డి నోవో బాక్టీరియల్ జీనోమ్ అసెంబ్లీ
మేము 0 ఖాళీలకు హామీ ఇస్తూ పూర్తి బ్యాక్టీరియా జీనోమ్ అసెంబ్లీ సేవను అందిస్తాము. అసెంబ్లీ ధ్రువీకరణ మరియు ONT రీడ్‌ల దోష సవరణ కోసం అసెంబ్లీ కోసం నానోపోర్ మరియు ప్యాక్‌బయో మరియు ఇల్యూమినాతో షార్ట్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్ వంటి లాంగ్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీలను ఏకీకృతం చేయడం ద్వారా ఇది సాధ్యమవుతుంది. మా సేవ నిర్దిష్ట పరిశోధన లక్ష్యాలను నెరవేర్చడం ద్వారా అసెంబ్లీ, ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖన మరియు అధునాతన బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణ నుండి పూర్తి బయోఇన్ఫర్మేటిక్ వర్క్‌ఫ్లోను అందిస్తుంది. ఈ సేవ వివిధ జన్యు మరియు జన్యు అధ్యయనాల కోసం ఖచ్చితమైన సూచన జన్యువుల అభివృద్ధిని అనుమతిస్తుంది. అదనంగా, ఇది స్ట్రెయిన్ ఆప్టిమైజేషన్, జెనెటిక్ ఇంజినీరింగ్ మరియు మైక్రోబియల్ టెక్నాలజీ డెవలప్‌మెంట్ వంటి అప్లికేషన్‌లకు ఆధారాన్ని ఏర్పరుస్తుంది, శాస్త్రీయ అంతర్దృష్టులు మరియు బయోటెక్నాలజికల్ ఇన్నోవేషన్‌ను అభివృద్ధి చేయడానికి కీలకమైన విశ్వసనీయ మరియు గ్యాప్-ఫ్రీ జెనోమిక్ డేటాను నిర్ధారిస్తుంది.
సర్వీస్ ఫీచర్లు
● జీనోమ్ సంపూర్ణత యొక్క కావలసిన డిగ్రీని బట్టి ఎంచుకోవడానికి రెండు సాధ్యమైన ఎంపికలతో.
● డ్రాఫ్ట్ జీనోమ్ ఎంపిక: Illumina NovaSeq PE150తో షార్ట్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్.
● పూర్తి 0 గ్యాప్ జీనోమ్.
● జీనోమ్ అసెంబ్లీ కోసం Nanopore PromethION 48 లేదా PacBio Revioలో ఎక్కువసేపు చదివే సీక్వెన్సింగ్.
● జీనోమ్ ధ్రువీకరణ మరియు ఎర్రర్ కరెక్షన్ (నానోపోర్) లేదా డ్రాఫ్ట్ జీనోమ్‌ను రూపొందించడం కోసం Illumina NovaSeqలో షార్ట్-రీడ్ సీక్వెన్సింగ్.
సేవా ప్రయోజనాలు
●జీరో-గ్యాప్ జీనోమ్ హామీ: లాంగ్ రీడ్ సీక్వెన్సింగ్ (నానోపోర్ లేదా ప్యాక్‌బయో)తో ఇల్యూమినా సీక్వెన్సింగ్‌ని ఏకీకృతం చేయడం దీనికి కారణం.
●పూర్తి బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ వర్క్‌ఫ్లో:ఇందులో జీనోమ్ అసెంబ్లీ మరియు మల్టిపుల్ జెనోమిక్ ఎలిమెంట్స్ ప్రిడిక్షన్, ఫంక్షనల్ జీన్ ఉల్లేఖన మరియు సిర్కోస్ ప్లాట్ వంటి జన్యు విజువలైజేషన్‌లు ఉన్నాయి.
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం: 20,000కు పైగా సూక్ష్మజీవుల జన్యువులను సమీకరించడంతో, BMKGENE ఒక దశాబ్దానికి పైగా అనుభవం, అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన విశ్లేషణ బృందం, సమగ్ర కంటెంట్ మరియు అద్భుతమైన పోస్ట్-సేల్స్ మద్దతును అందిస్తుంది.
●అమ్మకాల తర్వాత మద్దతు:మా నిబద్ధత 3-నెలల అమ్మకాల తర్వాత సేవా వ్యవధితో ప్రాజెక్ట్ పూర్తి కాకుండా విస్తరించింది. ఈ సమయంలో, ఫలితాలకు సంబంధించిన ఏవైనా సందేహాలను పరిష్కరించడానికి మేము ప్రాజెక్ట్ ఫాలో-అప్, ట్రబుల్షూటింగ్ సహాయం మరియు Q&A సెషన్‌లను అందిస్తాము.
