ప్లాంట్/యానిమల్ హోల్ జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్
సర్వీస్ ఫీచర్లు
● లైబ్రరీ తయారీ ప్రామాణికంగా లేదా PCR రహితంగా ఉండవచ్చు
● 4 సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లలో అందుబాటులో ఉంది: Illumina NovaSeq, MGI T7, Nanopore Promethion P48, లేదా PacBio Revio.
● బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణ వేరియంట్‌ల గుర్తింపుపై దృష్టి సారించింది: SNP, InDel, SV మరియు CNV
సేవా ప్రయోజనాలు
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం మరియు ప్రచురణ రికార్డులు: 1000 కంటే ఎక్కువ జాతుల కోసం జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్‌లో సంచిత అనుభవం 5000 కంటే ఎక్కువ సంచిత ప్రభావ కారకంతో 1000కి పైగా ప్రచురించబడిన కేసులకు దారితీసింది.
●సమగ్ర బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణ: వేరియేషన్ కాలింగ్ మరియు ఫంక్షన్ ఉల్లేఖనతో సహా.
● అమ్మకాల తర్వాత మద్దతు:మా నిబద్ధత 3-నెలల అమ్మకాల తర్వాత సేవా వ్యవధితో ప్రాజెక్ట్ పూర్తి కాకుండా విస్తరించింది. ఈ సమయంలో, ఫలితాలకు సంబంధించిన ఏవైనా సందేహాలను పరిష్కరించడానికి మేము ప్రాజెక్ట్ ఫాలో-అప్, ట్రబుల్షూటింగ్ సహాయం మరియు Q&A సెషన్‌లను అందిస్తాము.
●సమగ్ర వ్యాఖ్యానం: గుర్తించబడిన వైవిధ్యాలతో జన్యువులను క్రియాత్మకంగా ఉల్లేఖించడానికి మరియు సంబంధిత సుసంపన్నత విశ్లేషణను నిర్వహించడానికి మేము బహుళ డేటాబేస్‌లను ఉపయోగిస్తాము, బహుళ పరిశోధన ప్రాజెక్ట్‌లపై అంతర్దృష్టులను అందిస్తాము.
సర్వీస్ స్పెసిఫికేషన్స్
| వైవిధ్యాలను గుర్తించాలి | సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం | సిఫార్సు చేయబడిన లోతు |
| SNP మరియు InDel | ఇల్యూమినా నోవాసెక్ PE150 లేదా MGI T7 | 10x |
| SV మరియు CNV (తక్కువ ఖచ్చితమైనవి) | 30x | |
| SV మరియు CNV (మరింత ఖచ్చితమైనది) | నానోపోర్ ప్రోమ్ P48 | 20x |
| SNPలు, ఇండెల్స్, SV మరియు CNV | ప్యాక్‌బయో రివియో | 10x |
నమూనా అవసరాలు
| కణజాలం లేదా సంగ్రహించిన న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాలు | ఇల్యూమినా/MGI | నానోపోర్ | ప్యాక్‌బయో
| ||
| జంతు విసెరా | 0.5-1 గ్రా | ≥ 3.5 గ్రా
| ≥ 3.5 గ్రా
| ||
| జంతు కండరం | ≥ 5 గ్రా
| ≥ 5 గ్రా
| |||
| క్షీరద రక్తం | 1.5 మి.లీ | ≥ 0.5 మి.లీ
| ≥ 5 మి.లీ
| ||
| పౌల్ట్రీ/ఫిష్ రక్తం | ≥ 0.1 మి.లీ
| ≥ 0.5 మి.లీ
| |||
| మొక్క - తాజా ఆకు | 1-2 గ్రా | ≥ 2 గ్రా
| ≥ 5 గ్రా
| ||
| కల్చర్డ్ సెల్స్ |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| క్రిమి మృదు కణజాలం/వ్యక్తిగతం | 0.5-1 గ్రా | ≥ 1 గ్రా
