Exclusive Agency for Korea

தயாரிப்புகள்

ஒற்றை கருக்கள் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை

ஒற்றை-செல் பிடிப்பு மற்றும் தனிப்பயன் நூலக கட்டுமான நுட்பங்களின் வளர்ச்சி, உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறையுடன் இணைந்து, செல் அளவில் மரபணு வெளிப்பாடு ஆய்வுகளில் புரட்சியை ஏற்படுத்தியுள்ளது. இந்த முன்னேற்றமானது சிக்கலான செல் மக்கள்தொகையின் ஆழமான மற்றும் விரிவான பகுப்பாய்வை அனுமதிக்கிறது, அனைத்து உயிரணுக்களின் சராசரி மரபணு வெளிப்பாட்டுடன் தொடர்புடைய வரம்புகளை மீறுகிறது மற்றும் இந்த மக்கள்தொகைக்குள் உண்மையான பன்முகத்தன்மையைப் பாதுகாக்கிறது. ஒற்றை செல் RNA வரிசைமுறை (scRNA-seq) மறுக்க முடியாத நன்மைகளைக் கொண்டிருந்தாலும், சில திசுக்களில் சவால்களை எதிர்கொள்கிறது, அங்கு ஒற்றை செல் இடைநீக்கத்தை உருவாக்குவது கடினம் மற்றும் புதிய மாதிரிகள் தேவைப்படுகின்றன. BMKGene இல், அதிநவீன 10X ஜெனோமிக்ஸ் குரோமியம் தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி ஒற்றை-நியூக்ளியஸ் RNA வரிசைமுறையை (snRNA-seq) வழங்குவதன் மூலம் இந்தத் தடையை நாங்கள் நிவர்த்தி செய்கிறோம். இந்த அணுகுமுறை ஒற்றை செல் அளவில் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்விற்கு ஏற்ற மாதிரிகளின் நிறமாலையை விரிவுபடுத்துகிறது.

புதுமையான 10X ஜெனோமிக்ஸ் குரோமியம் சிப் மூலம் கருக்களின் தனிமைப்படுத்தல் நிறைவேற்றப்படுகிறது, இதில் இரட்டை குறுக்குவெட்டுகளுடன் எட்டு சேனல் மைக்ரோஃப்ளூய்டிக்ஸ் அமைப்பு உள்ளது. இந்த அமைப்பிற்குள், பார்கோடுகள், ப்ரைமர்கள், என்சைம்கள் மற்றும் ஒரு ஒற்றை உட்கருவை உள்ளடக்கிய ஜெல் மணிகள் நானோலிட்டர் அளவிலான எண்ணெய் துளிகளில் இணைக்கப்பட்டு, ஜெல் பீட்-இன்-எமல்ஷன் (ஜிஇஎம்) உருவாகிறது. GEM உருவானதைத் தொடர்ந்து, ஒவ்வொரு GEM லும் செல் சிதைவு மற்றும் பார்கோடு வெளியீடு நிகழ்கிறது. பின்னர், mRNA மூலக்கூறுகள் 10X பார்கோடுகள் மற்றும் தனித்த மூலக்கூறு அடையாளங்காட்டிகள் (UMIs) ஆகியவற்றை உள்ளடக்கிய சிடிஎன்ஏக்களில் தலைகீழ் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கு உட்படுகின்றன. இந்த சிடிஎன்ஏக்கள் நிலையான வரிசைமுறை நூலகக் கட்டுமானத்திற்கு உட்படுத்தப்படுகின்றன, இது ஒற்றை செல் அளவில் மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரங்களின் வலுவான மற்றும் விரிவான ஆய்வுக்கு உதவுகிறது.

இயங்குதளம்: 10× ஜீனோமிக்ஸ் குரோமியம் மற்றும் இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம்

எங்களை தொடர்பு கொள்ளவும்

சேவை விவரங்கள்

உயிர் தகவலியல்

டெமோ முடிவுகள்

சிறப்பு வெளியீடுகள்

தொழில்நுட்ப திட்டம்

கருக்களின் தனிமைப்படுத்தல் 10× ஜீனோமிக்ஸ் குரோமியம்™ மூலம் அடையப்படுகிறது, இது இரட்டைக் குறுக்குடன் எட்டு-சேனல் மைக்ரோஃப்ளூய்டிக்ஸ் அமைப்பைக் கொண்டுள்ளது. இந்த அமைப்பில், பார்கோடுகளுடன் கூடிய ஜெல் மணிகள் மற்றும் ப்ரைமர், என்சைம்கள் மற்றும் ஒரு நியூக்ளியஸ் ஆகியவை நானோலிட்டர் அளவிலான எண்ணெய் துளியில் இணைக்கப்பட்டு, ஜெல் பீட்-இன்-எமல்ஷனை (ஜிஇஎம்) உருவாக்குகிறது. GEM உருவாக்கப்பட்டவுடன், செல் சிதைவு மற்றும் பார்கோடுகளின் வெளியீடு ஒவ்வொரு GEM லும் செய்யப்படுகிறது. mRNA ஆனது 10× பார்கோடுகள் மற்றும் UMI உடன் சிடிஎன்ஏ மூலக்கூறுகளாக மாற்றியமைக்கப்படுகிறது, இவை மேலும் நிலையான வரிசைமுறை நூலக கட்டுமானத்திற்கு உட்பட்டவை.

