Pacbio முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்

PacBio முழு-நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங், Isoseq, டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஐசோஃபார்ம்களின் துல்லியமான அடையாளத்தை செயல்படுத்துகிறது, மாற்று பாலிடெனிலேஷன் மற்றும் பிளவுபடுத்துதல் மற்றும் மிகவும் துல்லியமான மரபணு வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வுக்கு வழிவகுக்கிறது. BMKCloud PacBio முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பைப்லைன், CDNA லைப்ரரிகளை சர்குலர் கான்சென்சஸ் சீக்வென்சிங் (CCS) முறையில் வரிசைப்படுத்துவதற்காக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது மற்றும் முழு-நீள நான்-கிமெரிக் (FLNC) வரிசைகளை அடையாளம் காட்டுகிறது, அவை தேவையற்ற டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளாக தொகுக்கப்படுகின்றன. ஒரு அடுத்தடுத்த BUSCO பகுப்பாய்வு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளியின் முழுமையை மதிப்பிடுகிறது. அசெம்பிள் செய்யப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்டோமில் இருந்து, பல பகுப்பாய்வுகள் செய்யப்படுகின்றன: மாற்று பிளவு, சிம்பிள் சீக்வென்ஸ் ரிப்பீட் (எஸ்எஸ்ஆர்), எல்என்சிஆர்என்ஏ மற்றும் அதனுடன் தொடர்புடைய இலக்கு மரபணுக்களின் கணிப்பு, நாவல் மரபணுக்களின் கணிப்பு, மரபணு குடும்ப பகுப்பாய்வு, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி பகுப்பாய்வு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு.