యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్(16S/18S/ITS)

ఇల్యూమినాతో యాంప్లికాన్ (16S/18S/ITS) సీక్వెన్సింగ్ అనేది సూక్ష్మజీవుల వైవిధ్యాన్ని విశ్లేషించే పద్ధతి, ఇది సూక్ష్మజీవుల ప్రొఫైల్‌లను వాటి క్రమాల ప్రకారం గుర్తించి, ఆపై ప్రతి నమూనాలో మరియు నమూనాల మధ్య కమ్యూనిటీ రిచ్‌నెస్ మరియు వైవిధ్యాన్ని అర్థంచేసుకోవడానికి ప్రయత్నిస్తుంది. BMKCloud యాంప్లికాన్ (NGS) పైప్‌లైన్ 16S, 18S, ITS మరియు బహుళ ఫంక్షనల్ జన్యువుల విశ్లేషణను అనుమతిస్తుంది. ఇది రీడ్ ట్రిమ్మింగ్, పెయిర్డ్-ఎండ్ రీడ్ అసెంబ్లీ మరియు క్వాలిటీ అసెస్‌మెంట్‌తో మొదలవుతుంది, ఆ తర్వాత ఆరు వేర్వేరు విశ్లేషణ విభాగాలలో ఉపయోగించే ఆపరేషనల్ టాక్సోనామిక్ యూనిట్‌లను (OTUలు) రూపొందించడానికి ఒకే విధమైన రీడ్‌ల క్లస్టరింగ్ ఉంటుంది. వర్గీకరణ ఉల్లేఖనం ప్రతి నమూనా యొక్క సాపేక్ష సమృద్ధి మరియు కూర్పుపై సమాచారాన్ని అందిస్తుంది, అయితే ఆల్ఫా మరియు బీటా వైవిధ్య విశ్లేషణలు వరుసగా నమూనాల లోపల మరియు మధ్య సూక్ష్మజీవుల వైవిధ్యంపై దృష్టి పెడతాయి. సమూహాల మధ్య అవకలన విశ్లేషణ పారామెట్రిక్ మరియు నాన్-పారామెట్రిక్ పరీక్షలను ఉపయోగించి విభిన్నమైన OTUలను కనుగొంటుంది, అయితే సహసంబంధ విశ్లేషణ పర్యావరణ కారకాలతో ఈ తేడాలను సూచిస్తుంది. చివరగా, క్రియాత్మక జన్యు సమృద్ధి మార్కర్ జన్యు సమృద్ధి ఆధారంగా అంచనా వేయబడుతుంది, ప్రతి నమూనాలో పనితీరు మరియు జీవావరణ శాస్త్రంపై అంతర్దృష్టిని అందిస్తుంది.