-
మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ -NGS
మెటాజినోమ్ అనేది పర్యావరణ మరియు మానవ మెటాజినోమ్‌ల వంటి జీవుల మిశ్రమ సంఘం యొక్క మొత్తం జన్యు పదార్ధాల సమాహారం. ఇది సాగు చేయదగిన మరియు సాగు చేయలేని సూక్ష్మజీవుల జన్యువులను కలిగి ఉంటుంది. NGSతో కూడిన షాట్‌గన్ మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ వర్గీకరణ ప్రొఫైలింగ్ కంటే ఎక్కువ అందించడం ద్వారా పర్యావరణ నమూనాలలో పొందుపరిచిన ఈ క్లిష్టమైన జన్యు ప్రకృతి దృశ్యాలను అధ్యయనం చేస్తుంది, జాతుల వైవిధ్యం, సమృద్ధి డైనమిక్స్ మరియు సంక్లిష్ట జనాభా నిర్మాణాలపై కణిక అంతర్దృష్టులను కూడా అందిస్తుంది. వర్గీకరణ అధ్యయనాలకు అతీతంగా, షాట్‌గన్ మెటాజెనోమిక్స్ ఫంక్షనల్ జెనోమిక్స్ దృక్పథాన్ని కూడా అందిస్తుంది, ఎన్కోడ్ చేయబడిన జన్యువుల అన్వేషణను మరియు పర్యావరణ ప్రక్రియలలో వాటి పుటేటివ్ పాత్రలను అనుమతిస్తుంది. చివరగా, జన్యు మూలకాలు మరియు పర్యావరణ కారకాల మధ్య సహసంబంధ నెట్‌వర్క్‌ల స్థాపన సూక్ష్మజీవుల సంఘాలు మరియు వాటి పర్యావరణ నేపథ్యం మధ్య సంక్లిష్టమైన పరస్పర చర్య యొక్క సంపూర్ణ అవగాహనకు దోహదం చేస్తుంది. ముగింపులో, ఈ సంక్లిష్ట పర్యావరణ వ్యవస్థల్లో జన్యుశాస్త్రం మరియు జీవావరణ శాస్త్రం మధ్య బహుముఖ సంబంధాలను ప్రకాశింపజేసేందుకు, విభిన్న సూక్ష్మజీవుల సంఘాల జన్యుపరమైన చిక్కులను విప్పడానికి మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ కీలకమైన సాధనంగా నిలుస్తుంది.
ప్లాట్‌ఫారమ్‌లు: ఇల్యూమినా నోవాసెక్ మరియు DNBSEQ-T7
-
మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్-TGS
మెటాజినోమ్ అనేది పర్యావరణ మరియు మానవ మెటాజినోమ్‌ల వంటి జీవుల మిశ్రమ సంఘం యొక్క జన్యు పదార్ధాల సమాహారం. ఇది సాగు చేయదగిన మరియు సాగు చేయలేని సూక్ష్మజీవుల జన్యువులను కలిగి ఉంటుంది. మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ వర్గీకరణ ప్రొఫైలింగ్ కంటే ఎక్కువ అందించడం ద్వారా పర్యావరణ నమూనాలలో పొందుపరిచిన ఈ క్లిష్టమైన జన్యు ప్రకృతి దృశ్యాల అధ్యయనాన్ని అనుమతిస్తుంది. ఎన్కోడ్ చేయబడిన జన్యువులను మరియు పర్యావరణ ప్రక్రియలలో వాటి పుటేటివ్ పాత్రలను అన్వేషించడం ద్వారా ఇది ఫంక్షనల్ జెనోమిక్స్ దృక్పథాన్ని కూడా అందిస్తుంది. ఇల్యూమినా సీక్వెన్సింగ్‌తో సాంప్రదాయ షాట్‌గన్ విధానాలు మెటాజెనోమిక్ అధ్యయనాలలో విస్తృతంగా ఉపయోగించబడుతున్నప్పటికీ, నానోపోర్ మరియు