
రిఫరెన్స్ జీనోమ్తో mRNA-seq (NGS).
RNA-seq అనేది జీనోమ్లు మరియు ప్రోటీమ్ల మధ్య అంతరాన్ని తగ్గించడం ద్వారా జీవితం మరియు పంట శాస్త్రాలలో ఒక ప్రామాణిక సాధనం. కొత్త ట్రాన్స్క్రిప్ట్లను కనుగొనడంలో మరియు వాటి వ్యక్తీకరణను ఒక పరీక్షలో లెక్కించడంలో దీని బలం ఉంది. ఇది తులనాత్మక ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్ అధ్యయనాల కోసం విస్తృతంగా ఉపయోగించబడుతుంది, మార్పుచెందగలవారిని అడవి-రకాలతో పోల్చడం లేదా నిర్దిష్ట పరిస్థితులలో జన్యు వ్యక్తీకరణను బహిర్గతం చేయడం వంటి వివిధ లక్షణాలు లేదా సమలక్షణాలకు సంబంధించిన జన్యువులపై వెలుగునిస్తుంది. BMKCloud mRNA(రిఫరెన్స్) APP ఎక్స్ప్రెషన్ క్వాంటిఫికేషన్, డిఫరెన్షియల్ ఎక్స్ప్రెషన్ అనాలిసిస్(DEG), మరియు సీక్వెన్స్ స్ట్రక్చర్ విశ్లేషణలను mRNA-seq(NGS) బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ పైప్లైన్లోకి అనుసంధానిస్తుంది మరియు సౌలభ్యం మరియు వినియోగదారు-స్నేహపూర్వకతను నిర్ధారిస్తుంది. వినియోగదారులు వారి RNA-seq డేటాను క్లౌడ్కు అప్లోడ్ చేయవచ్చు, ఇక్కడ యాప్ సమగ్రమైన, వన్-స్టాప్ బయోఇన్ఫర్మేటిక్ అనాలిసిస్ సొల్యూషన్ను అందిస్తుంది. అదనంగా, ఇది కస్టమర్ అనుభవానికి ప్రాధాన్యతనిస్తుంది, వినియోగదారుల నిర్దిష్ట అవసరాలకు అనుగుణంగా వ్యక్తిగతీకరించిన కార్యకలాపాలను అందిస్తుంది. వినియోగదారులు పారామితులను సెట్ చేయవచ్చు మరియు పైప్లైన్ మిషన్ను స్వయంగా సమర్పించవచ్చు, ఇంటరాక్టివ్ రిపోర్ట్ను తనిఖీ చేయవచ్చు, డేటా/రేఖాచిత్రాలను వీక్షించవచ్చు మరియు పూర్తి డేటా మైనింగ్ వంటి: లక్ష్య జన్యు ఎంపిక, ఫంక్షనల్ క్లస్టరింగ్, రేఖాచిత్రం మొదలైనవి.
వేదిక:ఇల్యూమినా, MGI
వ్యూహం:RNA-Seq
లేఅవుట్: ప్యారీడ్, క్లీన్-డేటా.
లైబ్రరీ రకం:fr-అన్స్ట్రాండ్, fr-ఫస్ట్స్ట్రాండ్ లేదా fr-సెకండ్స్ట్రాండ్
చదువు పొడవు:150 bp
ఫైల్ రకం:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz లేదా *.fq.gz. వ్యవస్థ ఉంటుందివారి ఫైల్ పేర్ల ప్రకారం .fastq ఫైల్లను స్వయంచాలకంగా జత చేస్తుంది,ఉదా *_1.fastq *._2.fastqతో జత చేయబడింది.
నమూనాల సంఖ్య:సంఖ్యపై ఎలాంటి పరిమితులు లేవునమూనాల సంఖ్య, కానీ విశ్లేషణ సమయం సంఖ్యతో పెరుగుతుందినమూనాలు పెరుగుతాయి.
సిఫార్సు చేయబడిన డేటా మొత్తం:ప్రతి నమూనాకు 6G