నానోపోర్ పూర్తి-నిడివి ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్

నానోపోర్ ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సీక్వెన్సింగ్ అనేది పూర్తి-నిడివి గల సిడిఎన్ఎలను క్రమం చేయడానికి ఒక శక్తివంతమైన పద్ధతి, ట్రాన్స్క్రిప్ట్ ఐసోఫామ్‌లను ఖచ్చితంగా గుర్తించి, లెక్కించడం. BMKCloud నానోపోర్ పూర్తి-నిడివి ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ పైప్‌లైన్ నానోపోర్ ప్లాట్‌ఫామ్‌లో ఉత్పత్తి చేయబడిన RNA-Seq డేటాను అధిక-నాణ్యత బాగా-అనుబంధ రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌కు వ్యతిరేకంగా విశ్లేషించడానికి రూపొందించబడింది, ఇది జన్యువు మరియు ట్రాన్స్క్రిప్ట్ స్థాయి రెండింటిలో గుణాత్మక మరియు పరిమాణాత్మక విశ్లేషణను అందిస్తుంది. నాణ్యత నియంత్రణ తరువాత, పూర్తి-నిడివి-నాన్-చిమెరిక్ (FLNC) సన్నివేశాలు పొందబడతాయి మరియు పునరావృత ట్రాన్స్క్రిప్ట్‌లను తొలగించడానికి ఏకాభిప్రాయ సన్నివేశాలు రిఫరెన్స్ జన్యువుకు మ్యాప్ చేయబడతాయి. ఈ ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సెట్ నుండి, వ్యక్తీకరణ లెక్కించబడుతుంది మరియు భేదాత్మకంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు మరియు ట్రాన్స్క్రిప్ట్స్ గుర్తించబడతాయి మరియు క్రియాత్మకంగా ఉల్లేఖించబడతాయి. పైప్‌లైన్‌లో ప్రత్యామ్నాయ పాలిడెనిలేషన్ (APA) విశ్లేషణ, ప్రత్యామ్నాయ స్ప్లికింగ్ అనాలిసిస్, సింపుల్ సీక్వెన్స్ రిపీట్ (SSR) విశ్లేషణ, LNCRNA యొక్క అంచనా మరియు సంబంధిత లక్ష్యాలు, కోడింగ్ సీక్వెన్సుల అంచనా (CDS), జన్యు కుటుంబ విశ్లేషణ, ట్రాన్స్క్రిప్షన్ కారకాల విశ్లేషణ, నవల జన్యువుల అంచనా ఉన్నాయి మరియు ట్రాన్స్క్రిప్ట్స్ యొక్క క్రియాత్మక ఉల్లేఖనం.