తకాగి మరియు ఇతరులు.,ప్లాంట్ జర్నల్, 2013
●సమగ్ర బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణ:జన్యు వైవిధ్యం యొక్క అంచనాను ప్రారంభించడం, ఇది జాతుల పరిణామ సామర్థ్యాన్ని ప్రతిబింబిస్తుంది మరియు కన్వర్జెంట్ పరిణామం మరియు సమాంతర పరిణామం యొక్క తక్కువ ప్రభావంతో జాతుల మధ్య నమ్మకమైన ఫైలోజెనెటిక్ సంబంధాన్ని బహిర్గతం చేస్తుంది
●ఐచ్ఛిక అనుకూలీకరించిన విశ్లేషణ: న్యూక్లియోటైడ్ మరియు అమైనో ఆమ్లాల స్థాయిలో వైవిధ్యాల ఆధారంగా డైవర్జెన్స్ సమయం మరియు వేగం అంచనా వంటివి.
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం మరియు ప్రచురణ రికార్డులు.
Sc నైపుణ్యం కలిగిన బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ బృందం మరియు చిన్న విశ్లేషణ చక్రం: అధునాతన జెనోమిక్స్ విశ్లేషణలో గొప్ప అనుభవంతో, BMKGENE యొక్క బృందం వేగంగా టర్నరౌండ్ సమయంతో సమగ్ర విశ్లేషణలను అందిస్తుంది.
Sales అమ్మకాలకు మద్దతు:మా నిబద్ధత 3 నెలల అమ్మకపు సేవా కాలంతో ప్రాజెక్ట్ పూర్తికు మించి విస్తరించింది. ఈ సమయంలో, ఫలితాలకు సంబంధించిన ఏవైనా ప్రశ్నలను పరిష్కరించడానికి మేము ప్రాజెక్ట్ ఫాలో-అప్, ట్రబుల్షూటింగ్ సహాయం మరియు ప్రశ్నోత్తరాల సెషన్లను అందిస్తున్నాము.
సీక్వెన్సింగ్ రకం | సిఫార్సు చేసిన జనాభా స్కేల్ | సీక్వెన్సింగ్ స్ట్రాటజీ | న్యూక్లియోటైడ్ అవసరాలు |
మొత్తం జన్యు శ్రేణి | ≥ 30 వ్యక్తులు, ప్రతి ఉప సమూహం నుండి ≥ 10 మంది వ్యక్తులతో
| 10x | ఏకాగ్రత: ≥ 1 ng/ µl మొత్తం మొత్తం 30ng పరిమిత లేదా క్షీణత లేదా కాలుష్యం లేదు |
నిర్దిష్ట-లోకస్ యాంప్లిఫైడ్ ఫ్రాగ్మెంట్ (SLAF) | ట్యాగ్ లోతు: 10x ట్యాగ్ల సంఖ్య: <400 MB: WGS సిఫార్సు చేయబడింది <1GB: 100K ట్యాగ్లు 1GB > 2GB: 300K ట్యాగ్లు గరిష్టంగా 500 కె ట్యాగ్లు | ఏకాగ్రత ≥ 5 ng/µl మొత్తం మొత్తం ≥ 80 ng నానోడ్రాప్ OD260/280 = 1.6-2.5 అగరోస్ జెల్: లేదు లేదా పరిమిత క్షీణత లేదా కాలుష్యం
|
సేవలో జనాభా నిర్మాణం (ఫైలోజెనెటిక్ ట్రీ, పిసిఎ, జనాభా స్ట్రాటిఫికేషన్ చార్ట్), జనాభా వైవిధ్యం మరియు జనాభా ఎంపిక (అనుసంధాన అస్వస్థత, ప్రయోజనకరమైన సైట్ల ఎంపిక-ఎంపిక). ఈ సేవలో అనుకూలీకరించిన విశ్లేషణ కూడా ఉంటుంది (ఉదా. డైవర్జెన్స్ సమయం, జన్యు ప్రవాహం).
