ఇల్యూమినా ముందే తయారు చేసిన లైబ్రరీలు
ఫీచర్లు
●వేదికలు:Illumina NovaSeq 6000 మరియు NovaSeq X Plus
●సీక్వెన్సింగ్ మోడ్‌లు:PE150 మరియు PE250
●క్రమం చేయడానికి ముందు లైబ్రరీల నాణ్యత నియంత్రణ
●సీక్వెన్సింగ్ డేటా QC మరియు డెలివరీ:Q30 రీడ్‌లను డీమల్టిప్లెక్సింగ్ మరియు ఫిల్టర్ చేసిన తర్వాత ఫాస్ట్‌క్యూ ఫార్మాట్‌లో QC నివేదిక మరియు ముడి డేటా డెలివరీ
సేవా ప్రయోజనాలు
●సీక్వెన్సింగ్ సేవల బహుముఖ ప్రజ్ఞ:కస్టమర్ లేన్, ఫ్లో సెల్ లేదా అవసరమైన డేటా (పాక్షిక లేన్ సీక్వెన్సింగ్) ద్వారా క్రమం ఎంచుకోవచ్చు.
●ఇల్యూమినా సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లో విస్తృతమైన అనుభవం:వివిధ జాతులతో వేల సంఖ్యలో మూసి ప్రాజెక్టులతో.
●సీక్వెన్సింగ్ QC నివేదిక డెలివరీ:నాణ్యత కొలమానాలు, డేటా ఖచ్చితత్వం మరియు సీక్వెన్సింగ్ ప్రాజెక్ట్ యొక్క మొత్తం పనితీరుతో.
●పరిపక్వ సీక్వెన్సింగ్ ప్రక్రియ:చిన్న మలుపు సమయంతో.
●కఠినమైన నాణ్యత నియంత్రణ: స్థిరమైన అధిక-నాణ్యత ఫలితాల డెలివరీకి హామీ ఇవ్వడానికి మేము కఠినమైన QC అవసరాలను అమలు చేస్తాము.
నమూనా వేదికలు
| వేదిక | ఫ్లో సెల్ | సీక్వెన్సింగ్ మోడ్ | యూనిట్ | అంచనా వేసిన అవుట్‌పుట్ |
| NovaSeq X | 10B (8 లేన్లు) | PE150 | సింగిల్ లేన్ పాక్షిక లేన్ | 375Gb / లేన్ |
| 25B (8 లేన్లు) | PE150 | సింగిల్ లేన్ పాక్షిక లేన్ | 1000 Gb/లేన్ | |
| NovaSeq 6000 | SP ఫ్లో సెల్ (2 లేన్లు) | PE250 | ఫ్లో సెల్ సింగిల్ లేన్ పాక్షిక లేన్ | 325-400 M రీడ్‌లు / లేన్ |
| S4 ఫ్లో సెల్ (4 లేన్లు) | PE150 | ఫ్లో సెల్ సింగిల్ లేన్ పాక్షిక లేన్ | ~800 Gb / లేన్ |
నమూనా అవసరాలు
| డేటా మొత్తం (X) | ఏకాగ్రత (qPCR/nM) | వాల్యూమ్ | |
| పాక్షిక లేన్ సీక్వెన్సింగ్
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| లేన్ సీక్వెన్సింగ్ | ప్రతి లేన్ | ≥ 1.5 nM / లైబ్రరీ పూల్ | ≥ 25 μl / లైబ్రరీ పూల్ |
ఏకాగ్రత మరియు మొత్తం మొత్తంతో పాటు, తగిన పీక్ నమూనా కూడా అవసరం.
గమనిక: తక్కువ వైవిధ్యం గల లైబ్రరీల లేన్ సీక్వెన్సింగ్‌కు బలమైన బేస్ కాలింగ్‌ని నిర్ధారించడానికి PhiX స్పైక్-ఇన్ అవసరం.
ముందుగా పూల్ చేసిన లైబ్రరీలను నమూనాలుగా సమర్పించాలని మేము సిఫార్సు చేస్తున్నాము. లైబ్రరీ పూలింగ్ చేయడానికి మీకు BMKGENE అవసరమైతే, దయచేసి చూడండి
పాక్షిక లేన్ సీక్వెన్సింగ్ కోసం లైబ్రరీ అవసరాలు.
లైబ్రరీ పరిమాణం (పీక్ మ్యాప్)
ప్రధాన శిఖరం 300-450 bp లోపల ఉండాలి.
లైబ్రరీలు ఒకే ప్రధాన శిఖరాన్ని కలిగి ఉండాలి, అడాప్టర్ కాలుష్యం మరియు ప్రైమర్ డైమర్‌లు ఉండకూడదు.
మీ నమూనాలు ప్రారంభ మెటీరియల్ అవసరాలకు అనుగుణంగా లేకుంటే దయచేసి మమ్మల్ని సంప్రదించండి.
సర్వీస్ వర్క్‌ఫ్లో
లైబ్రరీ నాణ్యత నియంత్రణ
సీక్వెన్సింగ్
డేటా నాణ్యత నియంత్రణ
ప్రాజెక్ట్ డెలివరీ
లైబ్రరీ QC నివేదిక
సీక్వెన్సింగ్, లైబ్రరీ మొత్తాన్ని అంచనా వేయడం మరియు ఫ్రాగ్మెంటేషన్ చేసే ముందు లైబ్రరీ నాణ్యతపై నివేదిక అందించబడుతుంది.
సీక్వెన్సింగ్ QC నివేదిక
టేబుల్ 1. సీక్వెన్సింగ్ డేటాపై గణాంకాలు.
| నమూనా ID | BMKID | రా చదువుతాడు | ముడి డేటా (bp) | క్లీన్ రీడ్‌లు (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
మూర్తి 1. ప్రతి నమూనాలో రీడ్‌లతో పాటు నాణ్యత పంపిణీ
మూర్తి 2. బేస్ కంటెంట్ పంపిణీ
మూర్తి 3. సీక్వెన్సింగ్ డేటాలో రీడ్ కంటెంట్‌ల పంపిణీ