●బహుళ సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహాలు అందుబాటులో ఉన్నాయి:విభిన్న పరిశోధన లక్ష్యాలు మరియు జన్యు పరిపూర్ణత అవసరాల కోసం.
సర్వీస్ స్పెసిఫికేషన్స్
| సేవ | సీక్వెన్సింగ్ స్ట్రాటజీ |
| డ్రాఫ్ట్ జీనోమ్ | ఇల్యూమినా PE150 100x |
| 0 గ్యాప్ జీనోమ్ | నానోపోర్ 100x + ఇల్యూమినా PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (ఐచ్ఛికం) |
నమూనా అవసరాలు:
| ఏకాగ్రత (ng/µL) | మొత్తం మొత్తం (µg) | వాల్యూమ్ (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| ప్యాక్‌బయో | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| నానోపోర్ | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| ఇల్యూమినా | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
బాక్టీరియా: ≥3.5x1010 కణాలు
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
నమూనా డెలివరీ
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకం తర్వాత సేవలు
కింది విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది:
● సీక్వెన్సింగ్ డేటా నాణ్యత నియంత్రణ
● జీనోమ్ అసెంబ్లీ
● జీనోమ్ కాంపోనెంట్ విశ్లేషణ: CDS మరియు బహుళ జన్యు మూలకాల అంచనా
● బహుళ సాధారణ డేటాబేస్‌లు (GO, KEGG, మొదలైనవి) మరియు అధునాతన డేటాబేస్‌లతో (CARD, VFDB, మొదలైనవి) ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖన
● జీనోమ్ విజువలైజేషన్
మేము జీనోమ్‌ను సులభంగా యాక్సెస్ చేయగల ఫాస్టా ఫార్మాట్‌లో మరియు జీనోమ్ ఉల్లేఖన ఫైల్ (gff)లో అందిస్తాము.
జన్యు ఉల్లేఖనం - GO
జన్యు ఉల్లేఖనం - CAZY కార్బోహైడ్రేట్లు
జీనోమ్ విజువలైజేషన్ - సర్కోస్ ప్లాట్
BMKGene యొక్క బ్యాక్టీరియల్ జీనోమ్ అసెంబ్లీ సేవల ద్వారా అందించబడిన పురోగతిని క్యూరేటెడ్ ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా అన్వేషించండి.
డై, W. మరియు ఇతరులు. (2023) 'ఆరోగ్యకరమైన హ్యూమన్ కోలన్ నుండి వ్రణోత్పత్తి పెద్దప్రేగు శోథ చికిత్స కోసం సురక్షితమైన మరియు నవల ప్రోబయోటిక్ బాక్టీరియం వలె బాక్టీరాయిడ్స్ యూనిఫార్మిస్ F18-22 యొక్క ఆవిష్కరణ',ఇంటర్నేషనల్ జర్నల్ ఆఫ్ మాలిక్యులర్ సైన్సెస్, 24(19), p. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
కాంగ్, Q. మరియు ఇతరులు. (2021) 'చైనాలోని వన్యప్రాణుల నుండి blaOXA-1 మరియు blaNDM-1 మోసుకెళ్ళే మల్టీడ్రగ్-రెసిస్టెంట్ ప్రోటీయస్ మిరాబిలిస్ ఐసోలేట్స్: పెరుగుతున్న ప్రజారోగ్య ప్రమాదం',ఇంటిగ్రేటివ్ జువాలజీ, 16(6), పేజీలు. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
వాంగ్, TT మరియు ఇతరులు. (2017) 'ఎండోఫైట్ బాసిల్లస్ ఫ్లెక్సస్ KLBMP 4941 యొక్క పూర్తి జీనోమ్ సీక్వెన్స్ దాని మొక్కల పెరుగుదల ప్రమోషన్ మెకానిజం మరియు ఉప్పు సహనానికి జన్యుపరమైన ఆధారాన్ని వెల్లడిస్తుంది',జర్నల్ ఆఫ్ బయోటెక్నాలజీ, 260, పేజీలు. 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
వాంగ్, X. మరియు ఇతరులు. (2021) 'క్లెబ్సియెల్లా యొక్క మల్టిపుల్-రెప్లికాన్ రెసిస్టెన్స్ ప్లాస్మిడ్‌లు యాంటీమైక్రోబయల్ జన్యువుల విస్తృత వ్యాప్తిని మధ్యవర్తిత్వం చేస్తాయి',మైక్రోబయాలజీలో సరిహద్దులు, 12, p. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
