-
BMKMANU S3000_Spatial Transscriptome
ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் அறிவியல் கண்டுபிடிப்புகளில் முன்னணியில் நிற்கிறது, அவற்றின் இடஞ்சார்ந்த சூழலைப் பாதுகாக்கும் போது திசுக்களுக்குள் உள்ள சிக்கலான மரபணு வெளிப்பாடு வடிவங்களை ஆராய ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு அதிகாரம் அளிக்கிறது. பல்வேறு தளங்களுக்கு மத்தியில், BMKGene ஆனது BMKManu S3000 ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சிப்பை உருவாக்கியுள்ளது, இது 3.5µm இன் மேம்படுத்தப்பட்ட தெளிவுத்திறனைப் பெருமைப்படுத்துகிறது, துணை செல்லுலார் வரம்பை அடைந்தது மற்றும் பல-நிலை தெளிவுத்திறன் அமைப்புகளை செயல்படுத்துகிறது. S3000 சிப், ஏறக்குறைய 4 மில்லியன் புள்ளிகளைக் கொண்டுள்ளது. ஸ்பேஷியல் பார்கோடுகளால் செறிவூட்டப்பட்ட ஒரு cDNA நூலகம், S3000 சிப்பில் இருந்து தயாரிக்கப்பட்டு, பின்னர் Illumina NovaSeq இயங்குதளத்தில் வரிசைப்படுத்தப்படுகிறது. இடஞ்சார்ந்த பார்கோடு செய்யப்பட்ட மாதிரிகள் மற்றும் UMIகளின் கலவையானது உருவாக்கப்பட்ட தரவின் துல்லியம் மற்றும் தனித்துவத்தை உறுதி செய்கிறது. BMKManu S3000 சில்லுகள் மிகவும் பல்துறை திறன் கொண்டவை, பல்வேறு திசுக்கள் மற்றும் தேவையான அளவு விவரங்களுக்கு நேர்த்தியாக டியூன் செய்யக்கூடிய பல-நிலை தெளிவுத்திறன் அமைப்புகளை வழங்குகிறது. இந்த ஏற்புத்திறன் சிப்பை பல்வேறு இடவியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் ஆய்வுகளுக்கு ஒரு சிறந்த தேர்வாக நிலைநிறுத்துகிறது, குறைந்த சத்தத்துடன் துல்லியமான இடஞ்சார்ந்த கிளஸ்டரிங்கை உறுதி செய்கிறது. BMKManu S3000 உடன் செல் பிரிவு தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்துவது, உயிரணுக்களின் எல்லைகளுக்கு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் தரவை வரையறுக்க உதவுகிறது, இதன் விளைவாக நேரடி உயிரியல் பொருள் உள்ளது. மேலும், S3000 இன் மேம்படுத்தப்பட்ட தெளிவுத்திறன் ஒரு கலத்திற்கு அதிக எண்ணிக்கையிலான மரபணுக்கள் மற்றும் UMIகள் கண்டறியப்படுவதற்கு வழிவகுக்கிறது, இது ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் முறைகள் மற்றும் கலங்களின் கிளஸ்டரிங் பற்றிய மிகவும் துல்லியமான பகுப்பாய்வை செயல்படுத்துகிறது.
-
ஒற்றை கருக்கள் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை
ஒற்றை-செல் பிடிப்பு மற்றும் தனிப்பயன் நூலக கட்டுமான நுட்பங்களின் வளர்ச்சி, உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறையுடன் இணைந்து, செல் அளவில் மரபணு வெளிப்பாடு ஆய்வுகளில் புரட்சியை ஏற்படுத்தியுள்ளது. இந்த முன்னேற்றமானது சிக்கலான செல் மக்கள்தொகையின் ஆழமான மற்றும் விரிவான பகுப்பாய்வை அனுமதிக்கிறது, அனைத்து உயிரணுக்களின் சராசரி மரபணு வெளிப்பாட்டுடன் தொடர்புடைய வரம்புகளை மீறுகிறது மற்றும் இந்த மக்கள்தொகைக்குள் உண்மையான பன்முகத்தன்மையைப் பாதுகாக்கிறது. ஒற்றை செல் RNA வரிசைமுறை (scRNA-seq) மறுக்க முடியாத நன்மைகளைக் கொண்டிருந்தாலும், சில திசுக்களில் சவால்களை எதிர்கொள்கிறது, அங்கு ஒற்றை செல் இடைநீக்கத்தை உருவாக்குவது கடினம் மற்றும் புதிய மாதிரிகள் தேவைப்படுகின்றன. BMKGene இல், அதிநவீன 10X ஜெனோமிக்ஸ் குரோமியம் தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி ஒற்றை-நியூக்ளியஸ் RNA வரிசைமுறையை (snRNA-seq) வழங்குவதன் மூலம் இந்தத் தடையை நாங்கள் நிவர்த்தி செய்கிறோம். இந்த அணுகுமுறை ஒற்றை செல் அளவில் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்விற்கு ஏற்ற மாதிரிகளின் நிறமாலையை விரிவுபடுத்துகிறது.