அம்சங்கள்

● உறைந்த திசுக்களில் இருந்து ஒற்றை-கரு இடைநீக்கம் தயாரித்தல்

● சிடிஎன்ஏ தொகுப்பைத் தொடர்ந்து ஜெல் பீட்-இன்-எமல்ஷன் (ஜிஇஎம்) உருவாக்கம்

● GEM இல் உள்ள ஒவ்வொரு மணிகளும் 4 பிரிவுகளைக் கொண்ட ப்ரைமர்களால் ஏற்றப்படுகின்றன:

mRNA ப்ரைமிங் மற்றும் cDNA தொகுப்புக்கான பாலி(dT) வால்,

பெருக்க சார்புகளை சரிசெய்ய தனித்த மூலக்கூறு அடையாளங்காட்டி (UMI).

10x பார்கோடு

பகுதி வாசிப்பு 1 சீக்வென்சிங் ப்ரைமரின் பிணைப்பு வரிசை

நன்மைகள்

ஒற்றை-கரு ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை ஒற்றை செல் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையின் வரம்புகளைத் தவிர்க்கிறது, செயல்படுத்துகிறது:

● உறைந்த மாதிரிகளின் பயன்பாடு மற்றும் புதிய மாதிரிகள் மட்டும் அல்ல

● புதிய உயிரணுக்களின் நொதி சிகிச்சையுடன் ஒப்பிடும்போது உறைந்த செல்களின் குறைந்த அழுத்தம், குறைந்த அழுத்தத்தால் தூண்டப்பட்ட மரபணுக்களின் வடிவத்தில் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தரவுகளில் பிரதிபலிக்கிறது

● இரத்த சிவப்பணுக்களை முன்கூட்டியே அகற்ற வேண்டிய அவசியமில்லை

● வரம்பற்ற செல் விட்டம்

● பகுப்பாய்விற்குத் தகுதியான மாதிரிகளின் பெரிய வரிசை, சிக்கலான மற்றும் உடையக்கூடிய திசு வகைகள் உட்பட, திசுப் பிரிவின் போது செல் கட்டி அல்லது அழிவுக்கு ஆளாகும்.

ஒற்றை செல் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை மூலம் பகுப்பாய்வு செய்ய முடியாத மாதிரிகள் மற்றும் ஒற்றை அணுக்கருக்கள் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறைக்கு தகுதியானவை:

செல் / திசு	காரணம்
அன்ஃப்ரெஷ் உறைந்த திசு	புதிய அல்லது நீண்டகாலமாக சேமிக்கப்பட்ட நிறுவனங்களைப் பெற முடியவில்லை
தசை செல், மெகாகாரியோசைட், கொழுப்பு...	கருவிக்குள் நுழைய முடியாத அளவுக்கு செல் விட்டம் அதிகமாக உள்ளது
கல்லீரல்…	உடைக்க முடியாத அளவுக்கு உடையக்கூடியது, ஒற்றை செல்களை வேறுபடுத்த முடியவில்லை
நியூரான் செல், மூளை...	அதிக உணர்திறன், மன அழுத்தத்திற்கு எளிதானது, வரிசைமுறை முடிவுகளை மாற்றும்
கணையம், தைராய்டு…	எண்டோஜெனஸ் என்சைம்கள் நிறைந்தது, ஒற்றை செல் இடைநீக்கத்தின் உற்பத்தியை பாதிக்கிறது

ஒற்றை-கரு vs ஒற்றை-செல்

ஒற்றை-கரு	ஒற்றை செல்
வரம்பற்ற செல் விட்டம்	செல் விட்டம்: 10-40 μm
பொருள் உறைந்த திசு இருக்க முடியும்	பொருள் புதிய திசுவாக இருக்க வேண்டும்
உறைந்த செல்கள் குறைந்த அழுத்தம்	என்சைம் சிகிச்சையானது செல் அழுத்த எதிர்வினையை ஏற்படுத்தலாம்
இரத்த சிவப்பணுக்கள் அகற்றப்பட வேண்டியதில்லை	இரத்த சிவப்பணுக்கள் அகற்றப்பட வேண்டும்
அணுவானது உயிர்த் தகவலை வெளிப்படுத்துகிறது	முழு செல் உயிர்த் தகவலை வெளிப்படுத்துகிறது

விவரக்குறிப்புகள்

மாதிரி தேவைகள்

நூலகம்

வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி

தரவு பரிந்துரைக்கப்படுகிறது

தரக் கட்டுப்பாடு

விலங்கு திசு ≥ 200 மி.கி

தாவர திசு ≥ 400 மி.கி

10x ஜெனோமிக்ஸ் sn cDNA நூலகம்

இல்லுமினா PE150

ஒரு கலத்திற்கு 100K PE படிக்கிறது

(100-200 ஜிபி)

