10x జెనోమిక్స్ విజియం ప్రాదేశిక ట్రాన్స్క్రిప్ట్
సాంకేతిక పథకం
లక్షణాలు
● తీర్మానం: 100 µm
స్పాట్ వ్యాసం: 55 µm
Spets మచ్చల సంఖ్య: 4992
● క్యాప్చర్ ఏరియా: 6.5 x 6.5 మిమీ
Bar ప్రతి బార్‌కోడ్ స్పాట్ 4 విభాగాలతో కూడిన ప్రైమర్‌లతో లోడ్ అవుతుంది:
- mRNA ప్రైమింగ్ మరియు సిడిఎన్ఎ సంశ్లేషణ కోసం పాలీ (డిటి) తోక
- విస్తరణ పక్షపాతాన్ని సరిచేయడానికి ప్రత్యేకమైన మాలిక్యులర్ ఐడెంటిఫైయర్ (UMI)
- ప్రాదేశిక బార్‌కోడ్
- పాక్షిక రీడ్ 1 సీక్వెన్సింగ్ ప్రైమర్ యొక్క బైండింగ్ క్రమం
● H & E విభాగాల మరక
ప్రయోజనాలు
●వన్-స్టాప్ సేవ: క్రియో-సెక్షన్, స్టెయినింగ్, టిష్యూ ఆప్టిమైజేషన్, ప్రాదేశిక బార్‌కోడింగ్, లైబ్రరీ తయారీ, సీక్వెన్సింగ్ మరియు బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్‌తో సహా అన్ని అనుభవం మరియు నైపుణ్యం-ఆధారిత దశలను అనుసంధానిస్తుంది.
● అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన సాంకేతిక బృందం: 250 కి పైగా కణజాల రకాలు మరియు మానవ, మౌస్, క్షీరదం, చేపలు మరియు మొక్కలతో సహా 100+ జాతులలో అనుభవంతో.
●మొత్తం ప్రాజెక్ట్‌లో రియల్ టైమ్ నవీకరణ: ప్రయోగాత్మక పురోగతిపై పూర్తి నియంత్రణతో.
●సమగ్ర ప్రామాణిక బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్:ప్యాకేజీలో 29 విశ్లేషణలు మరియు 100+ అధిక-నాణ్యత గణాంకాలు ఉన్నాయి.
●అనుకూలీకరించిన డేటా విశ్లేషణ మరియు విజువలైజేషన్: విభిన్న పరిశోధన అభ్యర్థనలకు అందుబాటులో ఉంది.
●సింగిల్-సెల్ mRNA సీక్వెన్సింగ్‌తో ఐచ్ఛిక ఉమ్మడి విశ్లేషణ
లక్షణాలు
| నమూనా అవసరాలు | లైబ్రరీ | సీక్వెన్సింగ్ స్ట్రాటజీ | డేటా సిఫార్సు చేయబడింది | నాణ్యత నియంత్రణ |
| అక్టోబర్-ఎంబెడెడ్ క్రియో నమూనాలు (సరైన వ్యాసం: సుమారు. 6x6x6 mm³) ప్రతి నమూనాకు 2 బ్లాక్స్ | 10x విజియం సిడిఎన్ఎ లైబ్రరీ | ఇల్యూమినా PE150 | 50 కె పె స్పాట్‌కు చదువుతుంది (60GB) | Rin> 7 |
నమూనా తయారీ మార్గదర్శకత్వం మరియు సేవా వర్క్‌ఫ్లోపై మరిన్ని వివరాల కోసం, దయచేసి సంకోచించకండి aBmkgene నిపుణుడు
సేవా వర్క్‌ఫ్లో
నమూనా తయారీ దశలో, అధిక-నాణ్యత RNA ను పొందవచ్చని నిర్ధారించడానికి ప్రారంభ బల్క్ RNA వెలికితీత ట్రయల్ నిర్వహిస్తారు. కణజాల ఆప్టిమైజేషన్ దశలో విభాగాలు తడిసినవి మరియు దృశ్యమానం చేయబడతాయి మరియు కణజాలం నుండి mRNA విడుదల కోసం పారగమ్యత పరిస్థితులు ఆప్టిమైజ్ చేయబడతాయి. ఆప్టిమైజ్ చేసిన ప్రోటోకాల్ అప్పుడు లైబ్రరీ నిర్మాణ సమయంలో వర్తించబడుతుంది, తరువాత సీక్వెన్సింగ్ మరియు డేటా విశ్లేషణ.
