-
ஒப்பீட்டு மரபியல்
ஒப்பீட்டு மரபியல் என்பது பல்வேறு உயிரினங்களுக்கிடையில் முழு மரபணு வரிசைகள் மற்றும் கட்டமைப்புகளின் ஆய்வு மற்றும் ஒப்பீடு ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியது. இந்த புலமானது இனங்களின் பரிணாமத்தை வெளிப்படுத்தவும், மரபணு செயல்பாடுகளை குறியீடாக்கவும் மற்றும் பல்வேறு உயிரினங்கள் முழுவதும் பாதுகாக்கப்பட்ட அல்லது வேறுபட்ட வரிசை கட்டமைப்புகள் மற்றும் கூறுகளை அடையாளம் காண்பதன் மூலம் மரபணு ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகளை தெளிவுபடுத்த முயல்கிறது. ஒரு விரிவான ஒப்பீட்டு மரபியல் ஆய்வு, மரபணு குடும்பங்கள், பரிணாம வளர்ச்சி, முழு-மரபணு நகல் நிகழ்வுகள் மற்றும் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட அழுத்தங்களின் தாக்கம் போன்ற பகுப்பாய்வுகளை உள்ளடக்கியது.
-
பரிணாம மரபியல்
மக்கள்தொகை மற்றும் பரிணாம மரபணு பகுப்பாய்வு தளம் பல ஆண்டுகளாக BMK R&D குழுவில் திரட்டப்பட்ட பாரிய அனுபவத்தின் அடிப்படையில் நிறுவப்பட்டது. குறிப்பாக பயோ இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸில் அதிகம் தேர்ச்சி பெறாத ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு இது ஒரு பயனர் நட்புக் கருவியாகும். இந்த தளமானது ஃபைலோஜெனடிக் மர கட்டுமானம், இணைப்பு சமநிலையின்மை பகுப்பாய்வு, மரபணு பன்முகத்தன்மை மதிப்பீடு, தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட ஸ்வீப் பகுப்பாய்வு, உறவினர் பகுப்பாய்வு, பிசிஏ, மக்கள்தொகை கட்டமைப்பு பகுப்பாய்வு போன்ற அடிப்படை பரிணாம மரபியல் தொடர்பான அடிப்படை பகுப்பாய்வுகளை செயல்படுத்துகிறது.
-
ஹை-சி அடிப்படையிலான ஜீனோம் அசெம்பிளி
ஹை-சி என்பது குரோமோசோம் உள்ளமைவைப் பிடிக்க வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு முறையாகும். இந்த இடைவினைகளின் தீவிரம் குரோமோசோம்களில் உள்ள உடல் தூரத்துடன் எதிர்மறையாக தொடர்புடையதாக நம்பப்படுகிறது. எனவே, ஹை-சி தரவு ஒரு வரைவு மரபணுவில் கூடியிருந்த வரிசைகளின் கிளஸ்டரிங், வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் நோக்குநிலை ஆகியவற்றை வழிகாட்டவும், குறிப்பிட்ட எண்ணிக்கையிலான குரோமோசோம்களில் அவற்றைத் தொகுக்கவும் பயன்படுத்தப்படுகிறது. மக்கள்தொகை அடிப்படையிலான மரபணு வரைபடம் இல்லாத நிலையில், இந்த தொழில்நுட்பம் குரோமோசோம் அளவிலான மரபணு கூட்டத்தை மேம்படுத்துகிறது. ஒவ்வொரு மரபணுவிற்கும் ஹை-சி தேவை.
-
தாவர/விலங்கு டி நோவோ ஜீனோம் வரிசைமுறை
டி நோவோவரிசைப்படுத்துதல் என்பது குறிப்பு மரபணு இல்லாத நிலையில், வரிசைமுறை தொழில்நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தி ஒரு இனத்தின் முழு மரபணுவின் கட்டுமானத்தைக் குறிக்கிறது. மூன்றாம் தலைமுறை வரிசைமுறையின் அறிமுகம் மற்றும் பரவலான தத்தெடுப்பு, நீண்ட வாசிப்புகளைக் கொண்டுள்ளது, வாசிப்புகளுக்கு இடையில் ஒன்றுடன் ஒன்று அதிகரிப்பதன் மூலம் மரபணு ஒருங்கிணைப்பை கணிசமாக மேம்படுத்தியுள்ளது. சவாலான மரபணுக்களைக் கையாளும் போது இந்த மேம்பாடு குறிப்பாக பொருத்தமானது, அதாவது உயர் ஹீட்டோரோசைகோசிட்டியை வெளிப்படுத்தும், மீண்டும் மீண்டும் வரும் பகுதிகளின் உயர் விகிதம், பாலிப்ளாய்டுகள் மற்றும் மீண்டும் மீண்டும் வரும் கூறுகள், அசாதாரண ஜிசி உள்ளடக்கங்கள் அல்லது அதிக சிக்கலான தன்மை கொண்ட பகுதிகள். தனியாக.