ప్యాక్‌బయో లాంగ్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్ యొక్క ఆగమనం ఈ రంగాన్ని మార్చింది. నానోపోర్ మరియు ప్యాక్‌బయో సాంకేతికత దిగువ బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణలను మెరుగుపరుస్తుంది, ముఖ్యంగా మెటాజెనోమ్ అసెంబ్లీ, మరింత నిరంతర సమావేశాలకు భరోసా ఇస్తుంది. నానోపోర్-ఆధారిత మరియు ప్యాక్‌బయో-ఆధారిత మెటాజెనోమిక్స్ సంక్లిష్ట సూక్ష్మజీవుల (మాస్, EL, మరియు ఇతరులు, నేచర్ బయోటెక్, 2020) నుండి పూర్తి మరియు మూసివేయబడిన బ్యాక్టీరియా జన్యువులను విజయవంతంగా రూపొందించాయని నివేదికలు సూచిస్తున్నాయి. నానోపోర్ రీడ్‌లను ఇల్యూమినా రీడ్‌లతో ఏకీకృతం చేయడం వలన నానోపోర్ యొక్క అంతర్లీన తక్కువ ఖచ్చితత్వాన్ని తగ్గించడం ద్వారా ఎర్రర్ దిద్దుబాటు కోసం ఒక వ్యూహాత్మక విధానాన్ని అందిస్తుంది. ఈ సినర్జిస్టిక్ కలయిక ప్రతి సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్ యొక్క బలాన్ని ప్రభావితం చేస్తుంది, సంభావ్య పరిమితులను అధిగమించడానికి మరియు మెటాజెనోమిక్ విశ్లేషణల యొక్క ఖచ్చితత్వం మరియు విశ్వసనీయతను అభివృద్ధి చేయడానికి బలమైన పరిష్కారాన్ని అందిస్తుంది.
ప్లాట్‌ఫారమ్: నానోపోర్ ప్రోమెథియాన్ 48, ఇల్యూమియా మరియు ప్యాక్‌బయో రివియో
-
మొత్తం జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (WGBS)
హోల్ జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (WGBS) అనేది DNA మిథైలేషన్ యొక్క లోతైన అన్వేషణకు బంగారు-ప్రామాణిక పద్దతిగా నిలుస్తుంది, ప్రత్యేకంగా సైటోసిన్ (5-mC)లో ఐదవ స్థానం, జన్యు వ్యక్తీకరణ మరియు సెల్యులార్ కార్యకలాపాల యొక్క కీలక నియంత్రకం. WGBS యొక్క అంతర్లీన సూత్రం బైసల్ఫైట్ చికిత్సను కలిగి ఉంటుంది, ఇది మిథైలేటెడ్ సైటోసైన్‌లను మారకుండా వదిలివేసేటప్పుడు, అన్‌మీథైలేటెడ్ సైటోసిన్‌లను యురేసిల్‌గా (C నుండి U) మార్చడాన్ని ప్రేరేపిస్తుంది. ఈ సాంకేతికత సింగిల్-బేస్ రిజల్యూషన్‌ను అందిస్తుంది, పరిశోధకులు మిథైలోమ్‌ను సమగ్రంగా పరిశోధించడానికి మరియు వివిధ పరిస్థితులతో సంబంధం ఉన్న అసాధారణ మిథైలేషన్ నమూనాలను వెలికితీసేందుకు అనుమతిస్తుంది, ముఖ్యంగా క్యాన్సర్. WGBSని ఉపయోగించడం ద్వారా, శాస్త్రవేత్తలు జీనోమ్-వైడ్ మిథైలేషన్ ల్యాండ్‌స్కేప్‌లలో అసమానమైన అంతర్దృష్టులను పొందవచ్చు, విభిన్న జీవ ప్రక్రియలు మరియు వ్యాధులకు కారణమయ్యే బాహ్యజన్యు విధానాలపై సూక్ష్మ అవగాహనను అందిస్తారు.
