பசிபிக் பயோசயின்சஸ் (PACBIO) ஐசோஃபார்ம் வரிசைமுறை தரவை உள்ளீடாக எடுத்துக் கொண்டால், இந்த பயன்பாடு முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்ட் காட்சிகளை (சட்டசபை இல்லாமல்) அடையாளம் காண முடியும். குறிப்பு மரபணுவுக்கு எதிராக முழு நீள வரிசைகளை வரைபடமாக்குவதன் மூலம், டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களை அறியப்பட்ட மரபணுக்கள், டிரான்ஸ்கிரிப்டுகள், குறியீட்டு பகுதிகள் போன்றவற்றால் மேம்படுத்தலாம். இந்த விஷயத்தில், மாற்று பிளவு போன்ற எம்.ஆர்.என்.ஏ கட்டமைப்புகளை மிகவும் துல்லியமாக அடையாளம் காண முடியும். என்ஜிஎஸ் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை தரவுகளுடன் கூட்டு பகுப்பாய்வு டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மட்டத்தில் வெளிப்பாட்டில் மிகவும் விரிவான சிறுகுறிப்பு மற்றும் மிகவும் துல்லியமான அளவீட்டை செயல்படுத்துகிறது, இது பெரும்பாலும் கீழ்நிலை வேறுபாடு வெளிப்பாடு மற்றும் செயல்பாட்டு பகுப்பாய்விற்கு பயனளிக்கிறது.