింగ్ ఆర్‌ఎన్‌ఏల స్థాయిలు, టొమాటో పండ్లను పండించడంలో mRNAలు మరియు మెటాబోలైట్‌ల మధ్య సంబంధాలు',ది ప్లాంట్ జర్నల్, 103(3), పేజీలు. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