-
హై త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ (ATAC-seq)తో ట్రాన్స్‌పోసేస్-యాక్సెసిబుల్ క్రోమాటిన్ కోసం విశ్లేషణ
ATAC-seq అనేది జీనోమ్-వైడ్ క్రోమాటిన్ యాక్సెసిబిలిటీ విశ్లేషణ కోసం ఉపయోగించే హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ టెక్నిక్. దీని ఉపయోగం జన్యు వ్యక్తీకరణపై ప్రపంచ బాహ్యజన్యు నియంత్రణ యొక్క సంక్లిష్ట విధానాల గురించి లోతైన అవగాహనను అందిస్తుంది. సీక్వెన్సింగ్ అడాప్టర్‌లను చొప్పించడం ద్వారా ఓపెన్ క్రోమాటిన్ ప్రాంతాలను ఏకకాలంలో ఫ్రాగ్మెంట్ చేయడానికి మరియు ట్యాగ్ చేయడానికి ఈ పద్ధతి హైపర్యాక్టివ్ Tn5 ట్రాన్స్‌పోసేస్‌ను ఉపయోగిస్తుంది. తదుపరి PCR యాంప్లిఫికేషన్ ఒక సీక్వెన్సింగ్ లైబ్రరీని సృష్టిస్తుంది, ఇది నిర్దిష్ట స్థల-సమయ పరిస్థితులలో ఓపెన్ క్రోమాటిన్ ప్రాంతాలను సమగ్రంగా గుర్తించడానికి అనుమతిస్తుంది. ATAC-seq కేవలం ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ ఫ్యాక్టర్ బైండింగ్ సైట్‌లు లేదా నిర్దిష్ట హిస్టోన్-మాడిఫైడ్ రీజియన్‌లపై దృష్టి సారించే పద్ధతుల వలె కాకుండా, యాక్సెస్ చేయగల క్రోమాటిన్ ల్యాండ్‌స్కేప్‌ల యొక్క సమగ్ర వీక్షణను అందిస్తుంది. ఈ ఓపెన్ క్రోమాటిన్ ప్రాంతాలను క్రమం చేయడం ద్వారా, ATAC-seq క్రియాశీల రెగ్యులేటరీ సీక్వెన్సులు మరియు సంభావ్య ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ ఫ్యాక్టర్ బైండింగ్ సైట్‌లకు ఎక్కువ అవకాశం ఉన్న ప్రాంతాలను వెల్లడిస్తుంది, జన్యువు అంతటా జన్యు వ్యక్తీకరణ యొక్క డైనమిక్ మాడ్యులేషన్‌పై విలువైన అంతర్దృష్టులను అందిస్తుంది.
