mRNA-seq (NGS) - டி நோவோ

mRNA வரிசைமுறையானது குறிப்பிட்ட நிலைமைகளின் கீழ் செல்களில் உள்ள அனைத்து mRNA டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளின் விவரக்குறிப்பை அனுமதிக்கிறது மற்றும் இது பல்வேறு ஆராய்ச்சிப் பகுதிகளில் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் தொழில்நுட்பமாகும். BMKCloud De novo mRNA-seq பைப்லைன் பாலி-A செறிவூட்டப்பட்ட வரிசைமுறை நூலகங்களை எந்த குறிப்பு மரபணுவும் கிடைக்காதபோது பகுப்பாய்வு செய்ய வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. பைப்லைன் தரக் கட்டுப்பாட்டுடன் தொடங்குகிறது, அதைத் தொடர்ந்துடி நோவோடிரான்ஸ்கிரிப்ட் அசெம்பிளி மற்றும் யுனிஜீன் செட் தேர்வு. யூனிஜீன் கட்டமைப்பு பகுப்பாய்வு குறியீட்டு வரிசை (சிடிஎஸ்) மற்றும் எளிய வரிசை மறுநிகழ்வுகள் (எஸ்எஸ்ஆர்) கணிக்கப்படுகிறது. பின்னர், வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு, சோதனை செய்யப்பட்ட நிலைகளில் வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களை (DEG கள்) கண்டறிந்தது, அதைத் தொடர்ந்து உயிரியல் நுண்ணறிவுகளைப் பிரித்தெடுக்க DEG களின் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல்.