எங்களின் ஒரே-நிறுத்த தீர்வு ஒருங்கிணைந்த வரிசைமுறை சேவைகள் மற்றும் உயர்தர டி நோவோ அசெம்பிள்ட் மரபணுவை வழங்கும் உயிர் தகவல் பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை வழங்குகிறது. இல்லுமினாவுடனான ஆரம்ப மரபணு ஆய்வு மரபணு அளவு மற்றும் சிக்கலான மதிப்பீடுகளை வழங்குகிறது, மேலும் இந்தத் தகவல் PacBio HiFi உடன் நீண்ட-வாசிப்பு வரிசைமுறையின் அடுத்த கட்டத்திற்கு வழிகாட்டப் பயன்படுகிறது.டி நோவோகான்டிஜ்களின் கூட்டம். HiC அசெம்பிளியின் அடுத்தடுத்த பயன்பாடு, கான்டிஜ்களை மரபணுவுடன் இணைக்க உதவுகிறது, குரோமோசோம்-நிலை சட்டசபையைப் பெறுகிறது. இறுதியாக, மரபணு கணிப்பு மற்றும் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களை வரிசைப்படுத்துவதன் மூலம் சிறுகுறிப்பு செய்யப்படுகிறது, குறுகிய மற்றும் நீண்ட வாசிப்புகளுடன் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்களை நாடுகிறது.
-
மனித முழு எக்ஸோம் வரிசைமுறை
ஹ்யூமன் ஹோல் எக்ஸோம் சீக்வென்சிங் (hWES) என்பது நோயை உண்டாக்கும் பிறழ்வுகளைக் குறிப்பதற்கு செலவு குறைந்த மற்றும் சக்திவாய்ந்த வரிசைமுறை அணுகுமுறையாக பரவலாக ஒப்புக் கொள்ளப்படுகிறது. முழு மரபணுவில் சுமார் 1.7% மட்டுமே இருந்தாலும், மொத்த புரதச் செயல்பாடுகளின் சுயவிவரத்தை நேரடியாகப் பிரதிபலிப்பதன் மூலம் எக்ஸான்கள் முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன. குறிப்பிடத்தக்க வகையில், மனித மரபணுவில், 85% க்கும் அதிகமான நோய்கள் தொடர்பான பிறழ்வுகள் புரதக் குறியீட்டுப் பகுதிகளில் வெளிப்படுகின்றன. BMKGENE ஆனது பல்வேறு ஆராய்ச்சி இலக்குகளை அடைய இரண்டு வெவ்வேறு எக்ஸான் கேப்சரிங் உத்திகளுடன் கூடிய விரிவான மற்றும் நெகிழ்வான மனித முழு எக்ஸோம் சீக்வென்சிங் சேவையை வழங்குகிறது.