-
16S/18S/ITS యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్-PacBio
16S మరియు 18S rRNA జన్యువులు, అంతర్గత లిప్యంతరీకరణ స్పేసర్ (ITS) ప్రాంతంతో పాటు, అత్యంత సంరక్షించబడిన మరియు హైపర్-వేరియబుల్ ప్రాంతాల కలయిక కారణంగా కీలకమైన పరమాణు వేలిముద్రల గుర్తులుగా పనిచేస్తాయి, ఇవి ప్రొకార్యోటిక్ మరియు యూకారియోటిక్ జీవులను వర్గీకరించడానికి అమూల్యమైన సాధనాలను తయారు చేస్తాయి. ఈ ప్రాంతాల యొక్క విస్తరణ మరియు క్రమం వివిధ పర్యావరణ వ్యవస్థలలో సూక్ష్మజీవుల కూర్పు మరియు వైవిధ్యాన్ని పరిశోధించడానికి ఐసోలేషన్-రహిత విధానాన్ని అందిస్తాయి. ఇల్యూమినా సీక్వెన్సింగ్ సాధారణంగా 16S మరియు ITS1 యొక్క V3-V4 వంటి చిన్న హైపర్‌వేరియబుల్ ప్రాంతాలను లక్ష్యంగా చేసుకుంటుండగా, 16S, 18S మరియు ITS యొక్క పూర్తి నిడివిని క్రమం చేయడం ద్వారా ఉన్నతమైన వర్గీకరణ ఉల్లేఖనాన్ని సాధించవచ్చని నిరూపించబడింది. ఈ సమగ్ర విధానం ఖచ్చితమైన వర్గీకరించబడిన సీక్వెన్స్‌ల యొక్క అధిక శాతాన్ని కలిగిస్తుంది, జాతుల గుర్తింపు వరకు విస్తరించే రిజల్యూషన్ స్థాయిని సాధించింది. PacBio యొక్క సింగిల్-మాలిక్యూల్ రియల్-టైమ్ (SMRT) సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్ ఇల్యూమినా సీక్వెన్సింగ్ యొక్క ఖచ్చితత్వానికి పోటీగా పూర్తి-నిడివి గల యాంప్లికాన్‌లను కవర్ చేసే అత్యంత ఖచ్చితమైన లాంగ్ రీడ్‌లను (HiFi) అందించడం ద్వారా ప్రత్యేకంగా నిలుస్తుంది. ఈ సామర్ధ్యం పరిశోధకులు సాటిలేని ప్రయోజనాన్ని పొందేందుకు అనుమతిస్తుంది - జన్యు ప్రకృతి దృశ్యం యొక్క విస్తృత దృశ్యం. పొడిగించిన కవరేజ్ జాతుల ఉల్లేఖనంలో రిజల్యూషన్‌ను గణనీయంగా పెంచుతుంది, ముఖ్యంగా బ్యాక్టీరియా లేదా ఫంగల్ కమ్యూనిటీలలో, సూక్ష్మజీవుల జనాభా యొక్క చిక్కులను లోతుగా అర్థం చేసుకోవడానికి వీలు కల్పిస్తుంది.
-
16S/18S/ITS యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్-NGS
ఇల్యూమినా సాంకేతికతతో యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్, ప్రత్యేకంగా 16S, 18S మరియు ITS జన్యు గుర్తులను లక్ష్యంగా చేసుకోవడం, సూక్ష్మజీవుల సంఘాలలోని ఫైలోజెని, వర్గీకరణ మరియు జాతుల సమృద్ధిని విప్పడానికి ఒక శక్తివంతమైన పద్ధతి. ఈ విధానంలో హౌస్ కీపింగ్ జన్యు మార్కర్ల యొక్క హైపర్‌వేరియబుల్ ప్రాంతాలను క్రమం చేయడం ఉంటుంది. నిజానికి ద్వారా పరమాణు వేలిముద్రగా పరిచయం చేయబడిందివోసెస్ మరియు ఇతరులు1977లో, ఈ సాంకేతికత ఐసోలేషన్ రహిత విశ్లేషణలను ప్రారంభించడం ద్వారా మైక్రోబయోమ్ ప్రొఫైలింగ్‌లో విప్లవాత్మక మార్పులు చేసింది. 16S (బ్యాక్టీరియా), 18S (శిలీంధ్రాలు), మరియు ఇంటర్నల్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టెడ్ స్పేసర్ (ITS, శిలీంధ్రాలు) యొక్క సీక్వెన్సింగ్ ద్వారా, పరిశోధకులు సమృద్ధిగా ఉన్న జాతులను మాత్రమే కాకుండా అరుదైన మరియు గుర్తించబడని వాటిని కూడా గుర్తించగలరు. ఒక కీలకమైన సాధనంగా విస్తృతంగా స్వీకరించబడింది, యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్ అనేది మానవ నోరు, ప్రేగులు, మలం మరియు అంతకు మించి విభిన్న వాతావరణాలలో అవకలన సూక్ష్మజీవుల కూర్పులను గుర్తించడంలో సాధనంగా మారింది.
