నాన్-రిఫరెన్స్ ఆధారిత mRNA సీక్వెన్సింగ్-NGS
ఫీచర్లు
● లైబ్రరీ తయారీకి ముందు పాలీ mRNA క్యాప్చర్
● ఏదైనా రిఫరెన్స్ జన్యువుతో సంబంధం లేకుండా: ట్రాన్స్‌క్రిప్ట్‌ల డి నోవో అసెంబ్లీ ఆధారంగా, బహుళ డేటాబేస్‌లతో (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG) ఉల్లేఖించబడిన యూనిజెన్‌ల జాబితాను రూపొందించడం
● జన్యు వ్యక్తీకరణ మరియు ట్రాన్స్క్రిప్ట్ నిర్మాణం యొక్క సమగ్ర బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణ
సేవా ప్రయోజనాలు
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం: BMKGENE వద్ద 600,000 నమూనాలను ప్రాసెస్ చేసిన ట్రాక్ రికార్డ్‌తో, కణ కల్చర్‌లు, కణజాలాలు మరియు శరీర ద్రవాలు వంటి విభిన్న నమూనా రకాలను విస్తరించి, మా బృందం ప్రతి ప్రాజెక్ట్‌కి అనుభవ సంపదను అందిస్తుంది. మేము వివిధ పరిశోధన డొమైన్‌లలో 100,000 mRNA-Seq ప్రాజెక్ట్‌లను విజయవంతంగా మూసివేసాము.
●కఠినమైన నాణ్యత నియంత్రణ: మేము నమూనా మరియు లైబ్రరీ తయారీ నుండి సీక్వెన్సింగ్ మరియు బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ వరకు అన్ని దశలలో కోర్ కంట్రోల్ పాయింట్లను అమలు చేస్తాము. ఈ ఖచ్చితమైన పర్యవేక్షణ స్థిరంగా అధిక-నాణ్యత ఫలితాల డెలివరీని నిర్ధారిస్తుంది.
● సమగ్ర ఉల్లేఖన: మేము విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులను (DEGలు) క్రియాత్మకంగా ఉల్లేఖించడానికి బహుళ డేటాబేస్‌లను ఉపయోగిస్తాము మరియు ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ ప్రతిస్పందనకు అంతర్లీనంగా సెల్యులార్ మరియు మాలిక్యులర్ ప్రక్రియలపై అంతర్దృష్టులను అందజేస్తూ సంబంధిత సుసంపన్నత విశ్లేషణను చేస్తాము.
●పోస్ట్-సేల్స్ మద్దతు: మా నిబద్ధత 3-నెలల అమ్మకాల తర్వాత సేవా వ్యవధితో ప్రాజెక్ట్ పూర్తి కాకుండా విస్తరించింది. ఈ సమయంలో, ఫలితాలకు సంబంధించిన ఏవైనా సందేహాలను పరిష్కరించడానికి మేము ప్రాజెక్ట్ ఫాలో-అప్, ట్రబుల్షూటింగ్ సహాయం మరియు Q&A సెషన్‌లను అందిస్తాము.
