జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ విశ్లేషణ
వర్క్‌ఫ్లో
సేవా ప్రయోజనాలు
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం మరియు ప్రచురణ రికార్డులు: GWASలో సంచిత అనుభవంతో, BMKGene జనాభా GWAS పరిశోధనలో వందలాది జాతుల ప్రాజెక్టులను పూర్తి చేసింది, 100 కంటే ఎక్కువ కథనాలను ప్రచురించడానికి పరిశోధకులకు సహాయం చేసింది మరియు సంచిత ప్రభావ కారకం 500కి చేరుకుంది.
● సమగ్ర బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణ: వర్క్‌ఫ్లో SNP-ట్రైట్ అసోసియేషన్ విశ్లేషణ, అభ్యర్థి జన్యువుల సమితిని మరియు వాటి సంబంధిత ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖనాన్ని అందిస్తుంది.
●అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ బృందం మరియు చిన్న విశ్లేషణ చక్రం: అధునాతన జెనోమిక్స్ విశ్లేషణలో గొప్ప అనుభవంతో, BMKGene బృందం వేగంగా టర్న్‌అరౌండ్ సమయంతో సమగ్ర విశ్లేషణలను అందిస్తుంది.
●అమ్మకాల తర్వాత మద్దతు:మా నిబద్ధత 3-నెలల అమ్మకాల తర్వాత సేవా వ్యవధితో ప్రాజెక్ట్ పూర్తి కాకుండా విస్తరించింది. ఈ సమయంలో, ఫలితాలకు సంబంధించిన ఏవైనా సందేహాలను పరిష్కరించడానికి మేము ప్రాజెక్ట్ ఫాలో-అప్, ట్రబుల్షూటింగ్ సహాయం మరియు Q&A సెషన్‌లను అందిస్తాము.
సర్వీస్ స్పెసిఫికేషన్లు మరియు అవసరాలు
| సీక్వెన్సింగ్ రకం | సిఫార్సు చేయబడిన జనాభా ప్రమాణం | సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం | న్యూక్లియోటైడ్ అవసరాలు |
| మొత్తం జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్ | 200 నమూనాలు | 10x | ఏకాగ్రత: ≥ 1 ng/ µL మొత్తం మొత్తం≥ 30గ్రా పరిమితం లేదా అధోకరణం లేదా కాలుష్యం లేదు |
| నిర్దిష్ట-లోకస్ యాంప్లిఫైడ్ ఫ్రాగ్మెంట్ (SLAF) | ట్యాగ్ లోతు: 10x ట్యాగ్‌ల సంఖ్య: < 400 Mb: WGS సిఫార్సు చేయబడింది < 1Gb: 100K ట్యాగ్‌లు 1Gb > 2Gb: 300K ట్యాగ్‌లు గరిష్టంగా 500k ట్యాగ్‌లు | ఏకాగ్రత ≥ 5 ng/µL మొత్తం మొత్తం ≥ 80 ng నానోడ్రాప్ OD260/280=1.6-2.5 అగరోజ్ జెల్: లేదు లేదా పరిమిత క్షీణత లేదా కాలుష్యం
|
మెటీరియల్ ఎంపిక
వివిధ రకాలు, ఉపజాతులు, ల్యాండ్‌రేస్‌లు/జీన్‌బ్యాంక్‌లు/మిశ్రమ కుటుంబాలు/అడవి వనరులు
వివిధ రకాలు, ఉపజాతులు, ల్యాండ్‌రేస్‌లు
హాఫ్-సిబ్ కుటుంబం/పూర్తి-సిబ్ కుటుంబం/అడవి వనరులు
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
ప్రయోగ రూపకల్పన
నమూనా డెలివరీ
RNA వెలికితీత
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకం తర్వాత సేవలు
కింది విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది:
- జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ విశ్లేషణ: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM మోడల్
- అభ్యర్థి జన్యువుల ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖనం
SNP-లక్షణాల సంఘం విశ్లేషణ - మాన్హాటన్ ప్లాట్
SNP-లక్షణాల సంఘం విశ్లేషణ - QQ ప్లాట్
క్యూరేటెడ్ ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా BMKGene యొక్క డి GWAS సేవల ద్వారా సులభతరం చేయబడిన పురోగతిని అన్వేషించండి:
ఎల్వి, ఎల్. మరియు ఇతరులు. (2023) 'జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీ ద్వారా రేజర్ క్లామ్ సినోనోవాకులా కన్‌స్ట్రిక్టాలో అమ్మోనియా టాలరెన్స్ యొక్క జన్యు ప్రాతిపదికపై అంతర్దృష్టి',ఆక్వాకల్చర్, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
లి, X. మరియు ఇతరులు. (2022) '398 ఫాక్స్‌టైల్ మిల్లెట్ ప్రవేశాల యొక్క బహుళ-ఓమిక్స్ విశ్లేషణలు పెంపకం, మెటాబోలైట్ లక్షణాలు మరియు యాంటీ ఇన్ఫ్లమేటరీ ఎఫెక్ట్‌లతో సంబంధం ఉన్న జన్యు ప్రాంతాలను వెల్లడిస్తాయి',మాలిక్యులర్ ప్లాంట్, 15(8), పేజీలు. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
లి, జె. మరియు ఇతరులు. (2022) 'జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ మ్యాపింగ్ ఆఫ్ హల్‌లెస్ బేర్లీ ఫినోటైప్స్ ఇన్ కరువు వాతావరణం',ప్లాంట్ సైన్స్‌లో సరిహద్దులు, 13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
జావో, X. మరియు ఇతరులు. (2021) 'GmST1, ఇది సల్ఫోట్రాన్స్‌ఫేరేస్‌ను ఎన్కోడ్ చేస్తుంది, సోయాబీన్ మొజాయిక్ వైరస్ జాతులు G2 మరియు G3'లకు నిరోధకతను అందిస్తుంది',మొక్క, సెల్ & పర్యావరణం, 44(8), పేజీలు. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