-
బాక్టీరియల్ మరియు ఫంగల్ హోల్ జీనోమ్ రీ-సీక్వెన్సింగ్
సూక్ష్మజీవుల జన్యువుల పూర్తి మరియు పోలికను ప్రారంభించడం ద్వారా సూక్ష్మజీవుల జన్యుశాస్త్రాన్ని అభివృద్ధి చేయడానికి బాక్టీరియల్ మరియు ఫంగల్ పూర్తి-జీనోమ్ రీ-సీక్వెన్సింగ్ ప్రాజెక్ట్‌లు కీలకమైనవి. ఇది కిణ్వ ప్రక్రియ ఇంజనీరింగ్, పారిశ్రామిక ప్రక్రియల ఆప్టిమైజేషన్ మరియు ద్వితీయ జీవక్రియ మార్గాల అన్వేషణను సులభతరం చేస్తుంది. ఇంకా, వైద్యం, వ్యవసాయం మరియు పర్యావరణ శాస్త్రంలో విస్తృత చిక్కులతో పర్యావరణ అనుసరణను అర్థం చేసుకోవడానికి, జాతులను ఆప్టిమైజ్ చేయడానికి మరియు జన్యు పరిణామ డైనమిక్‌లను బహిర్గతం చేయడానికి ఫంగల్ మరియు బ్యాక్టీరియా రీ-సీక్వెన్సింగ్ కీలకం.
-
PacBio-పూర్తి-నిడివి 16S/18S/ITS యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్
యాంప్లికాన్ (16S/18S/ITS) ప్లాట్‌ఫారమ్ మైక్రోబియల్ డైవర్సిటీ ప్రాజెక్ట్ విశ్లేషణలో సంవత్సరాల అనుభవంతో అభివృద్ధి చేయబడింది, ఇందులో ప్రామాణిక ప్రాథమిక విశ్లేషణ మరియు వ్యక్తిగతీకరించిన విశ్లేషణ ఉన్నాయి: ప్రాథమిక విశ్లేషణ ప్రస్తుత సూక్ష్మజీవుల పరిశోధన యొక్క ప్రధాన స్రవంతి విశ్లేషణ కంటెంట్‌ను కవర్ చేస్తుంది, విశ్లేషణ కంటెంట్ గొప్పది మరియు సమగ్రమైనది, మరియు విశ్లేషణ ఫలితాలు ప్రాజెక్ట్ నివేదికల రూపంలో ప్రదర్శించబడతాయి; వ్యక్తిగతీకరించిన విశ్లేషణ యొక్క కంటెంట్ వైవిధ్యమైనది. వ్యక్తిగతీకరించిన అవసరాలను గ్రహించడానికి ప్రాథమిక విశ్లేషణ నివేదిక మరియు పరిశోధన ప్రయోజనం ప్రకారం నమూనాలను ఎంపిక చేసుకోవచ్చు మరియు పారామితులను సరళంగా సెట్ చేయవచ్చు. Windows ఆపరేటింగ్ సిస్టమ్, సాధారణ మరియు వేగవంతమైనది.
-
PacBio-పూర్తి-నిడివి ట్రాన్స్క్రిప్ట్ (నాన్-రిఫరెన్స్)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform సీక్వెన్సింగ్ డేటాను ఇన్‌పుట్‌గా తీసుకుంటే, ఈ యాప్ పూర్తి-నిడివి గల ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సీక్వెన్స్‌లను (అసెంబ్లీ లేకుండా) గుర్తించగలదు. రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌కు వ్యతిరేకంగా పూర్తి-నిడివి సీక్వెన్స్‌లను మ్యాప్ చేయడం ద్వారా, తెలిసిన జన్యువులు, ట్రాన్‌స్క్రిప్ట్‌లు, కోడింగ్ ప్రాంతాలు మొదలైన వాటి ద్వారా ట్రాన్స్‌క్రిప్ట్‌లను ఆప్టిమైజ్ చేయవచ్చు. ఈ సందర్భంలో, ప్రత్యామ్నాయ స్ప్లికింగ్ వంటి mRNA నిర్మాణాల యొక్క మరింత ఖచ్చితమైన గుర్తింపును సాధించవచ్చు. NGS ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ డేటాతో ఉమ్మడి విశ్లేషణ మరింత సమగ్రమైన ఉల్లేఖనాన్ని మరియు ట్రాన్స్క్రిప్ట్ స్థాయిలో వ్యక్తీకరణలో మరింత ఖచ్చితమైన పరిమాణాన్ని అనుమతిస్తుంది, ఇది దిగువ అవకలన వ్యక్తీకరణ మరియు క్రియాత్మక విశ్లేషణకు ఎక్కువగా ప్రయోజనం చేకూరుస్తుంది.