నమూనా అవసరాలు మరియు డెలివరీ
| లైబ్రరీ | సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం | డేటా సిఫార్సు చేయబడింది | నాణ్యత నియంత్రణ |
| పాలీ ఎ సుసంపన్నం | ఇల్యూమినా PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
నమూనా అవసరాలు:
న్యూక్లియోటైడ్లు:
| Conc.(ng/μl) | మొత్తం (μg) | స్వచ్ఛత | సమగ్రత |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 జెల్‌పై చూపబడిన ప్రోటీన్ లేదా DNA కాలుష్యం పరిమితం లేదా లేదు. | మొక్కల కోసం: RIN≥4.0; జంతువుల కోసం: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; పరిమిత లేదా బేస్‌లైన్ ఎలివేషన్ లేదు |
● మొక్కలు:
రూట్, కాండం లేదా పెటల్: 450 mg
ఆకు లేదా విత్తనం: 300 మి.గ్రా
పండు: 1.2 గ్రా
● జంతువు:
గుండె లేదా ప్రేగు: 300 mg
విసెరా లేదా మెదడు: 240 మి.గ్రా
కండరాలు: 450 మి.గ్రా
ఎముకలు, జుట్టు లేదా చర్మం: 1గ్రా
● ఆర్థ్రోపోడ్స్:
కీటకాలు: 6గ్రా
క్రస్టేసియా: 300 మి.గ్రా
● మొత్తం రక్తం: 1 ట్యూబ్
● సెల్‌లు: 106 కణాలు
సిఫార్సు చేయబడిన నమూనా డెలివరీ
కంటైనర్: 2 ml సెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్ (టిన్ ఫాయిల్ సిఫార్సు చేయబడదు)
నమూనా లేబులింగ్: సమూహం+ప్రతిరూపం ఉదా A1, A2, A3; B1, B2, B3.
రవాణా:
1. డ్రై-ఐస్: నమూనాలను సంచుల్లో ప్యాక్ చేసి డ్రై-ఐస్‌లో పాతిపెట్టాలి.
2. RNA స్టేబుల్ ట్యూబ్‌లు: RNA నమూనాలను RNA స్టెబిలైజేషన్ ట్యూబ్‌లో ఎండబెట్టి (ఉదా RNAstable®) గది ఉష్ణోగ్రతలో రవాణా చేయవచ్చు.
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
ప్రయోగ రూపకల్పన
నమూనా డెలివరీ
RNA వెలికితీత
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకం తర్వాత సేవలు
బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్
ట్రాన్స్క్రిప్ట్ అసెంబ్లీ మరియు యూనిజీన్ ఎంపిక
యునిజెన్ ఉల్లేఖన
జీవ ప్రతిరూపాల నమూనా సహసంబంధం మరియు అంచనా
విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు (DEGలు)
DEGల ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖన
DEGల ఫంక్షనల్ ఎన్‌రిచ్‌మెంట్
క్యూరేటెడ్ ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా BMKGene యొక్క యూకారియోటిక్ NGS mRNA సీక్వెన్సింగ్ సేవల ద్వారా సులభతరం చేయబడిన పురోగతిని అన్వేషించండి.
షెన్, F. మరియు ఇతరులు. (2020) 'డి నోవో ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ అసెంబ్లీ మరియు సెక్స్-బియాస్డ్ జీన్ ఎక్స్‌ప్రెషన్ ఇన్ ది గోనాడ్స్ ఆఫ్ అముర్ క్యాట్ ఫిష్ (సిలురస్ అసోటస్)', జెనోమిక్స్, 112(3), pp. 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
జాంగ్, సి. మరియు ఇతరులు. (2016) 'బల్బ్ వాపు మరియు ఆనియన్‌లో అభివృద్ధి సమయంలో సుక్రోజ్ జీవక్రియ యొక్క ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ విశ్లేషణ (అల్లియం సెపా ఎల్.)', ఫ్రాంటియర్స్ ఇన్ ప్లాంట్ సైన్స్, 7(సెప్టెంబర్), పే. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
జు, సి. మరియు ఇతరులు. (2017) 'డి నోవో అసెంబ్లీ, క్యారెక్టరైజేషన్ మరియు ఉల్లేఖనం ఫర్ ది ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ ఆఫ్ సార్కోచెయిలిచ్థిస్ సినెన్సిస్', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
జూ, ఎల్. మరియు ఇతరులు. (2021) 'డి నోవో ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ విశ్లేషణ లవణీయత ఒత్తిడిలో పోడోకార్పస్ మాక్రోఫిల్లస్ యొక్క సాల్ట్ టాలరెన్స్‌పై అంతర్దృష్టులను అందిస్తుంది', BMC ప్లాంట్ బయాలజీ, 21(1), pp. 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/ఫిగర్స్/9.
