குறிப்பு அல்லாத அடிப்படையிலான mRNA வரிசைமுறை-NGS
அம்சங்கள்
● நூலகத்தைத் தயாரிப்பதற்கு முன் பாலி எம்ஆர்என்ஏவைப் பிடிக்கவும்
● எந்த குறிப்பு மரபணுவையும் சாராதது: டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களின் டி நோவோ அசெம்பிளியின் அடிப்படையில், பல தரவுத்தளங்களுடன் (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG) சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்ட யூனிஜீன்களின் பட்டியலை உருவாக்குதல்
● மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் கட்டமைப்பின் விரிவான உயிர் தகவல் பகுப்பாய்வு
சேவை நன்மைகள்
●விரிவான நிபுணத்துவம்: BMKGENE இல் 600,000 க்கும் மேற்பட்ட மாதிரிகளைச் செயலாக்கியதன் சாதனைப் பதிவுடன், செல் கலாச்சாரங்கள், திசுக்கள் மற்றும் உடல் திரவங்கள் போன்ற பல்வேறு மாதிரி வகைகளில் பரவி, எங்கள் குழு ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் அனுபவச் செல்வத்தைக் கொண்டு வருகிறது. பல்வேறு ஆராய்ச்சி களங்களில் 100,000 mRNA-Seq திட்டங்களை வெற்றிகரமாக மூடிவிட்டோம்.
●கடுமையான தரக் கட்டுப்பாடு: மாதிரி மற்றும் நூலக தயாரிப்பு முதல் வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் உயிர் தகவலியல் வரை அனைத்து நிலைகளிலும் முக்கிய கட்டுப்பாட்டு புள்ளிகளை நாங்கள் செயல்படுத்துகிறோம். இந்த உன்னிப்பான கண்காணிப்பு நிலையான உயர்தர முடிவுகளை வழங்குவதை உறுதி செய்கிறது.
● விரிவான சிறுகுறிப்பு: டிஃபெரன்ஷியலி எக்ஸ்பிரஸ்டு ஜீன்களை (DEGs) செயல்பாட்டு ரீதியாக சிறுகுறிப்பு செய்வதற்கும், அதற்குரிய செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வைச் செய்வதற்கும் பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம்.
●விற்பனைக்கு பிந்தைய ஆதரவு: எங்கள் அர்ப்பணிப்பு 3-மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் திட்ட நிறைவுக்கு அப்பால் நீண்டுள்ளது. இந்த நேரத்தில், முடிவுகள் தொடர்பான ஏதேனும் கேள்விகளுக்குத் தீர்வு காண திட்டப் பின்தொடர்தல், சரிசெய்தல் உதவி மற்றும் கேள்விபதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
மாதிரி தேவைகள் மற்றும் விநியோகம்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி | தரவு பரிந்துரைக்கப்படுகிறது | தரக் கட்டுப்பாடு |
| பாலி ஏ செறிவூட்டப்பட்டது | இல்லுமினா PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 ஜிபி | Q30≥85% |
மாதிரி தேவைகள்:
நியூக்ளியோடைடுகள்:
| Conc.(ng/μl) | தொகை (μg) | தூய்மை | நேர்மை |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 வரையறுக்கப்பட்ட அல்லது புரதம் அல்லது டிஎன்ஏ மாசுபாடு ஜெல் மீது காட்டப்படவில்லை. | தாவரங்களுக்கு: RIN≥4.0; விலங்குகளுக்கு: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; வரையறுக்கப்பட்ட அல்லது அடிப்படை உயரம் இல்லை |
● தாவரங்கள்:
வேர், தண்டு அல்லது இதழ்: 450 மி.கி
இலை அல்லது விதை: 300 மி.கி
பழம்: 1.2 கிராம்
● விலங்கு:
இதயம் அல்லது குடல்: 300 மி.கி
உள்ளுறுப்பு அல்லது மூளை: 240 மி.கி
தசை: 450 மி.கி
எலும்புகள், முடி அல்லது தோல்: 1 கிராம்
● கணுக்காலிகள்:
பூச்சிகள்: 6 கிராம்
க்ரஸ்டேசியா: 300 மி.கி
● முழு இரத்தம்: 1 குழாய்
● கலங்கள்: 106 செல்கள்
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
கொள்கலன்: 2 மில்லி மையவிலக்கு குழாய் (தகரம் படலம் பரிந்துரைக்கப்படவில்லை)
மாதிரி லேபிளிங்: குழு+பிரதி எ.கா. A1, A2, A3; பி1, பி2, பி3.
ஏற்றுமதி:
1. உலர்-பனி: மாதிரிகளை பைகளில் அடைத்து உலர்-பனியில் புதைக்க வேண்டும்.
2. ஆர்என்ஏ ஸ்டேபிள் குழாய்கள்: ஆர்என்ஏ மாதிரிகளை ஆர்என்ஏ உறுதிப்படுத்தல் குழாயில் உலர்த்தலாம் (எ.கா. ஆர்என்ஏஸ்டேபிள்®) மற்றும் அறை வெப்பநிலையில் அனுப்பப்படும்.
சேவை வேலை ஓட்டம்
சோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
ஆர்என்ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
உயிர் தகவலியல்
டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளி மற்றும் யூனிஜீன் தேர்வு
யுனிஜீன் சிறுகுறிப்பு
உயிரியல் பிரதிகளின் மாதிரி தொடர்பு மற்றும் மதிப்பீடு
வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள் (DEGs)
DEG களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு
DEG களின் செயல்பாட்டு செறிவூட்டல்
BMKGene இன் யூகாரியோடிக் என்ஜிஎஸ் எம்ஆர்என்ஏ வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளால் எளிதாக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் முன்னேற்றங்களை ஆராயுங்கள்.
ஷென், எஃப். மற்றும் பலர். (2020) 'டி நோவோ டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளி மற்றும் செக்ஸ்-பேஸ்டு ஜீன் எக்ஸ்பிரஷன் இன் தி கோனாட்ஸ் ஆஃப் அமுர் கேட்ஃபிஷ் (சிலூரஸ் அசோடஸ்)', ஜெனோமிக்ஸ், 112(3), பக். 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
ஜாங், சி. மற்றும் பலர். (2016) 'வெங்காயத்தில் பல்ப் வீக்கம் மற்றும் வளர்ச்சியின் போது சுக்ரோஸ் வளர்சிதை மாற்றத்தின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு (அல்லியம் செபா எல்.)', தாவர அறிவியலில் எல்லைகள், 7(செப்டம்பர்), ப. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
ஜு, சி. மற்றும் பலர். (2017) 'டி நோவோ அசெம்பிளி, கேரக்டரைசேஷன் அண்ட் நோட்டேஷன் ஆஃப் தி டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் ஆஃப் சர்கோசீலிச்திஸ் சினென்சிஸ்', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
ஜூ, எல். மற்றும் பலர். (2021) 'டி நோவோ டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு, உப்புத்தன்மை அழுத்தத்தின் கீழ் போடோகார்பஸ் மேக்ரோஃபில்லஸின் உப்பு சகிப்புத்தன்மை பற்றிய நுண்ணறிவுகளை வழங்குகிறது', BMC தாவர உயிரியல், 21(1), பக். 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