-
తగ్గిన ప్రాతినిధ్యం బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (RRBS)
DNA మిథైలేషన్ పరిశోధనలో హోల్ జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (WGBS)కి తక్కువ ఖర్చుతో కూడిన మరియు సమర్థవంతమైన ప్రత్యామ్నాయంగా తగ్గిన ప్రాతినిధ్యం బిసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (RRBS) ఉద్భవించింది. ఒకే బేస్ రిజల్యూషన్‌లో మొత్తం జీనోమ్‌ను పరిశీలించడం ద్వారా WGBS సమగ్ర అంతర్దృష్టులను అందించినప్పటికీ, దాని అధిక ధర పరిమితం చేసే అంశం. జన్యువు యొక్క ప్రతినిధి భాగాన్ని ఎంపిక చేసి విశ్లేషించడం ద్వారా RRBS వ్యూహాత్మకంగా ఈ సవాలును తగ్గిస్తుంది. ఈ పద్దతి MspI క్లీవేజ్ ద్వారా CpG ద్వీపం అధికంగా ఉండే ప్రాంతాలను సుసంపన్నం చేయడంపై ఆధారపడి ఉంటుంది, తర్వాత 200-500/600 bps శకలాలు పరిమాణం ఎంపిక చేయబడుతుంది. పర్యవసానంగా, CpG ద్వీపాలకు దగ్గరగా ఉన్న ప్రాంతాలు మాత్రమే క్రమం చేయబడతాయి, అయితే సుదూర CpG ద్వీపాలు ఉన్నవి విశ్లేషణ నుండి మినహాయించబడ్డాయి. ఈ ప్రక్రియ, బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్‌తో కలిపి, DNA మిథైలేషన్‌ను అధిక-రిజల్యూషన్‌తో గుర్తించడానికి అనుమతిస్తుంది మరియు సీక్వెన్సింగ్ విధానం, PE150, మిథైలేషన్ ప్రొఫైలింగ్ యొక్క సామర్థ్యాన్ని పెంచడం ద్వారా మధ్యలో కాకుండా ఇన్‌సర్ట్‌ల చివరలపై ప్రత్యేకంగా దృష్టి సారిస్తుంది. RRBS అనేది ఒక అమూల్యమైన సాధనం, ఇది ఖర్చుతో కూడుకున్న DNA మిథైలేషన్ పరిశోధనను అనుమతిస్తుంది మరియు బాహ్యజన్యు విధానాల గురించిన జ్ఞానాన్ని పెంచుతుంది.