పూర్తి సేవా వర్క్‌ఫ్లో రియల్ టైమ్ నవీకరణలు మరియు క్లయింట్ నిర్ధారణలను కలిగి ఉంటుంది, ప్రతిస్పందించే ఫీడ్‌బ్యాక్ లూప్‌ను నిర్వహించడానికి, సున్నితమైన ప్రాజెక్ట్ అమలును నిర్ధారిస్తుంది.
కింది విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది:
డేటా నాణ్యత నియంత్రణ:
డేటా అవుట్పుట్ మరియు నాణ్యత స్కోరు పంపిణీ
ప్రతి ప్రదేశానికి జన్యు గుర్తింపు
కణజాల కవరేజ్
అంతర్గత-నమూనా విశ్లేషణ:
ఓ జన్యు గొప్పతనం
తగ్గిన పరిమాణం విశ్లేషణతో సహా స్పాట్ క్లస్టరింగ్
సమూహాల మధ్య అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ: మార్కర్ జన్యువుల గుర్తింపు
ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖనం మరియు మార్కర్ జన్యువుల సుసంపన్నం
ఇంటర్-గ్రూప్ విశ్లేషణ
రెండు నమూనాల నుండి మచ్చల తిరిగి కలపడం (ఉదా. వ్యాధి మరియు నియంత్రణ) మరియు రీ-క్లస్టర్
ప్రతి క్లస్టర్ కోసం మార్కర్ జన్యువుల గుర్తింపు
ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖనం మరియు మార్కర్ జన్యువుల సుసంపన్నం
సమూహాల మధ్య ఒకే క్లస్టర్ యొక్క అవకలన వ్యక్తీకరణ
అంతర్గత-నమూనా విశ్లేషణ
స్పాట్ క్లస్టరింగ్
మార్కర్ జన్యువుల గుర్తింపు మరియు ప్రాదేశిక పంపిణీ
ఇంటర్-గ్రూప్ విశ్లేషణ
రెండు సమూహాల నుండి డేటా కలయిక మరియు రీ-క్లస్టర్
కొత్త సమూహాల మార్కర్ జన్యువులు
ఈ ఫీచర్ చేసిన ప్రచురణలలో BMKGENE యొక్క ప్రాదేశిక ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్స్ సేవ 10x విజియం ద్వారా సులభతరం చేసిన పురోగతిని అన్వేషించండి:
చెన్, డి. మరియు ఇతరులు. .ప్రొసీడింగ్స్ ఆఫ్ ది నేషనల్ అకాడమీ ఆఫ్ సైన్సెస్ ఆఫ్ ది యునైటెడ్ స్టేట్స్ ఆఫ్ అమెరికా, 120 (30), పే. E2303462120. doi: /10.1073/pnas.2303462120
చెన్, వై. మరియు ఇతరులు. .బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్లో బ్రీఫింగ్స్, 24 (2), పేజీలు 1-10. doi: 10.1093/bib/bbad068.
లియు, సి. మరియు ఇతరులు. .న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాల పరిశోధన, 50 (17), పేజీలు 9724-9737. doi: 10.1093/nar/gkac773.
వాంగ్, జె. మరియు ఇతరులు. .జీవశాస్త్రం, 19 (8), పేజీలు 2515-2530. doi: 10.7150/ijbs.83510.