-
குறிப்பிட்ட-உள்ளூர் பெருக்கப்பட்ட துண்டு வரிசைமுறை (SLAF-Seq)
உயர்-செயல்திறன் மரபணு வகைப்படுத்தல், குறிப்பாக பெரிய அளவிலான மக்கள்தொகையில், மரபணு தொடர்பு ஆய்வுகளில் அடிப்படை படியாகும் மற்றும் செயல்பாட்டு மரபணு கண்டுபிடிப்பு, பரிணாம பகுப்பாய்வு போன்றவற்றுக்கு மரபணு அடிப்படையை வழங்குகிறது. ஆழமான முழு மரபணு மறு வரிசைப்படுத்தலுக்குப் பதிலாக,குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவ மரபணு வரிசைமுறை (RRGS)மரபணு மார்க்கர் கண்டுபிடிப்பில் நியாயமான செயல்திறனைப் பராமரிக்கும் அதே வேளையில் ஒரு மாதிரிக்கான வரிசைமுறை செலவைக் குறைக்க இந்த ஆய்வுகளில் பெரும்பாலும் பயன்படுத்தப்படுகிறது. RRGS டிஎன்ஏவை கட்டுப்படுத்தும் நொதிகளுடன் ஜீரணித்து ஒரு குறிப்பிட்ட துண்டு அளவு வரம்பில் கவனம் செலுத்துவதன் மூலம் இதை அடைகிறது, இதன் மூலம் மரபணுவின் ஒரு பகுதியை மட்டுமே வரிசைப்படுத்துகிறது. பல்வேறு RRGS முறைகளில், ஸ்பெசிஃபிக்-லோகஸ் ஆம்ப்ளிஃபைட் ஃபிராக்மென்ட் சீக்வென்சிங் (SLAF) என்பது தனிப்பயனாக்கக்கூடிய மற்றும் உயர்தர அணுகுமுறையாகும். BMKGene ஆல் சுயாதீனமாக உருவாக்கப்பட்ட இந்த முறை, ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் அமைக்கப்பட்டுள்ள கட்டுப்பாட்டு நொதியை மேம்படுத்துகிறது. இது கணிசமான எண்ணிக்கையிலான SLAF குறிச்சொற்களை (மரபணுவின் 400-500 பிபிஎஸ் பகுதிகள் வரிசைப்படுத்தப்பட்டுள்ளது) உருவாக்குவதை உறுதி செய்கிறது, அவை மரபணு முழுவதும் ஒரே மாதிரியாக விநியோகிக்கப்படுகின்றன, அதே நேரத்தில் மீண்டும் மீண்டும் வரும் பகுதிகளைத் திறம்பட தவிர்க்கின்றன, இதனால் சிறந்த மரபணு மார்க்கர் கண்டுபிடிப்புக்கு உறுதியளிக்கிறது.
-
இல்லுமினா முன் தயாரிக்கப்பட்ட நூலகங்கள்
இலுமினா சீக்வென்சிங் டெக்னாலஜி, சீக்வென்சிங் பை சின்தசிஸ் (SBS) அடிப்படையிலானது, இது உலகளவில் ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட NGS கண்டுபிடிப்பு ஆகும், இது உலகின் 90% க்கும் மேற்பட்ட வரிசைமுறை தரவுகளை உருவாக்குவதற்கு பொறுப்பாகும். SBS இன் கொள்கையானது, ஒவ்வொரு dNTP சேர்க்கப்படும்போதும், ஃப்ளோரசன்ட் லேபிளிடப்பட்ட ரிவர்சிபிள் டெர்மினேட்டர்களை இமேஜிங் செய்வதையும், பின்னர் அடுத்த தளத்தை இணைக்க அனுமதிக்கும் வகையில் பிளவுபடுத்துவதையும் உள்ளடக்கியது. ஒவ்வொரு வரிசைமுறை சுழற்சியிலும் நான்கு ரிவர்சிபிள் டெர்மினேட்டர்-பிவுண்ட் டிஎன்டிபிகள் இருப்பதால், இயற்கையான போட்டி ஒருங்கிணைப்பு சார்புகளைக் குறைக்கிறது. இந்த பல்துறை தொழில்நுட்பம் ஒற்றை-வாசிப்பு மற்றும் ஜோடி-இறுதி நூலகங்களை ஆதரிக்கிறது, இது மரபணு பயன்பாடுகளின் வரம்பிற்கு உதவுகிறது. இலுமினா சீக்வென்சிங்கின் உயர்-செயல்திறன் திறன்கள் மற்றும் துல்லியமானது மரபணு ஆராய்ச்சியில் ஒரு மூலக்கல்லாக நிலைநிறுத்துகிறது, ஒப்பிடமுடியாத விவரங்கள் மற்றும் செயல்திறனுடன் மரபணுக்களின் நுணுக்கங்களை அவிழ்க்க விஞ்ஞானிகளுக்கு அதிகாரம் அளிக்கிறது.
எங்கள் முன் தயாரிக்கப்பட்ட நூலக வரிசைப்படுத்தல் சேவையானது வாடிக்கையாளர்களுக்கு பல்வேறு மூலங்களிலிருந்து (mRNA, முழு ஜீனோம், ஆம்ப்ளிகான், 10x நூலகங்கள் மற்றும் பிறவற்றிலிருந்து) வரிசைப்படுத்தும் நூலகங்களைத் தயாரிக்க உதவுகிறது. பின்னர், இந்த நூலகங்கள் தரக் கட்டுப்பாடு மற்றும் இல்லுமினா இயங்குதளங்களில் வரிசைப்படுத்துவதற்காக எங்கள் வரிசைப்படுத்தல் மையங்களுக்கு அனுப்பப்படும்.