-
ప్రొకార్యోటిక్ RNA సీక్వెన్సింగ్
RNA సీక్వెన్సింగ్ నిర్దిష్ట పరిస్థితులలో కణాలలోని అన్ని RNA ట్రాన్స్‌క్రిప్ట్‌ల సమగ్ర ప్రొఫైలింగ్‌ను శక్తివంతం చేస్తుంది. ఈ అత్యాధునిక సాంకేతికత ఒక శక్తివంతమైన సాధనంగా పనిచేస్తుంది, సంక్లిష్టమైన జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లు, జన్యు నిర్మాణాలు మరియు విభిన్న జీవ ప్రక్రియలతో అనుబంధించబడిన పరమాణు విధానాలను ఆవిష్కరిస్తుంది. ప్రాథమిక పరిశోధన, క్లినికల్ డయాగ్నస్టిక్స్ మరియు డ్రగ్ డెవలప్‌మెంట్‌లో విస్తృతంగా స్వీకరించబడిన RNA సీక్వెన్సింగ్ సెల్యులార్ డైనమిక్స్ మరియు జన్యు నియంత్రణ యొక్క చిక్కులపై అంతర్దృష్టులను అందిస్తుంది. మా ప్రొకార్యోటిక్ RNA నమూనా ప్రాసెసింగ్ ప్రొకార్యోటిక్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్‌ల కోసం రూపొందించబడింది, ఇందులో rRNA క్షీణత మరియు దిశాత్మక లైబ్రరీ తయారీ ఉంటుంది.
ప్లాట్‌ఫారమ్: ఇల్యూమినా నోవాసెక్
-
మెటాట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్
ఇల్యూమినా సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీని ప్రభావితం చేస్తూ, BMKGENE యొక్క మెటాట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ సర్వీస్ వివిధ రకాల సూక్ష్మజీవుల యొక్క డైనమిక్ జన్యు వ్యక్తీకరణను ఆవిష్కరిస్తుంది, యూకారియోట్‌లను ప్రొకార్యోట్‌లు మరియు వైరస్‌ల వరకు విస్తరించి, నేల, నీరు, సముద్రం, మలం మరియు గట్ వంటి సహజ వాతావరణంలో. సంక్లిష్టమైన సూక్ష్మజీవుల సంఘాల పూర్తి జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లను పరిశోధించడానికి మా సమగ్ర సేవ పరిశోధకులకు అధికారం ఇస్తుంది. వర్గీకరణ విశ్లేషణకు మించి, మా మెటాట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ సేవ ఫంక్షనల్ ఎన్‌రిచ్‌మెంట్‌లో అన్వేషణను సులభతరం చేస్తుంది, విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు మరియు వాటి పాత్రలపై వెలుగునిస్తుంది. మీరు ఈ విభిన్న పర్యావరణ సముదాయాలలో జన్యు వ్యక్తీకరణ, వర్గీకరణ వైవిధ్యం మరియు ఫంక్షనల్ డైనమిక్స్ యొక్క సంక్లిష్ట ప్రకృతి దృశ్యాలను నావిగేట్ చేస్తున్నప్పుడు జీవసంబంధమైన అంతర్దృష్టుల సంపదను వెలికితీయండి.
-
డి నోవో ఫంగల్ జీనోమ్ అసెంబ్లీ
BMKGENE శిలీంధ్ర జన్యువుల కోసం బహుముఖ పరిష్కారాలను అందిస్తుంది, విభిన్న పరిశోధన అవసరాలు మరియు కావలసిన జన్యు పరిపూర్ణతను అందిస్తుంది. షార్ట్-రీడ్ ఇల్యూమినా సీక్వెన్సింగ్‌ని ఉపయోగించడం ద్వారా డ్రాఫ్ట్ జీనోమ్‌ను రూపొందించడానికి అనుమతిస్తుంది. నానోపోర్ లేదా ప్యాక్‌బియోను ఉపయోగించి షార్ట్-రీడ్‌లు మరియు లాంగ్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్‌లు పొడవైన కాంటిగ్‌లతో మరింత శుద్ధి చేయబడిన ఫంగల్ జన్యువు కోసం మిళితం చేయబడతాయి. అంతేకాకుండా, హై-సి సీక్వెన్సింగ్‌ను సమగ్రపరచడం సామర్థ్యాలను మరింత మెరుగుపరుస్తుంది, పూర్తి క్రోమోజోమ్-స్థాయి జన్యువును సాధించడానికి వీలు కల్పిస్తుంది.