*ఇక్కడ చూపిన డెమో ఫలితాలు అన్నీ Bmkgene తో ప్రచురించబడిన జన్యువుల నుండి వచ్చాయి
1. పరిణామ విశ్లేషణలో జన్యు వైవిధ్యాల ఆధారంగా ఫైలోజెనెటిక్ చెట్టు, జనాభా నిర్మాణం మరియు పిసిఎ నిర్మాణం ఉంది.
ఫైలోజెనెటిక్ చెట్టు సాధారణ పూర్వీకులతో జాతుల మధ్య వర్గీకరణ మరియు పరిణామ సంబంధాలను సూచిస్తుంది.
PCA ఉప-జనాభా మధ్య సాన్నిహిత్యాన్ని దృశ్యమానం చేయడమే లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది.
జనాభా నిర్మాణం యుగ్మ వికల్ప పౌన .పున్యాల పరంగా జన్యుపరంగా విభిన్నమైన ఉప-జనాభా ఉనికిని చూపుతుంది.
చెన్, మరియు. అల్.,Pnas, 2020
2.సెలెక్టివ్ స్వీప్
సెలెక్టివ్ స్వీప్ అనేది ప్రయోజనకరమైన సైట్ ఎంచుకోబడిన ఒక ప్రక్రియను సూచిస్తుంది మరియు లింక్డ్ న్యూట్రల్ సైట్ల యొక్క పౌన encies పున్యాలు పెరుగుతాయి మరియు లింక్ చేయని సైట్ల యొక్కవి తగ్గుతాయి, ఫలితంగా ప్రాంతీయ తగ్గింపు వస్తుంది.
సెలెక్టివ్ స్వీప్ ప్రాంతాలపై జన్యు-వ్యాప్తంగా గుర్తించడం జనాభా జన్యు సూచిక π π π , fst, తాజిమా యొక్క డి) అన్ని SNP ల యొక్క స్లైడింగ్ విండో (100 kb) లోని అన్ని SNP ల యొక్క కొన్ని దశలలో (10 kb) లెక్కించడం ద్వారా ప్రాసెస్ చేయబడుతుంది.
న్యూక్లియోటైడ్ వైవిధ్యం (π)
తాజిమా యొక్క డి
స్థిరీకరణ
వు, మరియు. అల్.,పరమాణు మొక్క, 2018
3.జీన్ ప్రవాహం
వు, మరియు. అల్.,పరమాణు మొక్క, 2018
4. డెమోగ్రాఫిక్ చరిత్ర
జాంగ్, మరియు. అల్.,ప్రకృతి ఎకాలజీ & ఎవల్యూషన్, 2021
5. డివరెజెన్స్ సమయం
జాంగ్, మరియు. అల్.,ప్రకృతి ఎకాలజీ & ఎవల్యూషన్, 2021
క్యూరేటెడ్ ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా Bmkgene యొక్క పరిణామ జన్యుశాస్త్ర సేవలు సులభతరం చేసిన పురోగతిని అన్వేషించండి:
హసనార్, ఎకె మరియు ఇతరులు. .పరమాణు శాస్త్రం, 24 (7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
చాయ్, జె. మరియు ఇతరులు. (2022) 'ఒక అడవి, జన్యుపరంగా స్వచ్ఛమైన చైనీస్ దిగ్గజం సాలమండర్ కొత్త పరిరక్షణ అవకాశాలను సృష్టిస్తుంది',జూలాజికల్ రీసెర్చ్, 2022, వాల్యూమ్. 43, ఇష్యూ 3, పేజీలు: 469-480, 43 (3), పేజీలు 469-480. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.101.
హాన్, ఎం. మరియు ఇతరులు. .మొక్కల శాస్త్రంలో సరిహద్దులు, 13, పే. 882601. DOI: 10.3389/fpls.2022.882601/bibtex.
వాంగ్, జె. మరియు ఇతరులు. .ఉద్యాన పరిశోధన, 9. doi: 10.1093/hr/uhac021.