| ≥ 3 గ్రా
| ||
| సంగ్రహించిన DNA
| ఏకాగ్రత: ≥ 1 ng/ µL మొత్తం: ≥ 30 ng పరిమితం లేదా అధోకరణం లేదా కాలుష్యం లేదు
| ఏకాగ్రత మొత్తం
OD260/280
OD260/230
పరిమితం లేదా అధోకరణం లేదా కాలుష్యం లేదు
| ≥ 40 ng/ µL 4 µg/ఫ్లో సెల్/నమూనా
1.7-2.2
≥1.5 | ఏకాగ్రత మొత్తం
OD260/280
OD260/230
పరిమితం లేదా అధోకరణం లేదా కాలుష్యం లేదు | ≥ 50 ng/ µL 10 µg/ఫ్లో సెల్/నమూనా
1.7-2.2
1.8-2.5 |
| PCR రహిత లైబ్రరీ తయారీ: ఏకాగ్రత≥ 40 ng/ µL మొత్తం≥ 500 ng | |||||
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
నమూనా డెలివరీ
DNA వెలికితీత
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
డేటా డెలివరీ
కింది విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది:
- ముడి డేటా నాణ్యత నియంత్రణ
- రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌కు అమరిక యొక్క గణాంకాలు
- వేరియంట్ గుర్తింపు: SNP, InDel, SV మరియు CNV
- వేరియంట్‌ల ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖనం
రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌కు అమరిక యొక్క గణాంకాలు - సీక్వెన్సింగ్ డెప్త్ డిస్ట్రిబ్యూషన్
బహుళ నమూనాల మధ్య SNP కాలింగ్
InDel గుర్తింపు - CDS ప్రాంతం మరియు జన్యు-వ్యాప్త ప్రాంతంలో InDel పొడవు యొక్క గణాంకాలు
జీనోమ్ అంతటా వేరియంట్ పంపిణీ - సర్కోస్ ప్లాట్
గుర్తించబడిన వైవిధ్యాలతో జన్యువుల ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖనం - జీన్ ఒంటాలజీ
చై, Q. మరియు ఇతరులు. (2023) 'ఒక గ్లూటాతియోన్ S-ట్రాన్స్‌ఫేరేస్ GhTT19 పత్తిలో ఆంథోసైనిన్ చేరడం నియంత్రించడం ద్వారా పూల రేకుల పిగ్మెంటేషన్‌ను నిర్ణయిస్తుంది', ప్లాంట్ బయోటెక్నాలజీ జర్నల్, 21(2), p. 433. doi: 10.1111/PBI.13965.
చెంగ్, H. మరియు ఇతరులు. (2023) 'క్రోమోజోమ్-స్థాయి వైల్డ్ హెవియా బ్రాసిలియెన్సిస్ జీనోమ్ రబ్బరు దిగుబడిని పెంచడానికి జన్యు-సహాయక పెంపకం మరియు విలువైన లోకీ కోసం కొత్త సాధనాలను అందిస్తుంది', ప్లాంట్ బయోటెక్నాలజీ జర్నల్, 21(5), pp. 1058–1072. doi: 10.1111/PBI.14018.
లి, ఎ. మరియు ఇతరులు. (2021) 'జీనోమ్ ఆఫ్ ది ఎస్టురైన్ ఓస్టెర్ వాతావరణ ప్రభావం మరియు అనుకూల ప్లాస్టిసిటీపై అంతర్దృష్టులను అందిస్తుంది', కమ్యూనికేషన్స్ బయాలజీ 2021 4:1, 4(1), పేజీలు. 1–12. doi: 10.1038/s42003-021-02823-6.
జెంగ్, T. మరియు ఇతరులు. (2022) 'కాలక్రమేణా చైనీస్ దేశీయ కోళ్లలో జన్యు మరియు మిథైలేషన్ మార్పుల విశ్లేషణ జాతుల పరిరక్షణపై అంతర్దృష్టిని అందిస్తుంది', కమ్యూనికేషన్స్ బయాలజీ, 5(1), పేజీలు. 1–12. doi: 10.1038/s42003-022-03907-7.
