హీట్ మ్యాప్
హీట్‌మ్యాప్ సాధనం మ్యాట్రిక్స్ డేటా ఫైల్‌ను ఇన్‌పుట్‌గా అంగీకరిస్తుంది మరియు వినియోగదారులను ఫిల్టర్ చేయడానికి, సాధారణీకరించడానికి మరియు క్లస్టర్ డేటాను అనుమతిస్తుంది. హీట్ మ్యాప్స్ కోసం ప్రాధమిక ఉపయోగం కేసు వేర్వేరు నమూనాల మధ్య జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయి యొక్క క్లస్టర్ విశ్లేషణ.
జన్యు ఉల్లేఖనం
జన్యు ఉల్లేఖన సాధనం వివిధ డేటాబేస్లకు వ్యతిరేకంగా ఇన్పుట్ ఫాస్టా ఫైళ్ళ యొక్క శ్రేణి అమరిక ఆధారంగా జన్యు ఉల్లేఖనాన్ని చేస్తుంది.
ప్రాథమిక స్థానిక అమరిక శోధన సాధనం (బ్లాస్ట్)
పేలుడు సాధనం NCBI బ్లాస్ట్ యొక్క BMKCloud ఇంటిగ్రేటెడ్ వెర్షన్ మరియు BMKCloud ఖాతాకు అప్‌లోడ్ చేసిన డేటాను ఉపయోగించి అదే ఫంక్షన్లను నిర్వహించడానికి ఉపయోగించవచ్చు.
CDS_UTR ప్రిడిక్షన్
CDS_UTR ప్రిడిక్షన్ సాధనం తెలిసిన ప్రోటీన్ డేటాబేస్ మరియు ORF అంచనా ఫలితాలకు వ్యతిరేకంగా పేలుడు ఫలితాల ఆధారంగా ఇచ్చిన ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సన్నివేశాలలో కోడింగ్ ప్రాంతాలు (CDS) మరియు నాన్-కోడింగ్ ప్రాంతాలు (యుటిఆర్) ను అంచనా వేయడానికి రూపొందించబడింది.
మాన్హాటన్ ప్లాట్
మాన్హాటన్ ప్లాట్ సాధనం అధిక నమూనా ప్రయోగాల ప్రదర్శనను అనుమతిస్తుంది మరియు సాధారణంగా దీనిని జన్యు-వ్యాప్తంగా అసోసియేషన్ అధ్యయనాలలో (GWA లు) ఉపయోగిస్తారు.
సిర్కోస్ రేఖాచిత్రం
సిర్కోస్ రేఖాచిత్రం సాధనం జన్యువు అంతటా జన్యు లక్షణం ఎలా పంపిణీ చేయబడుతుందో సమర్థవంతమైన విజువలైజేషన్‌ను అందిస్తుంది. సాధారణ లక్షణాలలో పరిమాణాత్మక లోకి, SNP లు, ఇండెల్స్, స్ట్రక్చరల్ మరియు కాపీ నంబర్ వేరియంట్లు ఉన్నాయి.
జీన్ ఒంటాలజీ (GO) సుసంపన్నం
GO సుసంపన్నత సాధనం ఫంక్షనల్ ఎన్‌రిచ్మెంట్ విశ్లేషణను అందిస్తుంది. ఈ సాధనంలోని ప్రాధమిక సాఫ్ట్‌వేర్ టాప్‌గో-బయోకండక్టర్ ప్యాకేజీ, ఇందులో అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ, GO సుసంపన్నం విశ్లేషణ మరియు ఫలితాల విజువలైజేషన్ ఉన్నాయి.
వెయిటెడ్ జీన్ కో-ఎక్స్‌ప్రెషన్ నెట్‌వర్క్ విశ్లేషణ (WGCNA)
WGCNA అనేది జన్యు సహ-వ్యక్తీకరణ మాడ్యూళ్ళను కనుగొనడానికి విస్తృతంగా ఉపయోగించే డేటా మైనింగ్ పద్ధతి. ఇది మైక్రోఅరే మరియు ఎన్జిఎస్ జన్యు వ్యక్తీకరణ డేటాతో సహా వివిధ వ్యక్తీకరణ డేటాసెట్‌కు వర్తిస్తుంది.
ఇంటర్‌ప్రోస్కాన్
ఇంటర్‌ప్రోస్కాన్ సాధనం ఇంటర్‌ప్రో ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ విశ్లేషణ మరియు వర్గీకరణను అందిస్తుంది.
KEGG సుసంపన్నతకు వెళ్ళండి
GO KEGG సుసంపన్నత సాధనం, అందించిన జన్యు సమితి మరియు సంబంధిత ఉల్లేఖన ఆధారంగా GO సుసంపన్న హిస్టోగ్రాం, KEGG సుసంపన్నత హిస్టోగ్రామ్ మరియు KEGG సుసంపన్నత మార్గం.