700-1200 கருக்கள்/μl மற்றும் கருக்களின் ஒருமைப்பாடு நுண்ணோக்கியின் கீழ் காணப்பட்டது

மாதிரி தயாரிப்பு வழிகாட்டுதல் மற்றும் சேவை பணிப்பாய்வு பற்றிய கூடுதல் விவரங்களுக்கு, தயவு செய்து தயங்காமல் பேசவும்BMKGENE நிபுணர்

சேவை வேலை ஓட்டம்

முந்தைய: தாவர/விலங்கு முழு ஜீனோம் வரிசைமுறை

அடுத்து: ஜீனோம்-வைட் அசோசியேஷன் பகுப்பாய்வு

பின்வரும் பகுப்பாய்வு அடங்கும்:

● தரக் கட்டுப்பாடு: உயிரணுக்களின் எண்ணிக்கை, மரபணு கண்டறிதல், உயிரணுக்களின் துல்லியமான அடையாளம், RNA மூலக்கூறுகள் மற்றும் வெளிப்பாடு அளவீடு

● உள் மாதிரி பகுப்பாய்வு:

செல் கிளஸ்டரிங் மற்றும் கிளஸ்டர் சிறுகுறிப்பு

வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு: கொத்துகளில் DEG களை அடையாளம் காணுதல்

கிளஸ்டர் DEG களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல்

● குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு:

தரவுகளின் சேர்க்கை

வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு: குழுக்களில் DEG களை அடையாளம் காணுதல்

குழு DEG களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல்

● மேம்பட்ட பகுப்பாய்வு:

செல் சுழற்சி பகுப்பாய்வு

போலி நேர பகுப்பாய்வு

செல் தொடர்பு பகுப்பாய்வு (CellPhoneDB)

ஜீன் செட் செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு (GSEA)

உள்-மாதிரி பகுப்பாய்வு

செல் கிளஸ்டரிங்:

வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு: கிளஸ்டர் DEGகள்

குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு

வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு: குழு DEGகள்

மேம்பட்ட பகுப்பாய்வு:

போலி நேர பகுப்பாய்வு:

செல் சுழற்சி பகுப்பாய்வு:

இந்த பிரத்யேக வெளியீடுகளில் 10X குரோமியம் மூலம் BMKGene இன் ஒற்றை-நியூக்ளியஸ் RNA வரிசைமுறை சேவைகள் மூலம் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை ஆராயுங்கள்:

வாங், எல். மற்றும் பலர். (2021) 'ஒற்றை-செல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் பகுப்பாய்வு, ஸ்டீராய்டு-எதிர்ப்பு ஆஸ்துமா அதிகரிப்பில் நுரையீரலின் நோயெதிர்ப்பு நிலப்பரப்பை வெளிப்படுத்துகிறது',அமெரிக்காவின் தேசிய அறிவியல் அகாடமியின் செயல்முறைகள், 118(2), ப. e2005590118. doi: 10.1073/pnas.2005590118

ஜெங், எச். மற்றும் பலர். (2022) 'கிரேவ்ஸ்' நோய் மற்றும் ஹாஷிமோட்டோவின் தைராய்டிடிஸ் ஆகியவற்றின் நுண்ணிய சூழலில் நோயெதிர்ப்பு உயிரணுக்களில் ஒழுங்கற்ற மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் அசாதாரண வளர்சிதை மாற்ற சமிக்ஞைகளுக்கான உலகளாவிய ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்',இம்யூனாலஜியின் எல்லைகள், 13, பக். 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.

தியான், எச். மற்றும் பலர். (2023) 'சிங்கிள்-செல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் ஃப்ளவுண்டரில் (பாராலிச்திஸ் ஒலிவாசியஸ்) செயலிழக்கச் செய்யப்பட்ட எட்வர்சில்லா டார்டாவுடன் தடுப்பூசி போட்ட பிறகு லுகோசைட்டுகளின் பன்முகத்தன்மை மற்றும் நோயெதிர்ப்பு மறுமொழிகளை வெளிப்படுத்துகிறது',மீன் வளர்ப்பு, 566, பக். 739238. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739238.

யூ, ஒய் மற்றும் பலர். (2023) 'ஃபோட்டோடைனமிக் தெரபி இரைப்பை புற்றுநோயால் பாதிக்கப்பட்ட நோயாளிகளுக்கு கட்டி எதிர்ப்பு சக்தியை மறுவடிவமைப்பதன் மூலம் நோயெதிர்ப்பு சோதனைச் சாவடி தடுப்பான்களின் விளைவை மேம்படுத்துகிறது',இரைப்பை புற்றுநோய், 26(5), பக். 798–813. doi: 10.1007/S10120-023-01409-X/METRICS.