புதுமையான 10X ஜெனோமிக்ஸ் குரோமியம் சிப் மூலம் கருக்களின் தனிமைப்படுத்தல் நிறைவேற்றப்படுகிறது, இதில் இரட்டை குறுக்குவெட்டுகளுடன் எட்டு சேனல் மைக்ரோஃப்ளூய்டிக்ஸ் அமைப்பு உள்ளது. இந்த அமைப்பிற்குள், பார்கோடுகள், ப்ரைமர்கள், என்சைம்கள் மற்றும் ஒரு ஒற்றை உட்கருவை உள்ளடக்கிய ஜெல் மணிகள் நானோலிட்டர் அளவிலான எண்ணெய் துளிகளில் இணைக்கப்பட்டு, ஜெல் பீட்-இன்-எமல்ஷன் (ஜிஇஎம்) உருவாகிறது. GEM உருவானதைத் தொடர்ந்து, ஒவ்வொரு GEM லும் செல் சிதைவு மற்றும் பார்கோடு வெளியீடு நிகழ்கிறது. பின்னர், mRNA மூலக்கூறுகள் 10X பார்கோடுகள் மற்றும் தனித்த மூலக்கூறு அடையாளங்காட்டிகள் (UMIs) ஆகியவற்றை உள்ளடக்கிய சிடிஎன்ஏக்களில் தலைகீழ் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கு உட்படுகின்றன. இந்த சிடிஎன்ஏக்கள் நிலையான வரிசைமுறை நூலகக் கட்டுமானத்திற்கு உட்படுத்தப்படுகின்றன, இது ஒற்றை செல் அளவில் மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரங்களின் வலுவான மற்றும் விரிவான ஆய்வுக்கு உதவுகிறது.
இயங்குதளம்: 10× ஜீனோமிக்ஸ் குரோமியம் மற்றும் இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம்
-
10x ஜெனோமிக்ஸ் விசியம் ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்
ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் என்பது ஒரு அதிநவீன தொழில்நுட்பமாகும், இது திசுக்களுக்குள் மரபணு வெளிப்பாடு வடிவங்களை அவற்றின் இடஞ்சார்ந்த சூழலைப் பாதுகாக்கும் போது ஆராய ஆராய்ச்சியாளர்களை அனுமதிக்கிறது. இந்த டொமைனில் உள்ள ஒரு சக்திவாய்ந்த இயங்குதளம் 10x ஜெனோமிக்ஸ் விசியம் மற்றும் இல்லுமினா சீக்வென்சிங் ஆகும். 10X Visium இன் கொள்கையானது, திசுப் பிரிவுகள் வைக்கப்படும் ஒரு நியமிக்கப்பட்ட பிடிப்புப் பகுதியுடன் ஒரு சிறப்பு சிப்பில் உள்ளது. இந்த பிடிப்பு பகுதியில் பார்கோடு இடப்பட்ட புள்ளிகள் உள்ளன, ஒவ்வொன்றும் திசுவிற்குள் ஒரு தனித்துவமான இடஞ்சார்ந்த இடத்துடன் தொடர்புடையது. திசுவில் இருந்து கைப்பற்றப்பட்ட ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகள், தலைகீழ் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் செயல்பாட்டின் போது தனித்துவமான மூலக்கூறு அடையாளங்காட்டிகளுடன் (UMIகள்) பெயரிடப்படுகின்றன. இந்த பார்கோடு செய்யப்பட்ட புள்ளிகள் மற்றும் UMI கள் ஒரு செல் தீர்மானத்தில் துல்லியமான இடஞ்சார்ந்த மேப்பிங் மற்றும் மரபணு வெளிப்பாட்டின் அளவை செயல்படுத்துகின்றன. இடஞ்சார்ந்த பார்கோடு செய்யப்பட்ட மாதிரிகள் மற்றும் UMIகளின் கலவையானது உருவாக்கப்பட்ட தரவின் துல்லியம் மற்றும் தனித்துவத்தை உறுதி செய்கிறது. இந்த ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம், உயிரணுக்களின் இடஞ்சார்ந்த அமைப்பு மற்றும் திசுக்களுக்குள் நிகழும் சிக்கலான மூலக்கூறு இடைவினைகள் பற்றிய ஆழமான புரிதலை ஆராய்ச்சியாளர்கள் பெற முடியும், புற்றுநோயியல், நரம்பியல், வளர்ச்சி உயிரியல், நோயெதிர்ப்பு உள்ளிட்ட பல துறைகளில் உயிரியல் செயல்முறைகளின் அடிப்படையிலான வழிமுறைகள் பற்றிய விலைமதிப்பற்ற நுண்ணறிவுகளை வழங்குகிறது. , மற்றும் தாவரவியல் ஆய்வுகள்.
இயங்குதளம்: 10X ஜெனோமிக்ஸ் விசியம் மற்றும் இல்லுமினா நோவாசெக்
